Автобиография
, 1963 года рождения, в 1985 году окончил Московский государственный университет им. по специальности «Физиология». В 1986 году начал работать в Институте Биоорганической Химии в должности стажера-исследователя. С 1988 по 1998 год работал в Лаборатории структуры и функции генов человека, сначала в должности младшего научного сотрудника, затем в должности научного сотрудника и старшего научного сотрудника. С 1998 г. возглавляет лабораторию молекулярных технологий (ранее лборатория генов регенерации). С 2007 года возглавляет научно-техническое подразделение «Технопарк ИБХ». С 27 августа 2012 года так же занимает должность помощника министра в министерстве Здравоохранения Российской Федерации.
В 1994 году защитил кандидатскую диссертацию по теме «Клонирование нового нейроспецифического гомеобоксного гена XANF-1 и анализ его экспрессии в ходе раннего эмбриогенеза шпорцевой лягушки», выполненную в лаборатории структуры и функции генов человека (научный руководитель - академик РАН, доктор химических наук ).
Докторскую диссертацию по теме «Селективная супрессия полимеразной цепной реакции – новый подход к анализу структуры и экспрессии сложных геномов» (научный консультант - академик РАН, доктор химических наук ), выполненную в ИБХ РАН, защитил в 1999 году.
В 2003 году был избран членом-корреспондентом Российской академии наук, а в 2011 году – академиком РАН.
С 2009 г. читает курс лекций на кафедре молекулярной биологии биологического факультета МГУ, а с 2010 г. – так же в Российской государственной медицинской академии.
– ведущий ученый в области молекулярной биологии и генной инженерии. Выполненные под его руководством работы по открытию флуоресцентных белков коралловых полипов, созданию технологии фотоактивируемых флуоресцентных белков, а так же создание генетически кодируемого фотосенсибилизатора были отмечены в числе главных достижений Российской академии наук в области физико-химической биологии за 1999, 2003 и 2005 гг., соответственно.
опубликовано более 140 научных работ в отечественных и зарубежных журналах. Работы широко цитируется в научной литературе (более 9000 цитирований, индекс Хирша 41).
является лауреатом премии Российской академии наук имени академика за выдающиеся работы в области физико-химической биологии и биотехнологии за 2006 год за работу «Флуоресцентные белки: поиск, исследование и применение в биотехнологии», премий Международной академической издательской компании “Наука” за лучшую публикацию в издаваемых ею журналах за 1996, 1999 и 2004 г. г., победителем конкурсов журнала Биоорганическая Химия на лучшую статью года за 1996, 1997, 1999, 2002, 2003, 2004 и 2005 г. г.
30.08.2012
Сведения о научной (научно-организационной) работе за гг.
Список трудов:
Публикации в рецензируемых журналах
1. Yampolsky IV, Kislukhin AA, Amatov TT, Shcherbo D, Potapov VK, Lukyanov S, Lukyanov KA. Synthesis and properties of the red chromophore of the green-to-red photoconvertible fluorescent protein Kaede and its analogs. Bioorg. Chem. 2008, 36, 96-104.
2. Bogdanova EA, Shagin DA, Lukyanov SA. Normalization of full-length enriched cDNA. Mol Biosyst. 2008 Mar;4(3):205-12.
3. Anisimova VE., Rebrikov DV., Shagin DA., Kozhemyako VB., Menzorova NI., Staroverov DB., Ziganshin R, Vagner LL., Rasskazov VA., Lukyanov SA and Shcheglov AS. Isolation, characterization and molecular cloning of Duplex-Specific Nuclease from the hepatopancreas of the Kamchatka crab BMC Biochemistry, 2008, 9:14.
4. Anisimova VE, Shcheglov AS, Bogdanova EA, Rebrikov DV, Nekrasov AN, Barsova EV, Shagin DA, Lukyanov SA. Is crab duplex-specific nuclease a member of the Serratia family of non-specific nucleases? Gene. 2008 Jul 15;418(1-2):41-48.
5. Panchin AY, Spirin SA, Lukyanov SA, Lebedev YB, Panchin YV. Human trash ESTs-sequences from cDNA collection that are not aligned to genome assembly. J Bioinform Comput Biol. 2008 Aug;6(4):759-73.
6. Shcherbo D., Murphy CS., Ermakova GV., Solovieva EA., Chepurnykh TV., Shcheglov AS., Verkhusha VV., Pletnev VZ., Hazelwood KL., Roche PM., Lukyanov S, Zaraisky AG., Davidson MW., Chudakov DM. Far-red fluorescent tags for protein imaging in living tissues Biochemical journal, Mar 15;418(3):567-74.
7. Bogdanova EA, Shagina IA, Mudrik E, Ivanov I, Amon P, Vagner LL, Lukyanov SA, Shagin DA. DSN Depletion is a Simple Method to Remove Selected Transcripts from cDNA Populations. Mol Biotechnol. 2009 Mar;41(3):247-53.
8. Anisimova VE., Barsova EV., Bogdanova EA., Lukyanov SA., Shcheglov AS. Thermolabile duplex-specific nuclease Biotechnol Lett. 2009 Feb;31(2):251-257.
9. Shcherbo D, Souslova EA, Goedhart J, Chepurnykh TV, Gaintzeva A, Shemyakina II, Gadella TW J, Lukyanov S and Chudakov DM. Practical and reliable FRET/FLIM pair of fluorescent proteins BMC Biotechnology 2009, 9:24 .
10. Bogdanov AM, Mishin AS, Yampolsky IV, Belousov VV, Chudakov DM, Subach FV., Verkhusha VV, Lukyanov S and KA Lukyanov Green fluorescent proteins are light-induced electron donors. Nat. Chem Biol., 2009 Apr 26;5(7):459-461.
11. Bogdanov AM, Bogdanova EA, Chudakov DM, Gorodnicheva TV, Lukyanov S, Lukyanov KA. Cell culture medium affects GFP photostability: a solution. Nat Methods. 2009 Dec;6(12):859-60.
12. Teh C, Chudakov DM, Poon KL, Mamedov IZ, Sek JY, Shidlovsky K, Lukyanov S, Korzh V. Optogenetic in vivo cell manipulation in KillerRed-expressing zebrafish transgenics. BMC Dev Biol. 2010 Nov 2;10:110.
13. Zvyagin IV, Mamedov IZ, Britanova OV, Staroverov DB, Nasonov EL, Bochkova AG, Chkalina AV, Kotlobay AA, Korostin DO, Rebrikov DV, Lukyanov S, Lebedev YB, Chudakov DM. Contribution of functional KIR3DL1 to ankylosing spondylitis. Cell Mol Immunol. 2010 Nov;7(6):471-6.
14. Lukyanov KA, Serebrovskaya EO, Lukyanov S, Chudakov DM. Fluorescent proteins as light-inducible photochemical partners. Photochem Photobiol Sci. 2010 Oct 28;9(10):.
15. Chudakov DM, Matz MV, Lukyanov S, Lukyanov KA. Fluorescent proteins and their applications in imaging living cells and tissues. Physiol Rev. 2010 Jul;90(3):1103-63.
16. Subach FV, Zhang L, Gadella TW, Gurskaya NG, Lukyanov KA, Verkhusha VV. Red fluorescent protein with reversibly photoswitchable absorbance for photochromic FRET. Chem Biol. 2010 Jul 30;17(7):745-55.
17. Shagina I, Bogdanova E, Mamedov IZ, Lebedev Y, Lukyanov S, Shagin D. Normalization of genomic DNA using duplex-specific nuclease. Biotechniques. 2010 Jun;48(6):455-9.
18. Markvicheva KN, Bilan DS, Mishina NM, Gorokhovatsky AY, Vinokurov LM, Lukyanov S, Belousov VV. A genetically encoded sensor for H2O2 with expanded dynamic range. Bioorg Med Chem. 2011 Feb 1;19(3):1079-84.
19. Wang Q, Byrnes LJ, Shui B, Röhrig UF, Singh A, Chudakov DM, Lukyanov S, Zipfel WR, Kotlikoff MI, Sondermann H. Molecular Mechanism of a Green-Shifted, pH-Dependent Red Fluorescent Protein mKate Variant. PLoS One. 2011;6(8):e23513.
20. Shui B, Wang Q, Lee F, Byrnes LJ, Chudakov DM, Lukyanov SA, Sondermann H, Kotlikoff MI. Circular permutation of red fluorescent proteins. PLoS One. 2011;6(5):e20505.
21. Ivashkin PE, Lukyanov KA, Lukyanov S, Yampolsky IV. A synthetic GFP-like chromophore undergoes base-catalyzed autoxidation into acylimine red form. J Org Chem. 2011 Apr 15;76(8):2782-91.
22. Mamedov IZ, Britanova OV, Bolotin DA, Chkalina AV, Staroverov DB, Zvyagin IV, Kotlobay AA, Turchaninova MA, Fedorenko DA, Novik AA, Sharonov GV, Lukyanov S, Chudakov DM, Lebedev YB. Quantitative tracking of T cell clones after haematopoietic stem cell transplantation. EMBO Mol Med. 2011 Apr;3(4):201-207.
23. Korzh V, Teh C, Kondrychyn I, Chudakov DM, Lukyanov S. Visualizing compound transgenic zebrafish in development: a tale of green fluorescent protein and KillerRed. Zebrafish. 2011 Mar;8(1):23-29.
24. Serebrovskaya EO, Gorodnicheva TV, Ermakova GV, Solovieva EA, Sharonov GV, Zagaynova EV, Chudakov DM, Lukyanov S, Zaraisky AG, Lukyanov KA. Light-induced blockage of cell division with a chromatin-targeted phototoxic fluorescent protein. Biochem J. 2011 Apr 1;435(1):65-71.
25. Mishina NM, Tyurin-Kuzmin PA, Markvicheva KN, Vorotnikov AV, Tkachuk VA, Laketa V, Schultz C, Lukyanov S, Belousov VV. Does cellular hydrogen peroxide diffuse or act locally? Antioxid Redox Signal. 2011 Jan 1;14(1):1-7.
26. , , , Использование дуплекс-специфической нуклеазы краба для быстрого анализа однонуклеотидных полиморфизмов и выявления ДНК-мишеней в комплексном продукте ПЦР Биоорг. химия 2011,: 522-529.
27. Shirmanova MV, Serebrovskaya EO, Lukyanov KA, Snopova LB, Sirotkina MA, Prodanetz NN, Bugrova ML, Minakova EA, Turchin IV, Kamensky VA, Lukyanov SA, Zagaynova EV. Phototoxic effects of fluorescent protein KillerRed on tumor cells in mice. J Biophotonics. 2012 Jun 13. doi: 10.1002/jbio..
28. Britanova OV, Bochkova AG, Staroverov DB, Fedorenko DA, Bolotin DA, Mamedov IZ, Turchaninova MA, Putintseva EV, Kotlobay AA, Lukyanov S, Novik AA, Lebedev YB, Chudakov DM. First autologous hematopoietic SCT for ankylosing spondylitis: a case report and clues to understanding the therapy. Bone Marrow Transplant. 2012 Mar 12. doi: 10.1038/bmt.2012.44.
29. Mishina NM, Bogeski I, Bolotin DA, Hoth M, Niemeyer BA, Schultz C, Zagaynova EV, Lukyanov S, Belousov VV. Can We See PIP(3) and Hydrogen Peroxide with a Single Probe? Antioxid Redox Signal. 2012 Aug 1;17(3):505-12.
Статьи в научных сборниках и периодических научных изданиях
Markvicheva KN, Bogdanova EA, Staroverov DB., Lukyanov S, and Belousov VV. Imaging of Intracellular Hydrogen Peroxide Production With HyPer Upon Stimulation of HeLa Cells With Epidermal Growth Factor Methods in Molecular Biol. Methods Mol Biol. 2009;476:76-83.2. Bogdanov EA, Shagina I, Barsova EV, Kelmanson I, Shagin DA, Lukyanov SA. Normalizing cDNA libraries. Curr Protoc Mol Biol. 2010 Apr; Chapter 5:Unit 5.12.1-27.
3. Bogdanova EA, Barsova EV, Shagina IA, Scheglov A, Anisimova V, Vagner LL, Lukyanov SA, Shagin DA. Normalization of full-length-enriched cDNA. Methods Mol Biol. 2011;729:85-98.
Патенты
1. Lukyanov S., Fradkov A., Labas Y., Matz M., Terskikh A. Nucleic acids encoding chromophores/fluorophores and methods for using the same US Patent № 7,442,522 (October 28, 2008).
2. Lukyanov S., Fradkov A., Labas Y., Matz M., Terskikh A. Nucleic acids encoding chromophores/fluorophores and methods for using the same US Patent № 7,338,784 (March 4, 2008).
3. Lukyanov S., Fradkov A., Labas Y., Matz M., Terskikh A. Nucleic acids encoding chromophores/fluorophores and methods for using the same US Patent № 7,338,785 (March 4, 2008).
4. Lukyanov S., Fradkov A., Labas Y., Matz M., Terskikh A. Nucleic acids encoding chromophores/fluorophores and methods for using the same US Patent № 7,344,862 (March 18, 2008).
5. Lukyanov S., Fradkov A., Labas Y., Matz M., Terskikh A. Nucleic acids encoding chromophores/fluorophores and methods for using the same US Patent № 7,442,521 (October 28, 2008).
6. Gurskaya N., Fradkov A., Lukyanov S, Punkova N. Fluorescent proteins from Aequorea coerulscens and methods for using the same. US Patent № 7,432,.
7. Lukyanov S. Modified green fluorescent proteins and methods for using same US Patent № 7,417,.
8. Lukyanov S., Rebrikov D., Shagin D. Methods and compositions for selectively cleaving DNA containing duplex nucleic acids in a complex nucleic acid mixture, and nuclease compositions for use in practicing the same US Patent № 7,435,794 (October 14, 2008).
9. , , Флуоресцирующие белки и хромопротеины из видов Hydrozoa, не относящихся к aequorea, и способы их получения Патент РФ № 000.
10. Lukyanov S., Fradkov A., Labas Y., Matz M., Terskikh A. Nucleic acids encoding chromophores/fluorophores and methods for using the same US Patent № 7,537,915 (May 26, 2009).
11. Lukyanov S. Modified green fluorescent proteins and methods for using same US Patent № 7,605,.
12. , Флуоресцирующие белки из веслоногих ракообразных и способы их применения Патент РФ № 000.
13. Lukyanov S., Chudakov D. Novel fluorescent proteins and methods for using same US Patent № 7,638,.
14. Barsova E., Lukyanov S Fluorescent proteins from Copepoda species and methods for using same. US Patent № 7,678,893 (March 16, 2010).
15. Barsova E., Lukyanov S Fluorescent proteins from Copepoda species and methods for using same. Europe Patent № EP1576.
16. Gurskaya N., Fradkov A., Lukyanov S, Punkova N. Fluorescent proteins from Aequorea coerulscens and methods for using the same. US Patent № 7,667,.
17. Lukyanov S., Lukyanov K., Yanushevich Y., Savitsky A., Fradkov A. Non aggregating fluorescent proteins and methods for using the same US Patent №7,858,844 (December 28, 2010).
18. Gurskaya N., Fradkov A., Lukyanov S, Punkova N. Fluorescent proteins from Aequorea coerulscens and methods for using the same. Europe Patent № EP1485.
19. , , , Новые флуоресцирующие белки Aequorea coerulscens и способы их применения Патент РФ № 000.
20. Lukyanov S., Chudakov D. Novel fluorescent proteins and methods for using same Europe Patent № EP1994.
21. Lukyanov S., Rebrikov D., Shagin D. Methods and compositions for selectively cleaving DNA containing duplex nucleic acids in a complex nucleic acid mixture, and nuclease compositions for use in practicing the same US Patent № 7,803,922 (September 28, 2010).
22. Lukyanov S., Fradkov A., Lukyanov K., Gurskaya N. Nucleic acids encoding Stichodactylidae chromoproteins Europe Patent № EP1334.
23. Gurskaya N., Fradkov A., Lukyanov S, Punkova Fluorescent protein from Aequorea coerulescens and uses thereof Europe Patent № EP1485.
24. Gurskaya N., Fradkov A., Lukyanov S, Punkova N. Fluorescent proteins from Aequorea coerulscens and methods for using the same. US Patent № 7,879,988 (February 1, 2011).
25. Gurskaya N., Fradkov A., Lukyanov S, Punkova N. Fluorescent proteins from Aequorea coerulscens and methods for using the same. US Patent № 7,897,726 (March 1, 2011).
26. Lukyanov S., Shagin D., Yanushevich Y. Fluorescent proteins and chromoproteins from non-Aequorea hydrozoa species and methods for using same US Patent № 7,951,923 (May 31, 2011).
27. Lukyanov S. Modified green fluorescent proteins and methods for using same US Patent № 7,888,113 (February 15, 2011).
28. Lukyanov S., Fradkov A., Labas Y., Matz M., Terskikh A. Nucleic acids encoding chromophores/fluorophores and methods for using the same US Patent № 8,012,682 (September 6, 2011).
29. Lukyanov S., Shagin D., Yanushevich Y. Fluorescent proteins and chromoproteins from non-Aequorea hydrozoa species and methods for using same Europe Patent № EP1565.
30. Lukyanov S., Chudakov D. Modified fluorescent proteins and methods for using same US Patent № 7,972,834 (July 5, 2011).
Список грантов, научных контрактов и договоров, в выполнении которых участвовал претендент, с указанием его конкретной роли.
1. Шестая Рамочная программа Европейского сообщества LSHG-CT9, . Роль: исполнитель
2. NIH grant 5 R01-GM “Kindling fluorescent proteins for tagging and biosensors”. гг. Роль: исполнитель
3. РФФИ -офи «Разработка эффективных нанобиосенсоров для прижизненной регистрации внутриклеточных сигнальных молекул и активности ключевых ферментов». гг. Роль: руководитель
4. Грант Медицинского института Ховарда Хьюза № “Genetically encoded photosensitizers for light-induced cell killing and protein inactivation”, гг. Роль: руководитель
5. РФФИ -б «Развитие МТБ для проведения исследований по области знаний 04 - разработка и использование флуоресцентных белков и технологий с их применением для исследования процессов эмбриогенеза, канцерогенеза, иммунологических исследований, а также исследований роли оксида азота NO, кальция, и активных форм кислорода в этих процессах, анализа генной экпрессии в различных системах». 2008 г. Роль: исполнитель
6. НШ-2395.2008.4 «Структурный, функциональный и эволюционный анализ цис-регуляторных систем геномов про - и эукариот, включая человека. Развитие методических основ анализа и приложение его результатов в медицине и биотехнологии». гг. Роль: исполнитель
7. Грант программы «Молекулярная и клеточная биология». гг. Роль: руководитель
8. РФФИ -офи_м «Разработка технологий слежения за динамикой внутриклеточных процессов с помощью нанобиосенсоров». 2Роль: руководитель
9. договор на выполнение научно-исследовательских работ № 35-405/09 с АйПи». гг. Роль: руководитель
10. РФФИ -б «Развитие МТБ для проведения исследований по области знаний 04, требующих работы с живыми клетками и анализа белковых препаратов». 2010 г. Роль: исполнитель
11. НШ-5638.2010.4 «Структурный, функциональный и эволюционный анализ цис-регуляторных систем геномов про - и эукариот, включая человека. Развитие методических основ анализа и приложение его результатов в медицине и биотехнологии» гг. Роль: исполнитель
12. РФФИ -офи-м-2011 «Клеточные модели для испытания лекарственных средств, влияющих на метаболические и окислительно-восстановительные процессы в организме». гг. Роль: руководитель
13. НШ-1674.2012.4 «Структурный, функциональный и эволюционный анализ цис-регуляторных систем геномов про - и эукариот, включая человека. Развитие методических основ анализа и приложение его результатов в медицине и биотехнологии». гг. Роль: исполнитель
14. Грант Правительства России для государственной поддержки научных исследований, проводимых под руководством ведущих учёных в российских вузах № 11.G34.31.0017 «Флуоресцентные белки: новые подходы к изучению механизмов физиологических и патологических процессов в живых системах». гг. Роль: руководитель
Сведения о личном участии претендента в научных мероприятиях
1. Приглашенный доклад "Флуоресцентные белки: биология и биотехнология."Санкт-Петербургский научный форум "Наука и общество. Нанотехнологии: исследования и образование" — III Петербургская встреча лауреатов Нобелевской премии, 22–27 июня 2008 г. Уровень мероприятия - международный
2. Пленарный доклад "Флуоресцентные белки как новый объект фотобиологии". V съезд Российского фотобиологического общества. Пущино, 8-13 июня 2008 г. Уровень мероприятия - всероссийский
3. Секционный доклад. "Development and application of novel fluorescent proteins and sensors". HHMI’s 2008 Meeting of International Research Scholars in Lisbon, Portugal, June 19-22. Уровень мероприятия - международный
4. Приглашенный доклад "Photoswitchable and Far-red fluorescent proteins for high-resolution in vivo imaging" Minisymposium "High-Resolution In Vivo Imaging of Cell Biology”, May 2009, at the Nobel Forum of Karolinska Institutet, Stockholm, Sweden.
5. Приглашенный доклад «Флуоресцентные белки: биология и биотехнология». Международный форум по нанотехнологиям, ноябрь 2009, Москва, Россия. Уровень мероприятия - международный
6. Приглашенный доклад «Флуоресцентные белки для биомедицинских исследований». I международная научно-практическая конференция "Постгеномные методы анализа в биологии, лабораторной и клинической медицине", ноябрь 2010, Москва, Россия. Уровень мероприятия - международный
7. Пленарный доклад «Флуоресцентные белки: биология и биотехнология». Всероссийская научная школа для молодежи «Современные методы флуоресцентной визуализации в биомедицинских и биотехнологических исследованиях», ноябрь 2010, Москва, Россия. Уровень мероприятия - всероссийский
8. Пленарный доклад «Флуоресцентные белки как инертные метки и активные фотохимические агенты" на V Российский симпозиуме "Белки и пептиды" 08.08.2 2011 г., г. Петрозаводск, Россия. Уровень мероприятия - всероссийский
Сведения об участии претендента в подготовке и проведении научных мероприятий.
нет
Сведения о педагогической деятельности претендента (чтение курсов лекций, проведение семинаров, научное руководство аспирантами и консультирование докторантов, другие виды педагогической деятельности).
чтение курсов лекций
1. Курс лекций «Биоинженерия» ( г.) на кафедре молекулярной биологии биологического факультета Московского государственного университета им.
2. Курс лекций «Биоинженерия» ( г.) в Нижегородской государственной медицинской академии
научное руководство аспирантами
1. (01.07.20
2. (01.11.2007-30.11.2010)
3. (01.11.2010-31.10.2013)
4. Чжан Лицзюань (01.09.2006-31.08.2009)
Сведения о премиях и наградах за научную и педагогическую деятельность.
нет
Сведения об участии претендента в редакционных коллегиях научных журналов.
заместитель главного редактора журнала Биоорганическая химия
Член редакционной коллегии журнала Молекулярная биология
Член редакционной коллегии журнала New Scientist в России
