Вопросы к коллоквиуму 2 весеннего семестра 1 курса МЛ
Экспрессия генов прокариот и эукариот
Определение гена. Строение генов эукариот. Экзон-интронная структура характерна для генов:- прокариот эукариот вирусов бактерий митохондрий млекопитающих
· энхансер,
· сайленсер,
· инсулятор,
· цис-элементы,
· транс-факторы
Отличия транскрипции в клетках прокариот и эукариот Инициация транскрипции генов прокариот. Процессинг РНК прокариот Процессинг РНК эукариот Какая РНК является двухцепочечной? Дайте определение понятий:· Промотор
· Точка старта (+1)
· Терминатор
· Холофермент РНК-полимераза
· ρ-фактор
· σ-фактор
· Индуктор
· Аттенюатор
Структура минимального фермента РНК-полимеразы, структура холофермента РНК-полимеразы Связывание ДНК-матрицы:· Образование открытого двойного комплекса
· Образование открытого тройного комплекса
Конститутивные и индуцибельные гены. Определение оперона. Структура оперона: оператор, индуктор, регуляторный ген, корепрессор. Инициация транскрипции у прокариот, стадии σ-фактора. Терминация транскрипции, функции ρ-фактора. Промоторы прокариот и эукариот, отличия. Инициация транскрипции генов эукариот, транс-факторы и цис-элементы. Модель lac-оперона. Регуляция экспрессии генов в присутствии и отсутствии лактозы. Строение и регуляция транскрипции trp-оперона. Аттенюатор, строение и функции. Энхансер, сайленсеры, инсуляторы – определение и функции. Этапы процессинга мРНК – кэпирование, сплайсинг, полиаденилирование. Инициация трансляции у прокариот Элонгация трансляции Терминация трансляции. Регуляция экспрессии генов эукариот. Организация геномов вирусов. Организация генома прокариот. Структурная организация хромосом эукариот:· нуклеосома, нуклеомеры, фибрилла, хромомеры, хроматин.
· не способны к автономной репликации
· существуют в интегрированном состоянии
· фрагменты ДНК с непостоянной локализацией в геноме
· кодируют белок для транспозиции
Структура транспозонов. Структура IS - элемента. Последовательности-мишени – это короткие геномные последовательности ДНК, между которыми встраиваются транспозоны Что такое транспозаза? Что такое ретротранспозоны.Задача 1. Первичный транскрипт гена муковисцидоза состоит из 250 000 рибонуклеотидов, его зрелая мРНК содержит 6 129 нуклеотидов. Транслируемый белок включает 1480 аминокислот.
Вопросы:
- Объясните различия в размерах первичного транскрипта и зрелой мРНК. Определите процентное соотношение кодирующих и некодирующих участков гена муковисцидоза. Сколько нуклеотидов необходимо для кодирования 1480 аминокислот. Дайте объяснение несоответствия размеров первичного транскрипта, зрелой мРНК и количества аминокислот в транслируемом полипептиде.
Задача 2. Первичный транскрипт гена овальбумина содержит 7700 нуклеотидов, однако, зрелая мРНК, которая транслируется в рибосоме, содержит 1872 нуклеотдтида.
Вопросы:
- Объясните различия в размерах первичного транскрипта и зрелой мРНК. Составьте схему процессинга пре - мРНК, зная, что ген овальбумина цыпленка включает 8 экзонов и 7 интронов.
Задача 3.Среди указанных последовательностей ДНК найдите палиндромы:



