Вопросы для подготовки к зачету по курсу
«Экология микроорганизмов»
1) История развития экологической мысли в микробиологии: исследования А. ван Левенгука, Л. Пастера, Р. Коха и его последователей, , М. Бейеринка, , .
2) Влияние температуры на микроорганизмы, кардинальные точки и пределы толерантности микроорганизмов.
3) Психрофильные, психроактивные и мезофильные микроорганизмы.
4) Термофильные микроорганизмы.
5) Механизмы адаптации бактерий к низкой/высокой температуре.
6) Влияние гидростатического давления на микроорганизмы.
7) Понятие о пьезочувствительных, пьезотолерантных и пьезофильных микроорганизмах.
8) Приспособления микроорганизмов к обитанию в условиях повышенного гидростатическогно давления.
9) Влияние видимого света на микроорганизмы. Фотосинтез у микроорганизмов.
10) Фототаксис, фотокинез, фотохромность у микроорганизмов.
11) Фотолизис и понятие о фотосенсибилизаторах.
12) Влияние ультрафиолетового света и ионизирующего излучения на микроорганизмы. Понятие о показателях D37 и D10. Радиорезистентные микроорганизмы.
13) Действие ультразвука на микроорганизмы.
14) Влияние магнитных полей на микроорганизмы. Магнитотаксис. Формирование магнитосом в клетках бактерий.
15) Влияние рН среды на микроорганизмы. Ацидофилы, нейтрофилы и алкалофилы.
16) Приспособления микроорганизмов к значениям рН среды, отличным от нейтрального.
17) Влияние водной активности на микроорганизмы.
18) Основные группы микроорганизмов по отношению к водной активности, в т. ч. определяемой концентрацией NaCl.
19) Общие представления о типах взаимоотношений микроорганизмов (нейтрализм, комменсализм, мутуализм ‑ синтрофия и протокооперация, конкуренция, антагонизм, аменсализм, хищничество, паразитизм).
20) Исследование конкурентных взаимоотношений микроорганизмов в лабораторных условиях. Факторы, влияющие на конкурентные взаимоотношения микроорганизмов.
21) Синтрофия как особый тип взаимоотношений между микроорганизмами. Примеры синтрофных взаимоотношений.
22) Антагонизм и аменсализм: способы борьбы с конкурентами (в т. ч. продукция бактериоцинов).
23) Примеры паразитизма в мире микроорганизмов.
24) Примеры хищничества в мире микроорганизмов: опыты , цикл развития бактерий рода Bdellovibrio.
25) Основные понятия и методы популяционной экологии микроорганизмов.
26) Биопленки, этапы их формирования.
27) Система чувства кворума (quorum sensing) грамотрицательных бактерий Vibrio fisсheri.
28) Системы чувства кворума (quorum sensing) грамотрицательных бактерий Vibrio cholerae.
29) Система чувства кворума (quorum sensing) грамположительных бактерий Staphylococcus aureus.
30) Система чувства кворума (quorum sensing) грамположительных бактерий Bacillus cereus.
31) Микробное сообщество. Трофическая структура микробного сообщества.
32) Организация анаэробного метаногенного сообщества.
33) Циано-бактериальные маты как морфологически оформленное автономное сообщество.
34) Растение как местообитания для микроорганизмов. Понятие о ризосфере, ризоплане, филлосфере и филлоплане.
35) Симбиоз растений семейства бобовых с азотфиксирующими клубеньковыми бактериями. Этапы формирования симбиоза (аттракция, адгезия, формирование инфекционной нити, развитие клубенька).
36) Симбиотические азотфиксирующие актинобактерии рода Frankia и цианобактерии Anabaena.
37) Микориза: эндо - и экзомикориза, везикулярно-арбускулярная и арбускулярная микориза.
38) Фитопатогенные микроорганизмы, факторы вирулентности.
39) Особенности паразитизма агробактерий.
40) Фитопатогенные грибы.
41) Ответная реакция растения на проникновение фитопатогенов.
42) Влияние микроорганизмов на процесс метаморфоза беспозвоночных животных.
43) Внутриклеточные симбионты членистоногих.
44) Симбиоз глубоководных беспозвоночных животных (погонофор, моллюсков) с сероокисляющими и метанокисляющими микроорганизмами.
45) Колонизация светящихся органов морских беспозвоночных бактериями Vibrio fischeri.
46) Принципы отбора образцов почвы и осадков.
47) Принципы отбора проб воды и воздуха.
48) Проблемы, связанные с некультивируемыми видами и некультивируемыми формами бактерий. Методы «реанимации» некультивируемых форм бактерий.
49) Флюоресцентно-микроскопические методы учета микроорганизмов. Использование флюоресцентных красителей для подсчета общего количества микроорганизмов в среде, а также для выявления и учета живых активных клеток.
50) Отбор и исследование проб с помощью стекол обрастания (стекла обрастания по Холодному, плоскопараллельные капилляры Перфильева).
51) Молекулярно-генетические методы исследования микробного разнообразия в природных пробах (подходы для изучения фракции генов 16S рРНК, прямое секвенирование метагеномной ДНК).
52) Назначение метагеномного, метатранскриптомного и метапротеомного анализов в экологии микроорганизмов. Сложности, возникающие при проведении этих анализов.
