Партнерка на США и Канаду по недвижимости, выплаты в крипто
- 30% recurring commission
- Выплаты в USDT
- Вывод каждую неделю
- Комиссия до 5 лет за каждого referral
Структура Т-РНК соответствующая Аргинину из Thermus Thermophilus
Работу провёл: Долгов Михаил____
студент ФББ 2 курс
Кратко о проведённой работе:
Нам было дано название т-РНК и было поручено провести анализ вторичной структуры, а так-же указать внутримолекулярные контакты поддерживающие третичную структуру.
Для выполнения этого задания я извлёк соответствующую т-РНК в fasta формате из банка данных PDB. (fasta формат)
А так же в PDB формате. Впоследствие ипользовали эти данные анализировали данную т-РНК.
Используя программу find_pair из пакета 3dna я нашел спирали в молекуле т-РНК, которые использовались для построения вторичной структуры молекулы. Ниже приведена первичная структура РНК в которой раскрашены спирали. У каждой спирали индивидуальный цвет – для удобства построения вторичной структуры.
CGGGGAGUAGCGCAGCCCGGUAGCGCACCUCGUUCGGGACGAGGGGGGCGCUGGXXCAGAUCCAGUCUCCCCGACCA
Далее я построил вторичную структуру используя вышеизложеные данные:
Водородные связи образующие спирали
Таблица неканонических пар
| 3’ A C C 5’ A C --- G G --- C G --- C G --- C G --- C A --- U CGA U G --- C U A C CGCG A UGACC G C | | | | | | | | | A G GCGC GC GCUGG C GUA A ---GGG X X C --- G C --- G U --- A C --- G G --- C U --- A U G C G G Синим обозначены нестандартные пары нуклеотидов. Красным обозначен антикодон |
Ниже представленна наилучшая вторичная структура, полученная программой mfold.
Обсуждение.
L-образная структура тРНК поддерживается за счет образованя неканонических водородных связей между нуклеотидами разных петель. Это видно на изображенной выше вторичной стуктуре тРНК. А подтвердить это можно если рассмотреть в программе RasMol.
Как известно тРНК переносят аминокислоты. Молекулы тРНК имеют специфическое строение напоминающее латинскую букву L. Эта форма позволяет добираться до кодона находящегося внутри рибосомы.
Сопроводительные материалы. В файле 1H4Q. spt содержится скрипт для Rasmol, который позволяетрасмотреть основные элементы структуры тРНК.
