Супрамолекулярные образования могут быть охарактеризованы пространственным расположением своих компонентов, их архитектурой, "супраструктурой", а также типами межмолекулярных взаимодействий, удерживающих компоненты вместе. Супрамолекулярные ансамбли обладают вполне определенными структурными, конформационными, термодинамическими, кинетическими и динамическими свойствами. В них могут быть выделены различные типы взаимодействий, различающиеся своей силой, направленностью, зависимостью от расстояний и углов: координационные взаимодействия с ионами металлов, электростатические силы, водородные связи, ван-дер-ваальсовы взаимодействия, донорно-акцепторные взаимодействия и т. д. Сила взаимодействий может варьировать в широком диапазоне — от слабых или умеренных (водородные связи) до сильных и очень сильных (координационные связи с металлом). За счет слабых взаимодействий образуются ассоциаты, устойчивость которых сравнима с устойчивостью комплексов фермент — субстрат. Из-за сильных взаимодействий возникают ассоциаты, в которых одна-единственная связь с металлом обеспечивает такую же (или даже более высокую) устойчивость, как устойчивость комплексов антиген — антитело, связанных множеством отдельных взаимодействий. Однако в целом межмолекулярные взаимодействия слабее, чем ковалентные связи, так что Супрамолекулярные ассоциаты менее стабильны термодинамически, более лабильны кинетически и более гибки динамически, чем молекулы. Таким образом, супрамолекулярная химия имеет дело с "мягкими связями" и относится к "мягкой химии".
Поскольку термин "лиганд", используется в самых различных контекстах, компоненты супрамолекулярных ассоциатов было предложено называть рецептор (ρ) (гесерtоr) и субстрат (substrate), где субстрат (ы) — меньший (е) по размеру компонент (ы), вступающий (е) в связь. В этой терминологии нашла отражение связь супрамолекулярной химии с биологией, в которой значительное место занимает рассмотрение структурно и функционально определенных взаимодействий рецептор — субстрат. Данная терминология легко переносима из одного языка в другой. Термины соединение включения, клатрат и соединение типа гость — хозяин, характеризуют соединения, существующие только в твердом состоянии и не являющиеся в строгом смысле слова дискретными супермолекулами, хотя и относящиеся к твердым супрамолекулярным ансамблям.
Селективное связывание определенного субстрата σ и его рецептора ρ с образованием супермолекулы σρ происходит в результате процесса молекулярного распознавания (molecular recognition). Если помимо центров связывания рецептор содержит также реакционноспособные функциональные группы, он может влиять на химические превращения на связанном с ним субстрате, выступая в качестве супрамолекулярного реагента или катализатора. Липофильный, растворимый в мембранах рецептор может выступать в роли носителя (саrrier), осуществляя транспорт, перенос) связанного субстрата.
Таким образом, молекулярное распознавание, превращение, перенос — это основные функции супрамолекулярных объектов. Более сложные функции могут выполняться за счет скоррелированного действия одновременно нескольких фрагментов, участвующих в связывании, в политопном со-рецепторе (ро1уtорiс согесер1оr). В сочетании с организованными полимолекулярными ансамблями и фазами (пленки, мембраны, везикулы, жидкие кристаллы и т. д.) функциональные супермолекулы могут быть использованы для развития молекулярных и супрамолекулярных устройств. Современный передовой край исследований — это изучение самопроцессов— таких как, самоассоциация, самоорганизация, воспроизведение, или репликация — и создание программируемых супрамолекулярных систем. Перечисленные явления предполагают наличие молекулярной информации и способность ее считывания. Последний термин вводит понятие, ставшее одним из краеугольных камней супрамолекулярной химии.
Особо следует остановиться на использовании терминов "супрамолеку-лярный" и "супермолекула". Концепция супрамолекулярной химии стала центром притяжения, объединяющим те области науки, которые ранее развивались независимо и вдруг спонтанно нашли свое место в рамках супрамолекулярной химии. С одной стороны, термин "супрамолекулярный" ранее использовался, в частности, для описания архитектуры сложных полипептидов и организованных ансамблей, а с другой — в теоретической химии расчетная процедура, при которой молекулярные ассоциаты, подобные димеру из молекул воды, рассматриваются как единое целое, известна как "супермолекулярное приближение". Принимая во внимание существование и независимое употребление этих терминов, можно предложить использовать термин "супрамолекулярная химия" как более общий, охватывающий химию всех типов супрамолекулярных ансамблей, от хорошо определенных супермолекул до протяженных, более или менее хорошо организованных полимолекулярных ассоциатов. Термин "супермолекулярная химия" предлагается считать более узким, относящимся только к собственно супермолекулам.
Супрамолекулярную химию можно в таком случае разделить на две широкие, частично перекрывающиеся области, в которых рассматриваются соответственно:
1) супермолекулы — хорошо определенные, дискретные олигомолекулярные образования, возникающие за счет межмолекулярной ассоциации нескольких компонентов (рецептора и субстрата(ов)) в соответствии с некоторой "программой", работающей на основе принципов молекулярного распознавания;
2) супрамолекулярные ансамбли — полимолекулярные ассоциаты, возникающие в результате спонтанной ассоциации неопределенно большого числа компонентов в специфическую фазу, характеризуемую более или менее определенной организацией на микроскопическом уровне и макроскопическими свойствами, зависящими от природы фазы (пленка, слой, мембрана, везикула, мицелла, мезоморфная фаза, кристалл и т. д.).
Таким образом, супрамолекулярная химия охватывает и позволяет рассмотреть с единых позиций все виды молекулярных ассоциатов, от минимально возможного (димер) до наиболее крупных (организованных фаз). Продолжая сравнение с языком, можно сказать, что полимолекулярный супрамолекулярный ассоциат — это "книга"
Появление понятий супрамолекулярной химии привело к введению новых и переоценке старых терминов, описывающих классы соединений либо типы их свойств. По мере того как новая дисциплина утверждалась, происходило смещение объектов и целей исследований — от структур и свойств к системам и функциям.
Выбор названий и обозначений для объектов супрамолекулярной химии, супермолекул вызывает некоторые трудности. Сами рецепторы и субстраты — ковалентные структуры, названия которых подчиняются правилам Женевской номенклатуры. В то же время существует необходимость выработать некоторые систематические правила для описания связности компонентов в супрамолекулярном ансамбле. В качестве исходной точки в разработке таких правил можно взять номенклатуру, принятую в координационной химии переходных металлов. Например, могут быть использованы такие обозначения, как координирующий атом, координированные группы или мостиковые лиганды.
Высокая селективность процессов молекулярного распознавания имеет, конечно, стереохимическую природу. Таким образом, мы можем определить супрамолекулярную стереохимию, охватывающую объекты от супермолекул до полимолекулярных ансамблей. Различное пространственное расположение компонентов супермолекулы по отношению друг к другу может приводить к возникновению супрамолекулярной стереоизомерии. Возможность взаимных превращений супрамолекулярных стереоизомеров будет определяться взаимодействиями, удерживающими их вместе, а именно изменением энергии межмолекулярных взаимодействий при изменении расстояний и углов. Так мы приходим к межмолекулярному конформационному анализу, подобно тому как, возможен внутримолекулярный конформационный анализ. Назрела необходимость собрать в единое целое теоретические подходы и экспериментальные результаты в этой области. Специальные аспекты супрамолекулярной хиралъности касаются стереоселективности при связывании рецептор — субстрат а также возникновения хиральности при образовании супермолекул (например, супрамолекулярных энантиомеров) и супрамолекулярных ансамблей.
Активное развитие вычислительных методов, направленных на молекулярный дизайн создает основу для развития теоретической супрамолекулярной химии, обладающей способностью не только объяснять, но и предсказывать свойства и явления. В этом направлении уже достигнуты значительные успехи и можно ожидать еще больших при целенаправленном изучении супрамолекулярных явлений (взаимодействия, структуры, динамика, константы ассоциации, эффекты среды и т. д.) совместно экспериментальными и теоретическими методами.
Зарождение и развитие супрамолекулярной химии показывают, как параллельно возникают, развиваются и влияют друг на друга понятия, термины и собственно исследования: новые результаты приводят к появлению новых понятий и требуют введения новых терминов, новые понятия и термины намечают новые линии исследования и открывают творческому воображению новые горизонты.
Создавая язык новой области, следует избегать превращения его в жесткий панцирь, сковывающий воображение. Напротив, необходимо строить этот язык в плодотворном взаимодействии между живым химическим исследованием и его кодированием в номенклатурной системе. В настоящий момент язык супрамолекулярной химии находится в стадии становления, его словарный запас расширяется, его синтаксис развивается, формируются понятия и тривиальные термины. Для того чтобы описывать супрамолекулярные явления единообразно, требуется выработка систематической номенклатуры, которая позволила бы заносить информацию о супрамолекулярных системах в базы данных и извлекать ее из них, как это делается сейчас повсеместно в химической информатике применительно к молекулярным структурам. По мере развития супрамолекулярной химии требуются правила для обозначения типа, числа и способа связывания партнеров, центров связывания, взаимодействий, типов супрамолекулярных архитектур и т. д. Это справедливо также по отношению к пространственно ограниченным системам, таким как самозацепляющиеся структуры или полимолекулярные ансамбли. Назрела необходимость создания единой номенклатуры и терминологии супрамолекулярной химии.
|
Из за большого объема этот материал размещен на нескольких страницах:
1 2 3 4 5 6 |


