Зачетное задание №1 (FAR+EXCEL)
Преподаватели сначала оценят качество выполнения обязательного минимума, а затем количество выполненных заданий.
Обязательный минимум, вариант 1
0. Приведите рабочую директорию в порядок.
В каталоге Н:\ должен быть только подкаталог Н:\Term1 (1-ый семестр), а в нем – только два
подподкаталога Practices и Credits, Practices – для занятий; Credits – для зачетных заданий. В
подподкаталоге Practices - подподподкаталог Practic2 и Practic3 с рабочими файлами 2-го и 3-его
занятия, а в подподкаталоге Credits – Credit1. Из подподподкаталога Credit2 все перенесите в
Practic3.
1. Покажите преподавателю, как с помощью одной команды FAR manager Вы можете
изменить конфигурацию панели, т. е. сделать описание файлов более или менее подробным.
Для 2-х конфигураций (на Ваш выбор) объяснить, какие свойства файлов отображены на
панели.
2. Включите новые данные в таблицу «Свойства аминокислот» в книге My_Protein. xls (ср. с
упр.3 занятия 3).
Данные находятся в файле AA_Eisenberg. txt на диске Р:\ .
Учтите, что
а) прежде, чем работать с файлом, скопируйте его в свою рабочую директорию!
в) преподаватель может подойти и спросить, какие именно свойства аминокислот
характеризуют данные файла;
с) в файле может быть полезный для Вас комментарий, который также имеет смысл любым
разумным образом включить в таблицу.
Файл My_Protein. xls сохраните в директории H:\Term1\Credits\Credit1\
3. Используя редактор в FAR manager, а также файлы, созданные на занятиях 2 и 3, опишите
главные результаты данного этапа Вашего исследования. Сохраните отчет в виде файла
H:\Term1\Credits\Credit1\My_Conclusions. txt.
Формат отчета:
1. Имя генома. (см. тетрадь или файл Ecoli. embl).
2. Имя гена, его положение в геноме (см. файл *.cds).
3. Имя белка (см. файл *. aaf).
4. Аминокислотная последовательность в формате FASTA, (см. файл *. aaf).
5. Молекулярный вес белка (см. файл My_Protein. xls).
6. Аминокислотный состав белка (см. файл My_Protein. xls).
7. Словесное описание результатов сравнения со средним аминокислотным составом разных
групп белков (см. файл My_Protein. xls).
8. Любые другие Ваши наблюдения.
Дополнительные задания (для тех, кто хочет получить более 20 баллов)
4. Сравните аминокислотный состав Вашего белка со средним аминокислотным составом
белков 2-х структурных классов. Сопоставьте с результатами упр.6 занятия 3 и выскажите
предположение о том, можно ли отнести Ваш белок к какому-либо классу, или нет.
Результаты сохраните на отдельном листе в книге My_Protein. xls.
Данные о среднем аминокислотном составе a-спиральных белков и b-структурных белков
можно найти в файле A_B_F. txt на диске Р:\.
Файл My_Protein. xls сохраните в директории H:\Term1\Credits\Credit1\
5. Найдите не менее 5-ти различий между файлами a11.txt и a12.txt на диске Р:\
(см. упр.6 на занятии 2).
Результаты описать в файле H:\Term1\Credits\Credit1\File_comp. txt.
6. Включите новые данные в таблицу «Свойства аминокислот» в книге My_Protein. xls.
Новые данные можно найти в текстовых файлах, лежащих в директории
P:\Term1\DATA\Credit1\AA_Properties.
Зачетное задание №1 (FAR+EXCEL)
Преподаватели сначала оценят качество выполнения обязательного минимума, а затем количество выполненных заданий.
Обязательный минимум, вариант 2
0. Приведите рабочую директорию в порядок.
В каталоге Н:\ должен быть только подкаталог Н:\Term1 (1-ый семестр), а в нем – только два
подподкаталога Practices и Credits, Practices – для занятий; Credits – для зачетных заданий. В
подподкаталоге Practices - подподподкаталог Practic2 и Practic3 с рабочими файлами 2-го и 3-его
занятия, а в подподкаталоге Credits – Credit1. Из подподподкаталога Credit2 все перенесите в
Practic3.
1. Покажите преподавателю, как с помощью одной команды FAR manager Вы можете
а) перейти с одной панели на другую;
в) сменить текущий диск панели.
2. Включите новые данные в таблицу «Свойства аминокислот» в книге My_Protein. xls (ср. с
упр.3 занятия 3).
Данные находятся в файле AA_common_opinion. txt на диске Р:\ . Замените в новых столбцах
“-“ на 0, а “X” на 1.
Учтите, что
а) прежде, чем работать с файлом, скопируйте его в свою рабочую директорию!
в) преподаватель может подойти и спросить, какие именно свойства аминокислот
характеризуют данные файла;
с) в файле может быть полезный для Вас комментарий, который также имеет смысл любым
разумным образом включить в таблицу.
Файл My_Protein. xls сохраните в директории H:\Term1\Credits\Credit1\
3. Используя редактор в FAR manager, а также файлы, созданные на занятиях 2 и 3, опишите
главные результаты данного этапа Вашего исследования. Сохраните отчет в виде файла
H:\Term1\Credits\Credit1\My_Conclusions. txt.
Формат отчета:
1. Имя генома. (см. тетрадь или файл Ecoli. embl).
2. Имя гена, его положение в геноме (см. файл *.cds).
3. Имя белка (см. файл *. aaf).
4. Аминокислотная последовательность в формате FASTA, (см. файл *. aaf).
5. Молекулярный вес белка (см. файл My_Protein. xls).
6. Аминокислотный состав белка (см. файл My_Protein. xls).
7. Словесное описание результатов сравнения со средним аминокислотным составом разных
групп белков (см. файл My_Protein. xls).
8. Любые другие Ваши наблюдения.
Дополнительные задания (для тех, кто хочет получить более 20 баллов)
4. Сравните аминокислотный состав Вашего белка со средним аминокислотным составом
белков 2-х структурных классов. Сопоставьте с результатами упр.6 занятия 3 и выскажите
предположение о том, можно ли отнести Ваш белок к какому-либо классу, или нет.
Результаты сохраните на отдельном листе в книге My_Protein. xls.
Данные о среднем аминокислотном составе a-спиральных белков и b-структурных белков
можно найти в файле A_B_F. txt на диске Р:\.
Файл My_Protein. xls сохраните в директории H:\Term1\Credits\Credit1\
5. Найдите не менее 5-ти различий между файлами a11.txt и a12.txt на диске Р:\
(см. упр.6 на занятии 2).
Результаты описать в файле H:\Term1\Credits\Credit1\File_comp. txt.
6. Включите новые данные в таблицу «Свойства аминокислот» в книге My_Protein. xls.
Новые данные можно найти в текстовых файлах, лежащих в директории
P:\Term1\DATA\Credit1\AA_Properties.
Зачетное задание №1 (FAR+EXCEL)
Преподаватели сначала оценят качество выполнения обязательного минимума, а затем количество выполненных заданий.
Обязательный минимум, вариант 3
0. Приведите рабочую директорию в порядок.
В каталоге Н:\ должен быть только подкаталог Н:\Term1 (1-ый семестр), а в нем – только два
подподкаталога Practices и Credits, Practices – для занятий; Credits – для зачетных заданий. В
подподкаталоге Practices - подподподкаталог Practic2 и Practic3 с рабочими файлами 2-го и 3-его
занятия, а в подподкаталоге Credits – Credit1. Из подподподкаталога Credit2 все перенесите в
Practic3.
1. Покажите преподавателю, как с помощью одной команды FAR manager Вы можете
вывести в неактивной панели общую информацию о диске активной панели, а потом.
вернуть неактивной панели прежний вид.
2. Включите новые данные в таблицу «Свойства аминокислот» в книге My_Protein. xls (ср. с
упр.3 занятия 3).
Данные находятся в файле AA_common_opinion. txt на диске Р:\ . Замените в новых столбцах
“-“ на 0, а “X” на 1.
Учтите, что
а) прежде, чем работать с файлом, скопируйте его в свою рабочую директорию!
в) преподаватель может подойти и спросить, какие именно свойства аминокислот
характеризуют данные файла;
с) в файле может быть полезный для Вас комментарий, который также имеет смысл любым
разумным образом включить в таблицу.
Файл My_Protein. xls сохраните в директории H:\Term1\Credits\Credit1\
3. Используя редактор в FAR manager, а также файлы, созданные на занятиях 2 и 3, опишите
главные результаты данного этапа Вашего исследования. Сохраните отчет в виде файла
H:\Term1\Credits\Credit1\My_Conclusions. txt.
Формат отчета:
1. Имя генома. (см. тетрадь или файл Ecoli. embl).
2. Имя гена, его положение в геноме (см. файл *.cds).
3. Имя белка (см. файл *. aaf).
4. Аминокислотная последовательность в формате FASTA, (см. файл *. aaf).
5. Молекулярный вес белка (см. файл My_Protein. xls).
6. Аминокислотный состав белка (см. файл My_Protein. xls).
7. Словесное описание результатов сравнения со средним аминокислотным составом разных
групп белков (см. файл My_Protein. xls).
8. Любые другие Ваши наблюдения.
Дополнительные задания (для тех, кто хочет получить более 20 баллов)
4. Сравните аминокислотный состав Вашего белка со средним аминокислотным составом
белков 2-х структурных классов. Сопоставьте с результатами упр.6 занятия 3 и выскажите
предположение о том, можно ли отнести Ваш белок к какому-либо классу, или нет.
Результаты сохраните на отдельном листе в книге My_Protein. xls.
Данные о среднем аминокислотном составе a-спиральных белков и b-структурных белков
можно найти в файле A_B_F. txt на диске Р:\.
Файл My_Protein. xls сохраните в директории H:\Term1\Credits\Credit1\
5. Найдите не менее 5-ти различий между файлами a11.txt и a12.txt на диске Р:\
(см. упр.6 на занятии 2).
Результаты описать в файле H:\Term1\Credits\Credit1\File_comp. txt.
6. Включите новые данные в таблицу «Свойства аминокислот» в книге My_Protein. xls.
Новые данные можно найти в текстовых файлах, лежащих в директории
P:\Term1\DATA\Credit1\AA_Properties.
Зачетное задание №1 (FAR+EXCEL)
Преподаватели сначала оценят качество выполнения обязательного минимума, а затем количество выполненных заданий.
Обязательный минимум, вариант 4
0. Приведите рабочую директорию в порядок.
В каталоге Н:\ должен быть только подкаталог Н:\Term1 (1-ый семестр), а в нем – только два
подподкаталога Practices и Credits, Practices – для занятий; Credits – для зачетных заданий. В
подподкаталоге Practices - подподподкаталог Practic2 и Practic3 с рабочими файлами 2-го и 3-его
занятия, а в подподкаталоге Credits – Credit1. Из подподподкаталога Credit2 все перенесите в
Practic3.
1. Покажите преподавателю, как с помощью одной команды FAR manager Вы можете
перевести неактивную панель в режим быстрого просмотра содержимого файла, а затем
возвратить панель к первоначальному виду.
2. Включите новые данные в таблицу «Свойства аминокислот» в книге My_Protein. xls (ср. с
упр.3 занятия 3).
Данные находятся в файле AA_рК. txt на диске Р:\ .
Учтите, что
а) прежде, чем работать с файлом, скопируйте его в свою рабочую директорию!
в) преподаватель может подойти и спросить, какие именно свойства аминокислот
характеризуют данные файла;
с) в файле может быть полезный для Вас комментарий, который также имеет смысл любым
разумным образом включить в таблицу.
Файл My_Protein. xls сохраните в директории H:\Term1\Credits\Credit1\
3. Используя редактор в FAR manager, а также файлы, созданные на занятиях 2 и 3, опишите
главные результаты данного этапа Вашего исследования. Сохраните отчет в виде файла
H:\Term1\Credits\Credit1\My_Conclusions. txt.
Формат отчета:
1. Имя генома. (см. тетрадь или файл Ecoli. embl).
2. Имя гена, его положение в геноме (см. файл *.cds).
3. Имя белка (см. файл *. aaf).
4. Аминокислотная последовательность в формате FASTA, (см. файл *. aaf).
5. Молекулярный вес белка (см. файл My_Protein. xls).
6. Аминокислотный состав белка (см. файл My_Protein. xls).
7. Словесное описание результатов сравнения со средним аминокислотным составом разных
групп белков (см. файл My_Protein. xls).
8. Любые другие Ваши наблюдения.
Дополнительные задания (для тех, кто хочет получить более 20 баллов)
4. Сравните аминокислотный состав Вашего белка со средним аминокислотным составом
белков 2-х структурных классов. Сопоставьте с результатами упр.6 занятия 3 и выскажите
предположение о том, можно ли отнести Ваш белок к какому-либо классу, или нет.
Результаты сохраните на отдельном листе в книге My_Protein. xls.
Данные о среднем аминокислотном составе a-спиральных белков и b-структурных белков
можно найти в файле A_B_F. txt на диске Р:\.
Файл My_Protein. xls сохраните в директории H:\Term1\Credits\Credit1\
5. Найдите не менее 5-ти различий между файлами a11.txt и a12.txt на диске Р:\
(см. упр.6 на занятии 2).
Результаты описать в файле H:\Term1\Credits\Credit1\File_comp. txt.
6. Включите новые данные в таблицу «Свойства аминокислот» в книге My_Protein. xls .
Новые данные можно найти в текстовых файлах, лежащих в директории
P:\Term1\DATA\Credit1\AA_Properties.
Материалы к занятию 4
Зачетное задание №1 (FAR+EXCEL)
Преподаватели сначала оценят качество выполнения обязательного минимума, а затем количество выполненных заданий.
Обязательный минимум, вариант 5
0. Приведите рабочую директорию в порядок.
В каталоге Н:\ должен быть только подкаталог Н:\Term1 (1-ый семестр), а в нем – только два
подподкаталога Practices и Credits, Practices – для занятий; Credits – для зачетных заданий. В
подподкаталоге Practices - подподподкаталог Practic2 и Practic3 с рабочими файлами 2-го и 3-его
занятия, а в подподкаталоге Credits – Credit1. Из подподподкаталога Credit2 все перенесите в
Practic3.
1. Покажите преподавателю, как с помощью одной команды FAR manager Вы можете
сравнить содержимое 2-х директорий.
2. Включите новые данные в таблицу «Свойства аминокислот» в книге My_Protein. xls (ср. с
упр.3 занятия 3).
Данные находятся в файле AA_рК. txt на диске Р:\ .
Учтите, что
а) прежде, чем работать с файлом, скопируйте его в свою рабочую директорию!
в) преподаватель может подойти и спросить, какие именно свойства аминокислот
характеризуют данные файла;
с) в файле может быть полезный для Вас комментарий, который также имеет смысл любым
разумным образом включить в таблицу.
Файл My_Protein. xls сохраните в директории H:\Term1\Credits\Credit1\
3. Используя редактор в FAR manager, а также файлы, созданные на занятиях 2 и 3, опишите
главные результаты данного этапа Вашего исследования. Сохраните отчет в виде файла
H:\Term1\Credits\Credit1\My_Conclusions. txt.
Формат отчета:
1. Имя генома. (см. тетрадь или файл Ecoli. embl).
2. Имя гена, его положение в геноме (см. файл *.cds).
3. Имя белка (см. файл *. aaf).
4. Аминокислотная последовательность в формате FASTA, (см. файл *. aaf).
5. Молекулярный вес белка (см. файл My_Protein. xls).
6. Аминокислотный состав белка (см. файл My_Protein. xls).
7. Словесное описание результатов сравнения со средним аминокислотным составом разных групп белков (см. файл My_Protein. xls).
8. Любые другие Ваши наблюдения.
Дополнительные задания (для тех, кто хочет получить более 20 баллов)
4. Сравните аминокислотный состав Вашего белка со средним аминокислотным составом
белков 2-х структурных классов. Сопоставьте с результатами упр.6 занятия 3 и выскажите
предположение о том, можно ли отнести Ваш белок к какому-либо классу, или нет.
Результаты сохраните на отдельном листе в книге My_Protein. xls.
Данные о среднем аминокислотном составе a-спиральных белков и b-структурных белков
можно найти в файле A_B_F. txt на диске Р:\.
Файл My_Protein. xls сохраните в директории H:\Term1\Credits\Credit1\
5. Найдите не менее 5-ти различий между файлами a11.txt и a12.txt на диске Р:\
(см. упр.6 на занятии 2).
Результаты описать в файле H:\Term1\Credits\Credit1\File_comp. txt.
6. Включите новые данные в таблицу «Свойства аминокислот» в книге My_Protein. xls.
Новые данные можно найти в текстовых файлах, лежащих в директории
P:\Term1\DATA\Credit1\AA_Properties.
Зачетное задание №1 (FAR+EXCEL)
Преподаватели сначала оценят качество выполнения обязательного минимума, а затем количество выполненных заданий.
Обязательный минимум, вариант 6
0. Приведите рабочую директорию в порядок.
В каталоге Н:\ должен быть только подкаталог Н:\Term1 (1-ый семестр), а в нем – только два
подподкаталога Practices и Credits, Practices – для занятий; Credits – для зачетных заданий. В
подподкаталоге Practices - подподподкаталог Practic2 и Practic3 с рабочими файлами 2-го и 3-его
занятия, а в подподкаталоге Credits – Credit1. Из подподподкаталога Credit2 все перенесите в
Practic3.
1. Покажите преподавателю, как с помощью одной команды FAR manager Вы можете
сортировать файлы. Покажите не менее 2-х примеров сортировки по разным признакам.
2. Включите новые данные в таблицу «Свойства аминокислот» в книге My_Protein. xls (ср. с
упр.3 занятия 3).
Данные находятся в файле AA_Eisenberg. txt на диске Р:\ .
Учтите, что
а) прежде, чем работать с файлом, скопируйте его в свою рабочую директорию!
в) преподаватель может подойти и спросить, какие именно свойства аминокислот
характеризуют данные файла;
с) в файле может быть полезный для Вас комментарий, который также имеет смысл любым
разумным образом включить в таблицу.
Файл My_Protein. xls сохраните в директории H:\Term1\Credits\Credit1\
3. Используя редактор в FAR manager, а также файлы, созданные на занятиях 2 и 3, опишите
главные результаты данного этапа Вашего исследования. Сохраните отчет в виде файла
H:\Term1\Credits\Credit1\My_Conclusions. txt.
Формат отчета:
1. Имя генома. (см. тетрадь или файл Ecoli. embl).
2. Имя гена, его положение в геноме (см. файл *.cds).
3. Имя белка (см. файл *. aaf).
4. Аминокислотная последовательность в формате FASTA, (см. файл *. aaf).
5. Молекулярный вес белка (см. файл My_Protein. xls).
6. Аминокислотный состав белка (см. файл My_Protein. xls).
7. Словесное описание результатов сравнения со средним аминокислотным составом разных
групп белков (см. файл My_Protein. xls).
8. Любые другие Ваши наблюдения.
Дополнительные задания (для тех, кто хочет получить более 20 баллов)
4. Сравните аминокислотный состав Вашего белка со средним аминокислотным составом
белков 2-х структурных классов. Сопоставьте с результатами упр.6 занятия 3 и выскажите
предположение о том, можно ли отнести Ваш белок к какому-либо классу, или нет.
Результаты сохраните на отдельном листе в книге My_Protein. xls.
Данные о среднем аминокислотном составе a-спиральных белков и b-структурных белков
можно найти в файле A_B_F. txt на диске Р:\.
Файл My_Protein. xls сохраните в директории H:\Term1\Credits\Credit1\
5. Найдите не менее 5-ти различий между файлами a11.txt и a12.txt на диске Р:\
(см. упр.6 на занятии 2).
Результаты описать в файле H:\Term1\Credits\Credit1\File_comp. txt.
6. Включите новые данные в таблицу «Свойства аминокислот» в книге My_Protein. xls.
Новые данные можно найти в текстовых файлах, лежащих в директории
P:\Term1\DATA\Credit1\AA_Properties.
Зачетное задание №1 (FAR+EXCEL)
Преподаватели сначала оценят качество выполнения обязательного минимума, а затем количество выполненных заданий.
Обязательный минимум, вариант 7
0. Приведите рабочую директорию в порядок.
В каталоге Н:\ должен быть только подкаталог Н:\Term1 (1-ый семестр), а в нем – только два
подподкаталога Practices и Credits, Practices – для занятий; Credits – для зачетных заданий. В
подподкаталоге Practices - подподподкаталог Practic2 и Practic3 с рабочими файлами 2-го и 3-его
занятия, а в подподкаталоге Credits – Credit1. Из подподподкаталога Credit2 все перенесите в
Practic3.
1. Покажите преподавателю, как с помощью одной команды FAR manager Вы можете
а) выделить файл;
в) снять выделение;
с) выделить группу файлов;
d) снять выделение.
2. Включите новые данные в таблицу «Свойства аминокислот» в книге My_Protein. xls (ср. с
упр.3 занятия 3).
Данные находятся в файле AA_K&D. txt на диске Р:\ .
Учтите, что
а) прежде, чем работать с файлом, скопируйте его в свою рабочую директорию!
в) преподаватель может подойти и спросить, какие именно свойства аминокислот
характеризуют данные файла;
с) в файле может быть полезный для Вас комментарий, который также имеет смысл любым
разумным образом включить в таблицу.
Файл My_Protein. xls сохраните в директории H:\Term1\Credits\Credit1\
3. Используя редактор в FAR manager, а также файлы, созданные на занятиях 2 и 3, опишите
главные результаты данного этапа Вашего исследования. Сохраните отчет в виде файла
H:\Term1\Credits\Credit1\My_Conclusions. txt.
Формат отчета:
1. Имя генома. (см. тетрадь или файл Ecoli. embl).
2. Имя гена, его положение в геноме (см. файл *.cds).
3. Имя белка (см. файл *. aaf).
4. Аминокислотная последовательность в формате FASTA, (см. файл *. aaf).
5. Молекулярный вес белка (см. файл My_Protein. xls).
6. Аминокислотный состав белка (см. файл My_Protein. xls).
7. Словесное описание результатов сравнения со средним аминокислотным составом разных групп белков (см. файл My_Protein. xls).
8. Любые другие Ваши наблюдения.
Дополнительные задания (для тех, кто хочет получить более 20 баллов)
4. Сравните аминокислотный состав Вашего белка со средним аминокислотным составом
белков 2-х структурных классов. Сопоставьте с результатами упр.6 занятия 3 и выскажите
предположение о том, можно ли отнести Ваш белок к какому-либо классу, или нет.
Результаты сохраните на отдельном листе в книге My_Protein. xls.
Данные о среднем аминокислотном составе a-спиральных белков и b-структурных белков
можно найти в файле A_B_F. txt на диске Р:\.
Файл My_Protein. xls сохраните в директории H:\Term1\Credits\Credit1\
5. Найдите не менее 5-ти различий между файлами a11.txt и a12.txt на диске Р:\
(см. упр.6 на занятии 2).
Результаты описать в файле H:\Term1\Credits\Credit1\File_comp. txt.
6. Включите новые данные в таблицу «Свойства аминокислот» в книге My_Protein. xls.
Новые данные можно найти в текстовых файлах, лежащих в директории
P:\Term1\DATA\Credit1\AA_Properties.
Зачетное задание №1 (FAR+EXCEL)
Преподаватели сначала оценят качество выполнения обязательного минимума, а затем количество выполненных заданий.
Обязательный минимум, вариант 8
0. Приведите рабочую директорию в порядок.
В каталоге Н:\ должен быть только подкаталог Н:\Term1 (1-ый семестр), а в нем – только два
подподкаталога Practices и Credits, Practices – для занятий; Credits – для зачетных заданий. В
подподкаталоге Practices - подподподкаталог Practic2 и Practic3 с рабочими файлами 2-го и 3-его
занятия, а в подподкаталоге Credits – Credit1. Из подподподкаталога Credit2 все перенесите в
Practic3.
1. Покажите преподавателю, как с помощью одной команды FAR manager Вы можете
a. выделить группу файлов;
b. скопировать выделенную группу в другую директорию
c. и удалить.
2. Включите новые данные в таблицу «Свойства аминокислот» в книге My_Protein. xls (ср. с
упр.3 занятия 3).
Данные находятся в файле AA_Hexp. txt на диске Р:\ .
Учтите, что
а) прежде, чем работать с файлом, скопируйте его в свою рабочую директорию!
в) преподаватель может подойти и спросить, какие именно свойства аминокислот
характеризуют данные файла;
с) в файле может быть полезный для Вас комментарий, который также имеет смысл любым
разумным образом включить в таблицу.
Файл My_Protein. xls сохраните в директории H:\Term1\Credits\Credit1\
3. Используя редактор в FAR manager, а также файлы, созданные на занятиях 2 и 3, опишите
главные результаты данного этапа Вашего исследования. Сохраните отчет в виде файла
H:\Term1\Credits\Credit1\My_Conclusions. txt.
Формат отчета:
1. Имя генома. (см. тетрадь или файл Ecoli. embl).
2. Имя гена, его положение в геноме (см. файл *.cds).
3. Имя белка (см. файл *. aaf).
4. Аминокислотная последовательность в формате FASTA, (см. файл *. aaf).
5. Молекулярный вес белка (см. файл My_Protein. xls).
6. Аминокислотный состав белка (см. файл My_Protein. xls).
7. Словесное описание результатов сравнения со средним аминокислотным составом разных групп белков (см. файл My_Protein. xls).
8. Любые другие Ваши наблюдения.
Дополнительные задания (для тех, кто хочет получить более 20 баллов)
4. Сравните аминокислотный состав Вашего белка со средним аминокислотным составом
белков 2-х структурных классов. Сопоставьте с результатами упр.6 занятия 3 и выскажите
предположение о том, можно ли отнести Ваш белок к какому-либо классу, или нет.
Результаты сохраните на отдельном листе в книге My_Protein. xls.
Данные о среднем аминокислотном составе a-спиральных белков и b-структурных белков
можно найти в файле A_B_F. txt на диске Р:\.
Файл My_Protein. xls сохраните в директории H:\Term1\Credits\Credit1\
5. Найдите не менее 5-ти различий между файлами a11.txt и a12.txt на диске Р:\
(см. упр.6 на занятии 2).
Результаты описать в файле H:\Term1\Credits\Credit1\File_comp. txt.
6. Включите новые данные в таблицу «Свойства аминокислот» в книге My_Protein. xls.
Новые данные можно найти в текстовых файлах, лежащих в директории
P:\Term1\DATA\Credit1\AA_Properties.
Материалы к занятию 4
Зачетное задание №1 (FAR+EXCEL)
Преподаватели сначала оценят качество выполнения обязательного минимума, а затем количество выполненных заданий.
Обязательный минимум, вариант 9
0. Приведите рабочую директорию в порядок.
В каталоге Н:\ должен быть только подкаталог Н:\Term1 (1-ый семестр), а в нем – только два
подподкаталога Practices и Credits, Practices – для занятий; Credits – для зачетных заданий. В
подподкаталоге Practices - подподподкаталог Practic2 и Practic3 с рабочими файлами 2-го и 3-его
занятия, а в подподкаталоге Credits – Credit1. Из подподподкаталога Credit2 все перенесите в
Practic3.
1. Покажите преподавателю, как с помощью одной команды FAR manager Вы можете
a. выделить группу файлов;
b. переименовать файлы, оставив их в прежней директории.
2. Включите новые данные в таблицу «Свойства аминокислот» в книге My_Protein. xls (ср. с
упр.3 занятия 3).
Данные находятся в файле AA_K&D. txt на диске Р:\ .
Учтите, что
а) прежде, чем работать с файлом, скопируйте его в свою рабочую директорию!
в) преподаватель может подойти и спросить, какие именно свойства аминокислот
характеризуют данные файла;
с) в файле может быть полезный для Вас комментарий, который также имеет смысл любым
разумным образом включить в таблицу.
Файл My_Protein. xls сохраните в директории H:\Term1\Credits\Credit1\
3. Используя редактор в FAR manager, а также файлы, созданные на занятиях 2 и 3, опишите
главные результаты данного этапа Вашего исследования. Сохраните отчет в виде файла
H:\Term1\Credits\Credit1\My_Conclusions. txt.
Формат отчета:
1. Имя генома. (см. тетрадь или файл Ecoli. embl).
2. Имя гена, его положение в геноме (см. файл *.cds).
3. Имя белка (см. файл *. aaf).
4. Аминокислотная последовательность в формате FASTA, (см. файл *. aaf).
5. Молекулярный вес белка (см. файл My_Protein. xls).
6. Аминокислотный состав белка (см. файл My_Protein. xls).
7. Словесное описание результатов сравнения со средним аминокислотным составом разных групп белков (см. файл My_Protein. xls).
8. Любые другие Ваши наблюдения.
Дополнительные задания (для тех, кто хочет получить более 20 баллов)
4. Сравните аминокислотный состав Вашего белка со средним аминокислотным составом
белков 2-х структурных классов. Сопоставьте с результатами упр.6 занятия 3 и выскажите
предположение о том, можно ли отнести Ваш белок к какому-либо классу, или нет.
Результаты сохраните на отдельном листе в книге My_Protein. xls.
Данные о среднем аминокислотном составе a-спиральных белков и b-структурных белков
можно найти в файле A_B_F. txt на диске Р:\.
Файл My_Protein. xls сохраните в директории H:\Term1\Credits\Credit1\
5. Найдите не менее 5-ти различий между файлами a11.txt и a12.txt на диске Р:\
(см. упр.6 на занятии 2).
Результаты описать в файле H:\Term1\Credits\Credit1\File_comp. txt.
6. Включите новые данные в таблицу «Свойства аминокислот» в книге My_Protein. xls .
Новые данные можно найти в текстовых файлах, лежащих в директории
P:\Term1\DATA\Credit1\AA_Properties.
Зачетное задание №1 (FAR+EXCEL)
Преподаватели сначала оценят качество выполнения обязательного минимума, а затем количество выполненных заданий.
Обязательный минимум, вариант 10
0. Приведите рабочую директорию в порядок.
В каталоге Н:\ должен быть только подкаталог Н:\Term1 (1-ый семестр), а в нем – только два
подподкаталога Practices и Credits, Practices – для занятий; Credits – для зачетных заданий. В
подподкаталоге Practices - подподподкаталог Practic2 и Practic3 с рабочими файлами 2-го и 3-его
занятия, а в подподкаталоге Credits – Credit1. Из подподподкаталога Credit2 все перенесите в
Practic3.
1. Покажите преподавателю, как с помощью FAR manager Вы можете
a. создать новый файл;
b. написать слово «файл»;
c. сохранить файл;
d. просмотреть содержимое файла.
2. Включите новые данные в таблицу «Свойства аминокислот» в книге My_Protein. xls (ср. с
упр.3 занятия 3).
Данные находятся в файле AA_Hexp. txt на диске Р:\ .
Учтите, что
а) прежде, чем работать с файлом, скопируйте его в свою рабочую директорию!
в) преподаватель может подойти и спросить, какие именно свойства аминокислот
характеризуют данные файла;
с) в файле может быть полезный для Вас комментарий, который также имеет смысл любым
разумным образом включить в таблицу.
Файл My_Protein. xls сохраните в директории H:\Term1\Credits\Credit1\
3. Используя редактор в FAR manager, а также файлы, созданные на занятиях 2 и 3, опишите
главные результаты данного этапа Вашего исследования. Сохраните отчет в виде файла
H:\Term1\Credits\Credit1\My_Conclusions. txt.
Формат отчета:
1. Имя генома. (см. тетрадь или файл Ecoli. embl).
2. Имя гена, его положение в геноме (см. файл *.cds).
3. Имя белка (см. файл *. aaf).
4. Аминокислотная последовательность в формате FASTA, (см. файл *. aaf).
5. Молекулярный вес белка (см. файл My_Protein. xls).
6. Аминокислотный состав белка (см. файл My_Protein. xls).
7. Словесное описание результатов сравнения со средним аминокислотным составом разных групп белков (см. файл My_Protein. xls).
8. Любые другие Ваши наблюдения.
Дополнительные задания (для тех, кто хочет получить более 20 баллов)
4. Сравните аминокислотный состав Вашего белка со средним аминокислотным составом
белков 2-х структурных классов. Сопоставьте с результатами упр.6 занятия 3 и выскажите
предположение о том, можно ли отнести Ваш белок к какому-либо классу, или нет.
Результаты сохраните на отдельном листе в книге My_Protein. xls.
Данные о среднем аминокислотном составе a-спиральных белков и b-структурных белков
можно найти в файле A_B_F. txt на диске Р:\.
Файл My_Protein. xls сохраните в директории H:\Term1\Credits\Credit1\
5. Найдите не менее 5-ти различий между файлами a11.txt и a12.txt на диске Р:\
(см. упр.6 на занятии 2).
Результаты описать в файле H:\Term1\Credits\Credit1\File_comp. txt.
6. Включите новые данные в таблицу «Свойства аминокислот» в книге My_Protein. xls .
Новые данные можно найти в текстовых файлах, лежащих в директории
P:\Term1\DATA\Credit1\AA_Properties.
