Генетический полиморфизм белков и ДНК (стр. 1 )

3

2

РОССИЙСКАЯ ФЕДЕРАЦИЯ

МИНИСТЕРСТВО ОБРАЗОВАНИЯ И НАУКИ

Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение

высшего профессионального образования

ТЮМЕНСКИЙ ГОСУДАРСТВЕННЫЙ УНИВЕРСИТЕТ

«УТВЕРЖДАЮ»:

Проректор по учебной работе

_______________//

03.01.2013 г.

ГЕНЕТИЧЕСКИЙ ПОЛИМОРФИЗМ БЕЛКОВ И ДНК

Учебно-методический комплекс. Рабочая программа

для студентов специальности 020501 – Биоинженерия и биоинформатика,

очной формы обучения

«ПОДГОТОВЛЕНО К ИЗДАНИЮ»:

Автор работы _____________________________//

«__20____»_____02______2013 г.

Рассмотрено на заседании кафедры экологии и генетики 27 февраля 2013 г., протокол Соответствует требованиям к содержанию, структуре и оформлению.

«РЕКОМЕНДОВАНО К ЭЛЕКТРОННОМУ ИЗДАНИЮ»:

Объем 15 стр.

Зав. кафедрой ______________________________//

Рассмотрено на заседании УМК департамента биологии ИМЕНИТ 12 марта 2013 г., протокол

Соответствует ФГОС ВПО и учебному плану образовательной программы.

«СОГЛАСОВАНО»:

Председатель УМК ________________________//

«СОГЛАСОВАНО»:

Директор ИБЦ_____________//

«__23____»_____05________2013 г.

«СОГЛАСОВАНО»:

. методическим отделом УМУ_____________//

«___03___»____07_________2013 г.

РОССИЙСКАЯ ФЕДЕРАЦИЯ

МИНИСТЕРСТВО ОБРАЗОВАНИЯ И НАУКИ

Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение

высшего профессионального образования

ТЮМЕНСКИЙ ГОСУДАРСТВЕННЫЙ УНИВЕРСИТЕТ

Институт математики, естественных наук и информационных технологий

Кафедра экологии и генетики

ГЕНЕТИЧЕСКИЙ ПОЛИМОРФИЗМ БЕЛКОВ И ДНК

Учебно-методический комплекс. Рабочая программа

для студентов специальности 020501 – Биоинженерия и биоинформатика,

очной формы обучения

Тюменский государственный университет

2013

Генетический полиморфизм белков и ДНК. Учебно-методический комплекс. Рабочая программа для студентов специальности 020501 – Биоинженерия и биоинформатика, очной формы обучения. Тюмень, 2013, 15 стр.

Рабочая программа составлена в соответствии с требованиями ФГОС ВПО с учетом рекомендаций и ПрООП ВПО по направлению и профилю подготовки.

Рабочая программа дисциплины опубликована на сайте ТюмГУ: Генетический полиморфизм белков и ДНК [электронный ресурс] / Режим доступа: http://www. *****., свободный.

Рекомендовано к изданию кафедрой экологии и генетики. Утверждено проректором по учебной работе Тюменского государственного университета.

© Тюменский государственный университет, 2013.

© , 2013.

1. Пояснительная записка.

1.1. Цели и задачи дисциплины

Целью курса является ознакомление студентов с концепцией генетического полиморфизма. В задачи курса входит формирование у студентов представления о полиморфизме, как универсальном явлении в живой природе и его биологической роли. Рассматриваются особенности полиморфизма белков и ДНК, виды генетического полиморфизма, механизмы его поддержания в природных популяциях. Даются оценки полиморфизма природных популяций животных, растений, микроорганизмов. Особое место в программе спецкурса отводится методам изучения генетического полиморфизма. Один раздел в программе курса посвящен проблеме мониторинга внутривидового генетического разнообразия.

Учебно-методический комплекс «Генетический полиморфизм белков и ДНК» соответствует требованиям федерального государственного образовательного стандарта высшего профессионального образования.

1.2. Место дисциплины в структуре ООП специалитета

Дисциплина «Генетический полиморфизм белков и ДНК» относится к циклу С3. Профессиональный цикл: дисциплины по выбору. Она логически и содержательно-методически взаимосвязана с дисциплинами С2. Математического и естественнонаучного цикла: вариативной частью и С3. Профессионального цикла: базовой и вариативной частями: генетика, теории эволюции, биохимия, энзимология, молекулярная биология и молекулярная генетика, методы исследования биологических макромолекул, геномика и протеомика, функциональная аннотация биополимеров, структурная аннотация биополимеров, популяционная генетика, основы мутагенеза и генетической токсикологии. Для успешного освоения дисциплины необходимы базовые знания по генетике, биохимии, молекулярной биологии и молекулярной генетике, эволюционным теориям, популяционной генетике, основам мутагенеза и генетической токсикологии.

1.3. Компетенции выпускника ООП специалитета, формируемые в результате освоения данной ООП ВПО.

В результате освоения ООП специалитета выпускник должен обладать следующими компетенциями:

- способностью самостоятельно приобретать с помощью информационных технологий и использовать в практической деятельности новые знания и умения в области биоинженерии, биоинформатики и смежных дисциплин – ПК-5

- способностью к проведению лабораторных работ и знает требования техники безопасности и приемов оказания первой помощи при несчастных случаях – ПК-12

- способностью использовать основные биологические базы данных, в том числе содержащие геномную, структурную и другую информацию, в научно-исследовательской работе – ПК-13

- способностью получать и грамотно использовать информацию, накопленную в базах данных по структуре геномов, белков и другой биологической информации – ПК-19

- способностью владеть приемами экспериментальной работы с клетками и культурами клеток, физико-химическими методами исследования макромолекул, методами исследования и анализа живых систем, математическими методами обработки результатов биологических исследований, опытом лабораторных работ, основами биоинженерии, необходимыми для создания биоинженерных объектов – ПК-21.

В результате освоения дисциплины обучающийся должен:

· Знать: основные положения концепции генетического полиморфизма, историю открытия и значение полиморфизма, виды полиморфизма, методы выявления и направления использования белковых и ДНК маркеров, механизмы возникновения и поддержания полиморфизма, значение полиморфизма;

· Уметь: давать количественную оценку генетической изменчивости;

· Владеть: основными методами изучения биохимического и генетического полиморфизма (электрофорез биомолекул в гелях, полимеразная цепная реакция).

Карта компетенций дисциплины

Компетенции	Формулировка компетенции	Результаты обучения в целом	Результаты обучения по уровням освоения материала	Виды занятий (лекции, практические, семинарские, лабораторные)	Оценочные средства (тесты, творческие работы, проекты и др.)
минимальный	базовый	повышенный
ПК-5	способностью самостоятельно приобретать с помощью информационных технологий и использовать в практической деятельности новые знания и умения в области биоинженерии, биоинформатики и смежных дисциплин	Знает: общие принципы работы с поисковыми системами в сети Интернет и основные источники получения информации в области биоинженерии, биоинформатики и смежных дисциплин	приемы работы на компьютере, принципы работы с поисковыми системами в сети Интернет	основные поисковые системы и сайты, источники получения информации в области биоинженерии и биоинформатики	основные поисковые системы и сайты, источники получения информации в смежных областях знаний	самостоятельная работа	реферат
Умеет: находить, обрабатывать и анализировать информацию с использованием информационных технологий	вести эффективный поиск информации в сети Интернет	работать с официальными сайтами и научной и справочной литературой с использованием поисковых систем	анализировать полученную информацию и формировать суждение по научным и социальным вопросам	самостоятельная работа	реферат
Владеет: навыками обработки информации с использованием компьютерных технологий	навыками работы на компьютере	способностью вести эффективный поиск информации в сети Интернет	навыками представлять результаты в форме презентаций и научных докладов	самостоятельная работа	презента-ции и доклады
ПК-12	способностью к проведению лабораторных работ и знает требования техники безопасности и приемов оказания первой помощи при несчастных случаях	Знает: предназначение, правила работы с лабораторным оборудованием и правила техники безопасности при работе сним	предназначение оборудования молекулярно-генетической лаборатории	правила работы с оборудованием и требования техники безопасности при работе в молекулярно-генетической лаборатории	принцип метода и работы приборов для проведения электрофореза, полимеразной цепной реакции и проч.	лекции	контрольная работа
Умеет: проводить работы в области молекулярной генетики с использованием специализированного оборудования	работать с оборудованием молекулярно-генетической лаборатории	проводить лабораторные работы с использованием оборудования	выявлять простые неполадки в работе приборов и оборудования	лабораторные занятия	защита лабораторных работ
Владеет: приемами работы с оборудованием и техникой безопасности при работе с ним	элементарными приемами работы с приборами	техникой безопасности при работе в молекулярно-генетической лаборатории	навыками работы с лабораторными организмами и оборудованием	лабораторные занятия	защита лабораторных работ
ПК-13	способностью использовать основные биологические базы данных, в том числе содержащие геномную, структурную и другую информацию, в научно-исследовательской работе	Знает: основные биологические базы данных, содержащие геномную, структурную и другую информацию и принципы работы с ними	о наличии и содержании биологических баз данных	основные биологические базы данных, содержащие геномную, структурную и другую информацию	принципы работы с основными базами данных содержащих геномную, структурную и другую информацию	лекции	контрольная работа
Умеет: работать с основными биологическими базами данных, осуществлять поиск, доступ, использовать полученную информацию в научно-исследовательской работе	осуществлять поиск и доступ к базам данных в сети Интернет	работать с основными биологическими базами данных	использовать сведения, полученные из биологических баз данных, в научно-исследовательской работе	лабораторные занятия	защита лабораторных работ
Владеет: навыками работы с основными биологическими базами данных	приемами работы с поисковыми системами в сети Интернет	навыками работы с основными биологическими базами данных	способностью использовать биологические базы данных в научно-исследовательской работе	лабораторные занятия	защита лабораторных работ, творческие задания
ПК- 19	способностью получать и грамотно использовать информацию, накопленную в базах данных по структуре геномов, белков и другой биологической информации	Знает: основные биологические базы данных, содержащие геномную, структурную и другую информацию	о наличии и содержании баз данных по структуре геномов и белков	основные биологические базы данных, содержащие геномную, структурную и другую биологическую информацию	принципы работы с основными базами данных содержащих геномную, структурную и другую биологическуюинформацию	лабораторные занятия	защита лабораторных работ
Умеет: работать с основными биологическими базами данных, осуществлять поиск, доступ, использовать полученную информацию в практической деятельности	осуществлять поиск и доступ к базам данных в сети Интернет	работать с основными биологическими базами данных	использовать сведения, накопленные в биологических базах данных, для решения задач	лабораторные занятия	защита лабораторных работ
Владеет: работать с основными биологическими базами данных	приемами работы с поисковыми системами в сети Интернет	навыками работы с основными биологическими базами данных	способностью использовать информацию по структуре геномов и белков, накопленную в базах данных, для решения практических задач	лабораторные занятия	защита лабораторных работ, творческие задания
ПК-21	способностью владеть приемами экспериментальной работы с клетками и культурами клеток, физико-химическими методами исследования макромолекул, методами исследования и анализа живых систем, математическими методами обработки результатов биологических исследований, опытом лабораторных работ, основами биоинженерии, необходимыми для создания биоинженерных объектов	Знает: основные физико-химические методы изучения полиморфизма белков и нуклеиновых кислот и математические методы обработки результатов электрофореза	основные физико-химические методы изучения полиморфизма белков и нуклеиновых кислот	математические методы обработки результатов электрофореза, количественной оценки уровня генетического и биохимического полиморфизма	основные компьютерные программы для математической обработки данных о генетической изменчивости	лекции	контрольная работа
Умеет: давать количественную оценку генетической изменчивости исходя из результатов электрофореза и полиморазной цепной реакции	давать количественную оценку генетической изменчивости исходя из результатов электрофореза и полиморазной цепной реакции	соотносить полученные оценки изменчивости со средними показателями для данной группы организмов и данного вида маркеров	объяснять полученные значения показателей генетической изменчивости исходя из свойств маркеров и разрешающей способности метода	лабораторные занятия	защита лабораторных работ
Владеет: основными методами изучения биохимического и генетического полиморфизма, методами математической обработки данных электрофореза	основными приемами проведения электрофореза биомолекул в гелях, постановки полимеразной цепной реакции	основными методами изучения биохимического и генетического полиморфизма, методами математической обработки данных электрофореза	способностью подбирать маркеры, методы и условия проведения электрофореза и полимеразной цепной реакции для решения конкретных задач, методами математической обработки данных электрофореза с использованием специализированных компьютерных программ	лабораторные занятия	защита лабораторных работ, творческие задания

2. Структура и трудоемкость дисциплины.