АННОТАЦИЯ

Наименование программы

Федеральная целевая программа «Научные и научно-педагогические кадры инновационной России» на годы

Название проекта

«Создание биоинформационной технологии поиска взаимосвязанных сценариев организации в геномах животных и человека некодирующей ДНК и кодирующей белок ДНК»

№ и дата государственного контракта

14.740.11.0006 от 01 сентября 2010 г.

Исполнитель государственного контракта

Научно-исследовательский институт биологии федерального государственного автономного образовательного учреждения высшего профессионального образования «Южный федеральный университет»

Руководитель

, д. б.н., профессор

Результаты (итоговые)

Создана новая биоинформационная технология поиска сценариев взаимодействия кодирующих и некодирующих белок участков ДНК, основанная на математической модели организации генома в процессе эволюции и индивидуального развития животных и человека.

Впервые разработан новый формат хранения нуклеотидных последовательностей BinFasta, который занимает вдвое меньший объем, чем FASTA.

Создана библиотека программ ЭВМ для поиска вариаций функциональных элементов в некодирующих последовательностях генома.

Построены генные сети взаимосвязи некодирующей части генома и паттернов экспрессии генов, вовлеченных в определенные биологические процессы.

Разработан дизайн и изготовлен опытный образец ДНК чипа для анализа экспрессии кислородзависимых генов при различных соматических патологиях.

Разработана ON-LINE база данных генофонда Ростовской области.

New bioinformatic search technology for interaction scenarios of protein coding and non-coding regions of DNA, based on mathematical model of the organization of the genome in the evolution process and individual development of animals and human was created. New nucleotide sequences storage format BinFasta, which requires twice less space than FASTA, was developed.

The software library for the search for variations of functional elements within non-coding sequences of the genome was created.

Gene networks of interaction between non-coding regions of the genome and expression patterns of genes involved in specific biological processes were constructed.

The design and prototype of the DNA-microarray for the analysis of the oxygen-dependent genes expression in various somatic pathologies was developed. ON-LINE database of Rostov region gene pool was developed.