Приложение

к протоколу от 06 июня 2011 г. № 93 заседания Конкурсной комиссии Министерства образования и науки Российской Федерации № 000-1.2-2.2-ИР1 по проведению открытых конкурсов на право заключения государственных контрактов на выполнение научно-исследовательских и опытно-конструкторских работ в рамках мероприятий 1.2 и 2.2 федеральной целевой программы «Исследования и разработки по приоритетным направлениям развития научно-технологического комплекса России на 2007-2012 годы», утвержденной постановлением Правительства Российской Федерации от 17 октября 2006 г. № 000

Условия исполнения контракта, предложенные участниками

№ п/п

Регистрационный номер заявки

Наименование (для юридического лица), фамилия, имя, отчество (для физического лица) участника размещения заказа

Квалификация участника

Цена контракта,
млн. рублей

Сроки выполнения работ

Качественные характеристики создаваемой научно-технической продукции, содержащиеся в заявке

Лот № 1. 2011-1.2-512-064. Исследование влияния соединений микробного происхождения на обмен веществ у человека в норме и при патологии.

1

2011-1.2-512-064-009

Государственное образовательное учреждение высшего профессионального образования Ульяновский государственный университет

Представленные материалы содержат информацию о квалификации участника

3,8

С даты заключения государственного контракта по 31.10.2012

2.1 Технические характеристики создаваемой научно-технической продукции

2.1.1 Предложения по методам и способам решения задач

Основными методами исследования будут:

- культуральный метод, применяемый для изучения микрофлоры влагалища;

- определение ДДМ антибиотикорезистентности микрофлоры влагалища;

- выделение микоплазм;

- определение антибиотикорезистентности;

- микроценоз влагалища;

- полимеразно–цепная реакция микоплазм;

- лабораторное выявление урогенитальных инфекций.

При выполнении НИР условия и качество работ будет соответствовать приказам МЗ СССР № 000 от 22.04.85, МЗ РФ № 000 и № 000 от 01.01.2001, г., а также методическим указаниям 4.2.1890-04.2004.

Видовой состав будет определен с помощью коммерческих тест-систем фирмы «Лахема (Чехия), набора СИБ для дифференциации коринебак-терий, набора №2 СИБ для дифференции энтеробактерий и определителя бактерий Берджи. Кроме этого будут применяться необходимые среды.

2.1.2 Предложения по составу создаваемой научно-технической продукции

Будет разработана комплексная программа лечения нарушений репродуктивного здоровья и микроценоза влагалища у женщин с МС и клинико-лабораторная оценка эффективности его коррекции. Данная программа, помимо традиционного подхода, будет включать предварительную коррекцию массы тела, в том числе редукцию массы тела с помощью гипокалорийной диеты, физических нагрузок и применения конкурентных ингибиторов липазы, метаболическую терапию с включением липотропных, мембранотропных препаратов, антиоксидантов, а также препаратов, снижающих инсулинорезистентность, и в заключении санацию микроценоза влагалища антибактериальными препаратами с учетом чувствительности микрофлоры и восстановление нормоценоза с помощью пробиотиков. Кроме этого, программа будет включать коррекцию гормональных и иммунных нарушений.

Будет рассмотрен вопрос об эффективности проведения у женщин с метаболическим синдромом (МС) скринингового исследования микроценоза влагалища. Будет проведена комплексная оценка репродуктивного здоровья у женщин с МС на молекулярном, органном и системном уровнях. На основании клинико-лабораторных данных и результатов микробиологического исследования будут определены особенности нарушений микроценоза влагалища при метаболическом синдроме. Будут исследованы дисбиотические процессы влагалища на предмет метаболических, эндокринных и иммунологических изменений. Будут исследованы вопросы влияния дисбиотических изменений влагалища на нарушения показателей репродуктивного здоровья в виде ДМК, гипоменструального синдрома, хронических воспалительных процессов матки и придатков, а также гиперплазии эндометрия.

Будут разработаны патогенетически обоснованные методы коррекции нарушений микроценоза влагалища у женщин с нарушениями репродуктивного здоровья при МС.

2.1.3 Предложения по достижению технико-экономических показателей создаваемой научно-технической продукции

Микрофлора влагалища является важнейшим индикатором состояния здоровья, а ее количественный и качественный состав отражает состояние половой системы. Регуляция видового и количественного состава микрофлоры вагинального биотопа в значительной мере зависит от иммунной, эндокринной систем организма и особенностей процессов обмена веществ. В случае нарушения одного из этих звеньев микроэкология влагалища изменяется, что может способствовать развитию воспалительных процессов генитального тракта, что снижает репродуктивную способность женщин.

Проводимые исследования позволят разработать патогенетически обоснованные методы коррекции нарушений микроценоза и продуктов его жизнедеятельности при нарушениях репродуктивного здоровья при МС. Данные методы позволят не только повысить качество жизни у 30% женщин с нарушениями обмена веществ, но и снизить частоту нарушений у них показателей репродуктивного здоровья.

2.2 Предложения по достижению индикаторов и показателей технического задания

Количество завершенных проектов научно-исследовательских работ по Программе, перешедших в стадию опытно-конструкторских работ с целью разработки конкурентоспособных технологий для последующей коммерциализации – 1. В рамках проекта будет разработана комплексная программа лечения нарушений репродуктивного здоровья и микроценоза влагалища у женщин с МС. После клинико-лабораторной апробации она может быть рекомендована для внедрения в практику лечения МС с целью восстановления нормоценоза с помощью пробиотиков и антибактериальными препаратами с учетом чувствительности микрофлоры, а также коррекции гормональных и иммунных нарушений.

В рамках проекта планируется 2 защиты диссертаций: аспиранта по теме «Микробы-ассоцианты при генитального тракта при метаболическом синдроме и их влияние на репродуктивное здоровье женщин» и аспиранта по теме «Особенности симбиотического взаимодействия микрофлоры генитального биотопа при нарушениях метаболизма».

По результатам исследований планируется опубликовать 8 статей в журнал списка ВАК, а также оформить результаты интеллектуальной деятельности в виде 2 патентов.

К работе планируется привлечь не менее 8 молодых специалистов и увеличить их долю от общей численности до 45-50%. Кроме этого планируется привлечь софинансирование не менее 15% от бюджетного финансирования.

2

2011-1.2-512-064-018

Учреждение Российской академии медицинских наук Научно-исследовательский институт общей реаниматологии имени РАМН

Представленные материалы содержат информацию о квалификации участника

6,4

С даты заключения государственного контракта по 31.10.2012

В НИР будут определены метаболические профили низкомолекулярных ароматических (природных) соединений методом ГХ-МС анализа в сыворотке крови человека в норме и их изменения при критических состояниях. Доказано их микробное происхождение и влияние на регуляцию метаболизма человека. Предложены методы и способы диагностики и мониторирования для клинической практики.

3

2011-1.2-512-064-019

Федеральное государственное унитарное предприятие "Государственный научно-исследовательский институт особо чистых биопрепаратов" Федерального медико-биологического агентства

Представленные материалы содержат информацию о квалификации участника

5,4

С даты заключения государственного контракта по 31.10.2012

В результате выполнения НИР будет установлена степень влияния соединений микробного происхождения на обмен веществ у человека в норме и при патологии посредством исследования метаболического профиля крови.

Будут разработаны методики получения фингерпринтов крови и выдыхаемого воздуха с использованием отечественного хромато-масс-спектрометрического оборудования; подготовлены базы данных – фингерпринты крови и выдыхаемого воздуха больных и здоровых людей до и после курса приема БАД и препаратов, содержащих бактериальные метаболиты (из числа зарегистрированных надлежащим образом); разработаны проекты ТЗ «Разработка формы лекарственного препарата (БАД) на основе регуляторных бактериальных экзометаболитов» или «Использование бактериальных экзометаболитов для лечения больных с нарушением обмена веществ»; представлен лабораторный регламент «Приготовление комплекса метаболитов бактериального происхождения».

Будет подготовлен отчет о работе по теме «Исследование влияния низкомолекулярных регуляторных экзометаболитов пробиотических бактерий на метаболический профиль и фингерпринт крови».

Лот № 2. 2011-1.2-512-065. Разработка макета диагностической тест-системы для определения содержания панели аллерген-специфичных иммуноглобулинов в образце сыворотки крови человека.

4

2011-1.2-512-065-001

Общество с ограниченной ответственностью "Вега"

Представленные материалы содержат информацию о квалификации участника

10,5

С даты заключения государственного контракта по 31.10.2012

Диагностическая тест-система для проведения in vitro скрининга по панели аллерген-специфических иммуноглобулинов класса Е в образце сыворотки крови человека.

Система включает в себя:

1) платформу для иммобилизации аллергенов и проведения анализа в формате микрочипа;

2) панель из не менее 25 очищенных и рекомбинантных аллергенов для осуществления компонент-специфической аллергодиагностики;

3) детектирующий компонент системы на основе рекомбинантного высокоаффинного клеточного анти-IgE рецептора.

Разрабатываемая тест-система будет удовлетворять следующим техническим требованиям:

- нижний детектируемый порог концентрации specIgE – 0,35 МЕ/мл;

- Динамический диапазон 0,35-100 МЕ/мл для specIgE и 25-1000 ME/мл для общего IgE;

- КВ не более 15% при 10-кратной постановке анализа.

5

2011-1.2-512-065-008

Учреждение Российской академии наук Институт молекулярной биологии им. РАН

Представленные материалы содержат информацию о квалификации участника

9,8

С даты заключения государственного контракта по 31.10.2012

В рамках настоящего проекта впервые будет создан макет диагностической тест-системы, предназначенной для количественного определения панели (не менее тридцати) аллерген-специфичных иммуноглобулинов и уровня общего иммуноглобулина Е (IgE) в одном образце сыворотки крови человека на биологическом микрочипе. Биочип будет содержать ячейки заданного объема (0,1 нл), полученные методом фотоиндуцированной полимеризации, в которых будут ковалентно иммобилизованы аллергены. Биочип будет также содержать ячейки с иммобилизованными антителами против иммуноглобулина Е человека. Биочип позволит проводить одновременное определение уровней не менее 30 специфических sIgE и общего IgE в одном образце крови объемом 50 мкл в формате 1 биочип – 1 пациент. В качестве метода будет использован иммуноанализ с флуоресцентной регистрацией сигнала.

На начальном этапе выполнения проекта будет создана база иммунореагентов: очищенные природные и рекомбинантные аллергены, моноклональные антитела против человеческих IgE, не имеющие перекрестных реакций с иммуноглобулинами других классов. Далее будет осуществлен подбор условий проведения иммуноанализа для индивидуальных аллергенов и их смесей, что необходимо для разработки протокола одновременного количественного анализа аллерген-специфических sIgE и общего IgE на биочипе. В ходе выполнения проекта будут определены основные аналитические характеристики разработанного макета тест-системы и подтверждена эффективность метода при проведении одновременного количественного анализа панели аллерген-специфичных sIgE и общего IgE в верифицированных сыворотках крови (не менее 100 шт.).

Результаты проекта предусматривают возможность патентной защиты в отношении способа многопараметрического количественного анализа аллерген-специфичных иммуноглобулинов класса Е. Полученные в ходе выполнения проекта результаты должны послужить основой для создания первой диагностической тест-системы для одновременного количественного анализа панели аллерген-специфичных иммуноглобулинов на основе отечественной технологии биочипов. Выполнение настоящего проекта обеспечит достижение научных результатов мирового уровня в области аллергодиагностики.

6

2011-1.2-512-065-013

Санкт-Петербургское государственное учреждение здравоохранения "Городская больница №40 Курортного административного района"

Представленные материалы содержат информацию о квалификации участника

12

С даты заключения государственного контракта по 31.10.2012

В результате реализации проекта будет разработана технологическая платформа для исследований и создания комплекса продукции лечебно-диагностического назначения для борьбы с аллергическими заболеваниями, обеспечивающая поиск новых аллергенов, создание рекомбинантных аллергенов и диагностических тест-систем для определения аллерген-специфичных иммуноглобулинов класса Е, в т. ч. по технологии мультипараметрического анализа, биофармацевтических лекарственных средств для иммунотерапии аллергий на основе рекомбинантных белков и генотерапевтических конструкций. Будет разработан макет диагностической тест-системы по технологии xMAP для одновременного определения содержания не менее 30 аллерген-специфичных иммуноглобулинов класса Е и уровня общего IgE в образце сыворотки крови человека. Выбор аллергенов для тест-системы будет основан на сравнительном исследовании коммерчески доступных аллергенов. Будет разработана биотехнология получения рекомбинантных аллергенов, в т. ч. будут разработаны синтетические гены с оптимизированным для прокариотической экспрессии кодоновым составом, созданы бактериальные продуценты, синтезированы, очищены и подвергнуты рефолдингу не менее двух рекомбинантных аллергенов для создания на их основе диагностической тест-системы. При создании данных рекомбинантных белков будут применены подходы, позволяющие в дальнейшем использовать их для разработки препаратов для кожных проб и специфической иммунотерапии аллергии. Будет освоена технология Plaque immunoassay и осуществлен поиск новых аллергенов.

7

2011-1.2-512-065-015

Учреждение Российской академии наук Институт биохимии им. РАН

Представленные материалы содержат информацию о квалификации участника

9,8

С даты заключения государственного контракта по 31.10.2012

Работы направлены на создание диагностической тест-системы для одновременного определения содержания в сыворотки крови человека общего уровня иммуноглобулинов Е и панели (не менее 20) аллерген-специфичных иммуноглобулинов. Предлагаемое методическое решение основано на использовании принципа иммунохроматографии, что позволяет осуществлять тестирование путем непосредственного контакта образца сыворотки и тест-полоски с предварительно нанесенными специфическими реагентами без дополнительного оборудования, реактивов и манипуляционных стадий. Сочетание иммунохроматографии с видеоцифровым документированием результатов анализа и количественной обработкой изображений обеспечит возможность сочетать экспрессность диагностики (время – не более 15 мин., возможность проведения анализа непосредственно на месте отбора пробы) с получением достоверных количественных данных об уровнях общего IgE и аллерген-специфичных IgE. Высокая производительность анализа и минимизация расхода реагентов достигается благодаря применению оригинального метода точечного нанесения аллергенов на мембранный носитель. Ковалентное связывание аллергенов с мембраной обеспечивает воспроизводимость результатов анализа. Планируется реализация тест-системы как открытой системы с варьируемой геометрией нанесения зон специфического связывания, что позволяет увеличивать число одновременно определяемых параметров – антител к аллергенам разных классов. Будет экспериментально охарактеризована стабильность характеристик тест-систем при хранении, обеспечивающая срок годности тест-систем не менее 18 месяцев. Разработка методических решений в рамках проекта и подготовка технического задания на ОКР будет проводиться с учетом особенностей производственной базы заявителя и опыта разработки и коммерциализации иммунохроматографических систем для определения других биологически активных соединений.

8

2011-1.2-512-065-016

Федеральное государственное бюджетное учреждение "Государственный научный центр "Институт иммунологии" Федерального медико-биологического агентства

Представленные материалы содержат информацию о квалификации участника

9,8

С даты заключения государственного контракта по 31.10.2012

Будет создан макет диагностической тест-системы, предназначенной для одновременного определения содержания не менее двадцати аллерген-специфических иммуноглобулинов класса Е (sIgE) и уровня общего IgE в образце.

Для этого будет подобрана панель аллергенов (не менее двадцати) входящих в состав не менее трех из наиболее часто встречающихся групп аллергенов. Выбранные аллергены будут ковалентно иммобилизованы на носителе.

Будет создан серобанк позитивных и негативных сывороток, содержащих специфический IgE к используемым аллергенам.

Будет проведена оценка эффективности разработанного макета диагностической тест-системы и определены ее технические характеристики.

Будут проведены исследовательские испытания макета тест-системы на сыворотках больных аллергическими заболеваниями в сопоставлении с результатами, полученными с использованием коммерческих наборов.

9

2011-1.2-512-065-017

Учреждение Российской академии медицинских наук Научно-исследовательский институт вакцин и сывороток им. РАМН

Представленные материалы содержат информацию о квалификации участника

6,1

С даты заключения государственного контракта по 31.10.2012

Стандарты диагностики пищевой аллергии диктуют необходимость определения специфических к белкам пищи IgE-антител. Однако клинически проблема пищевой аллергии не всегда связана с IgE-обусловленной атопической реактивностью. Четким диагностическим критерием может быть определение IgG/IgG4- антител к тем же пищевым белкам, определяющим пищевую непереносимость иной причины. В этой связи разработка метода, позволяющего определить в одном образце сыворотки антитела 3-х типов к одним и тем же аллергенам будет иметь практическое диагностическое значение.

Для более углубленной диагностики аллергических заболеваний в тех случаях, когда внешние экзоаллергены не выявляются, есть необходимость определять IgE-, IgG/IgG4 - ответ к тканевым антигенам для оценки аутоиммунитета, определяющего фенотип и тяжесть заболевания.

10

2011-1.2-512-065-021

Учреждение Российской академии наук Институт биоорганической химии им. академиков и РАН

Представленные материалы содержат информацию о квалификации участника

8,4

С даты заключения государственного контракта по 31.10.2012

Будет создан макет диагностической тест-системы, предназначенной для одновременного определения содержания панели аллерген-специфичных иммуноглобулинов класса Е (sIgE) и уровня общего IgE в образце, соответствующей лучшим мировым образцам и значительно превосходящей по стоимости, удобству в использовании, функциональности имеющиеся российские аналоги, а также ряд оригинальных вспомогательных методов и документов.

На основе данного макета будет создана пробная партия тест-наборов и проведена серия диагностических испытаний с сыворотками пациентов.

Будет создана специализированная база знаний по теме «Методы лабораторного анализа аллерген-специфичных антител класса IgE в крови», имеющая как научное, так и педагогическое значение.

Будет разработана инновационная концепция программно-аппаратного комплекса для автоматической обработки результатов анализа, позволяющая снизить затраты и повысить качество аллергодиагностических процедур, а также создающая предпосылки для широкого распространения в России высококонкурентоспособных аллергодиагностических комплексов, поставляющихся «под ключ».

11

2011-1.2-512-065-023

федеральное государственное образовательное учреждение высшего профессионального образования "Московская государственная академия ветеринарной медицины и биотехнологии имени "

Представленные материалы содержат информацию о квалификации участника

5,9

С даты заключения государственного контракта по 31.10.2012

Будет создан прототип принципиально новой диагностической тест-системы на основе рекомбинантных белков, позволяющий в реальном времени детектировать связывание аллергена с антителом. Система позволит решить важнейшую прикладную задачу: создать платформу для конструирования систем клинической диагностики, выявляющих любое анализируемое вещество в течение нескольких секунд.

12

2011-1.2-512-065-026

Общество с ограниченной ответственностью

Представленные материалы содержат информацию о квалификации участника

6

С даты заключения государственного контракта по 31.10.2012

В ходе НИР будет создан макет не имеющей аналогов на российском рынке тест-системы для одновременного определения панели из 20 аллерген-специфических иммуноглобулинов E (IgE) и общего IgE в одном образце сыворотки крови пациента, а также опытная партия тест-систем, произведённая в соответствии с макетом.

Также будет разработан ряд вспомогательных документов, необходимых для производства и использования тест-системы.

Будет показано существенное преимущество разрабатываемой тест-системы по сравнению с функциональными аналогами по ряду ключевых для коммерциализации в России признаков, включая себестоимость анализа на один специфический IgE, стоимость покупки / аренды необходимой для диагностики аппаратуры, чувствительность анализа, техническую простоту теста, эффективность формата панельной диагностики с варьирующимся составом панелей.

К окончанию НИР будут определены перспективы коммерциализации тест-системы на российском рынке и созданы условия для перехода к стадии производства в 2014 – 2015 году.

Лот № 3. 2011-1.2-512-066. Разработка микробицидов с антивирусными свойствами.

13

2011-1.2-512-066-006

Федеральное государственное бюджетное учреждение "Научно-исследовательский институт вирусологии им. " Министерства здравоохранения и социального развития Российской Федерации

Представленные материалы содержат информацию о квалификации участника

6

С даты заключения государственного контракта по 31.10.2012

Разработка 15 комбинированных микробицидов, обладающих противовирусной активностью в отношении трех вирусов: ВИЧ, ВПГ и ЦМВ.

14

2011-1.2-512-066-007

Учреждение Российской академии наук Институт биоорганической химии им. академиков и РАН

Представленные материалы содержат информацию о квалификации участника

2

С даты заключения государственного контракта по 31.10.2012

Проведение НИР в соответствии с мировым уровнем, полная характеризация полученной научно-технической продукции.

Индекс селективности противовирусных соединений увеличен в 5 раз, а противовирусная активность увеличена в 10 раз по сравнению с техническим заданием.

(полные сведения указаны в приложениях 1 и 2 к Форме 3)

15

2011-1.2-512-066-010

Общество с ограниченной ответственностью "ИММУНОМИКА"

Представленные материалы содержат информацию о квалификации участника

6,52

С даты заключения государственного контракта по 31.10.2012

Будут разработаны экспериментальные образцы микробицидов в количестве не менее 2 (двух), облада. ющие индексом селективности от 100 и выше, достигающие 90% дозы ингибирования вируса в концентрациях менее 10 мкг/мл и 50% дозы ингибирования вируса в концентрациях менее 1 мкг/мл.

16

2011-1.2-512-066-011

Федеральное государственное бюджетное учреждение "Государственный научный центр "Институт иммунологии" Федерального медико-биологического агентства

Представленные материалы содержат информацию о квалификации участника

6,525

С даты заключения государственного контракта по 31.10.2012

Будут созданы экспериментальные образцы анти-ВИЧ-микробицидов, блокирующие раз-личные стадии жизненного цикла ВИЧ1, на ос-нове полиоксидония и его композиций. Для

этого будет изучено влияния полиоксидония на клетки, чувствительные к заражению ВИЧ1.

Будет выполнена адаптация методов оценки in vitro цитотксических свойств полиоксидония и композиций на его основе. Будут исследованы цитотоксические свойства полиоксидония и его влияние на пролиферативную активность для различных клеточных моделей. Будет подготовлена коллекции вариантов ВИЧ1 с различными биологическими свойствами. Будут стандартизованы методы культивирования и измерения концентрации р24 и получения стандартных вирусных стоков. Будет иссле-дована иммуномодулирующая и антивирусная активности полиоксидония и его композиций in vitro. Будет выполнен скрининг и эпидемио-логическое обследование пациентов СПИД-центров с целью выявления дискордантных пар. Будет подготовлена когорта дискордантных пар. Будет подготовлен комплект нормативной документации для проведения клинических испытаний микробицидов, включающий брошюру исследователя, информацию для добровольца, форму информированного согласия, программу клинических испытаний микробицидов.

17

2011-1.2-512-066-025

Учреждение Российской академии наук Институт микробиологии им. РАН

Представленные материалы содержат информацию о квалификации участника

4,4

С даты заключения государственного контракта по 31.10.2012

Предлагается разработать рекомбинантные штаммы лактобацилл, несущих гены микробицидных пептидов, в том числе дефензинов и цекропинов, обладающих антивирусной активностью. Штаммы будут использованы для энтерального введения с целью предотвращения первичного инфицирования клеток эпителия кишечника. Предполагается, что биологическая активность рекомбинантных штаммов лактобацилл, секретирующих антивирусные пептиды, при исследовании на культурах клеток будет выражаться в инактивации вирусов и патогенной микрофлоры, не оказывая при этом цитотоксического эффекта на клетки кишечника и нормальную микрофлору. Результаты работы найдут применение при разработке противовирусных препаратов, нацеленных на блокировку различных стадий жизненного цикла вирусов с фекально-оральным механизмом передачи.

Лот № 4. 2011-1.2-512-067. Рентгеноструктурные исследования ферментов, представляющих интерес для биомедицины и промышленной биотехнологии.

18

2011-1.2-512-067-003

Учреждение Российской академии наук Институт общей генетики им. РАН

Представленные материалы содержат информацию о квалификации участника

6

С даты заключения государственного контракта по 31.10.2012

В ходе НИР будут проведены кристаллизация и рентгеноструктурные исследования аминогликозидфосфотрансферазы тип VIII (AphVIII), являющейся ключевым элементом тест-систем для скрининга ингибиторов серин-треониновых протеинкиназ. Будет проведена оптимизация уровня экспрессии гена aphVIII в штамме E.coli и наработана экспериментальная партия и получен высокоочищенный препарат исследуемого белка в количестве, достаточном для последующей кристаллизации. Будут доказаны биохимические свойства полученного белка, в частности, активность, pH-стабильность и термостабильность. Будет определена 3D структура белка APHVIII с разрешением не хуже 2,5 ангстрем.

Результаты исследования и решения структур будут депонированы в международный банк данных RCSB.

19

2011-1.2-512-067-004

государственное образовательное учреждение высшего профессионального образования "Кемеровский технологический институт пищевой промышленности"

Представленные материалы содержат информацию о квалификации участника

3,6

С даты заключения государственного контракта по 31.10.2012

Теоретические и экспериментальные исследования в рамках данного проекта будут проведены с учетом всех этапов современной методологии исследования сложных явлений с помощью новейших методов биохимического, физико-химического, структурно-механического анализа, а также методов компьютерной, экспериментальной химии и информационных технологий с применением последних достижений науки и техники, в том числе и разработанных коллективом заявителей.

В результате проведенных исследований будут получены новые знания о методах рентгеноструктурного исследования специфичности фермент-субстратных взаимодействий и локализации связывания активного центра с субстратом при изучении структурных основ протеолитической активности ферментов для терапевтических препаратов.

Полученные в ходе выполнения проекта результаты будут опубликованы в ведущих российских и международных научных журналах. В результате выполнения проекта будет подготовлены лекции и научно-практические занятия по теме проекта для студентов и аспирантов высших научно-образовательных учреждений, соответствующих современным мировым стандартам, а также для стажеров НОЦ из отраслевых и региональных научных институтов (повышение квалификации).

20

2011-1.2-512-067-005

Учреждение Российской академии наук Институт кристаллографии им. РАН

Представленные материалы содержат информацию о квалификации участника

6,598

С даты заключения государственного контракта по 31.10.2012

Данный проект направлен на исследования методами рентгеноструктурного анализа и компьютерного моделирования биомакромолекулярных комплексов уридин фосфорилаз, эндонуклеаз, рибосом иннактивирующих белков 2 типа с биологически активными лигандами, а так же на рациональный компьютерный дизайн новых биологически активных соединений.

Для разработки новых лекарственных препаратов – модуляторов активности уридинфосфорилазы необходимо детальное исследование пространственной организации макромолекулярных комплексов уридинфосфорилаз бактерий и высших организмов методами рентгеноструктурного анализа при атомном разрешении и компьютерного моделирования. В ходе выполнения проекта будут:

- Получены высогомогенные препараты исследуемых белков;

- проведена кристаллизация исследуемых биомакромолекул в комплексе с биологически активными соединениями пригодных для рентгенноструктурного анализа;

- Получены рентгенодифракционные наборы с использованием источников синхротронного излучения;

- решена структура комплексов исследуемых белков при атомном разрешении с высокой достоверностью, определяемой принятой совокупностью физических, физико-химических и стереохимических параметров (Rcryst, Rfree, R. M.S. Dbond, R. M.S. Da, точность определения координат по Луззати, DPI);

- На основе методов молекулярного моделирования предполагается создать структурную модель взаимодействия уридин фосфорилаз, эндонуклеаз, рибосом иннактивирующих белков 2 типа из различных источников с используемыми в фармакологии и биотехнологии химическими соединениями и фармакологическими рецепторами клеток эу - и прокариот;

- проведено компьютерное моделирование новых, селективных в отношении рассматриваемых в проекте белков-мишеней, биологически активных соединений.

Основной результат НИР – создание структурной базы и виртуальное конструирование на её основе лигандов и генноинженерных форм уридинфосфорилаз, эндонуклеазы SM, рибосом иннактивирующих белков второго типа перспективных для фармакологии и битехнологии (биоинженерии и биоэлектроники).

Результаты НИР могут быть использованы для проведения опытно-технологических работ, направленных на производство новых биологически активных соединений-ингибиторов ферментов

21

2011-1.2-512-067-012

Учреждение Российской академии наук Институт молекулярной биологии им. РАН

Представленные материалы содержат информацию о квалификации участника

6,2

С даты заключения государственного контракта по 31.10.2012

В рамках настоящего проекта будут и структурно и функционально охарактеризованы мутантная форма рибонуклеазы биназы, комплексы обратной транскриптазы ВИЧ с новыми пиримидин-содержащими ингибиторами ненуклеозидной природы и комплексы метионин – гамма-лиазы с суицидальными субстратами – сульфоксидами аналогов цистеина и метионина. Для указанных ферментов будут проведены исследования: функциональных свойств белков: субстратной специфичности, параметров ферментативных реакций, скрининг и оптимизация условий кристаллизации с целью получения высококачественных кристаллов для рентгеноструктурного анализа; решение и уточнение пространственных структур. Кроме того, для комплексов обратной транскриптазы ВИЧ с новыми пиримидин-содержащими ингибиторами ненуклеозидной природы и комплексов метионин – гамма-лиазы с новыми субстратами будет проведено компьютерное моделирование связывания ингибиторов и субстратов с ферментами. В результате выполнения проекта будет получена следующая научно-техническая продукция: пространственные структуры мутантной формы рибонуклеазы биназы, комплексов обратной транскриптазы ВИЧ с новыми пиримидин-содержащими ингибиторами ненуклеозидной природы и комплексов метионин – гамма-лиазы с суицидальными субстратами, ранее не опубликованные в международном банке данных пространственных структур RCSB (www. rcsb. org) с разрешением, допускающим депонирование; протоколы получения мутантной формы рибонуклеазы биназы и обратной транскриптазы ВИЧ, требуемого для структурных исследований качества; протоколы проведения функциональной и физико-химической характеристик исследуемых белков; проект технического задания на проведение НИР.

Полученные данные должны послужить основой для дальнейшей разработки подходов по повышению стабильности и направленному изменению свойств рибонуклеазы биназы как потенциального антиракового препарата, созданию ингибиторов обратной транскриптазы ВИЧ, обладающих активностью в отношении дикого типа вируса и его основных лекарственно-устойчивых форм и разработке принципиально новых антипатогенных средств на основе суицидальных субстратов метионин – гамма-лиазы.

Выполнение настоящего проекта обеспечит достижение научных результатов мирового уровня в части получения пространственных структур ферментов.

22

2011-1.2-512-067-020

Учреждение Российской академии наук Центр "Биоинженерия" РАН

Представленные материалы содержат информацию о квалификации участника

6

С даты заключения государственного контракта по 31.10.2012

Будут выделены и функционально охарактеризованы новые гликолитические ферменты, ориентированные на применение в промышленной биотехнологии. Для этих ферментов методом рентгеноструктурного анализа будут определены пространственные структуры высокого разрешения и разработаны подходы по направленному улучшению функциональных свойств для решения биотехнологических задач. Выполнение НИР обеспечит получение научных результатов мирового уровня в области структурно-функциональной характеристики ферментов.

23

2011-1.2-512-067-022

Общество с ограниченной ответственностью “Инновации и высокие технологии МГУ”

Представленные материалы содержат информацию о квалификации участника

6

С даты заключения государственного контракта по 31.10.2012

В процессе выполнения проекта должны быть получены данные по структурам ферментов, представляющих интерес для биомедицины и промышленной биотехнологии – лакказы и пенициллинацилазы соответственно. Реализация данного комплекса работ позволит создать базу для разработки биокатализаторов с заданными свойствами на основе вышеуказанных ферментов для применения в в медицине (электрохимические биосенсоры третьего поколения на основе лакказы) и промышленной биотехнологии (текстильная и пищевая промышленность, синтез бета-лактамных антибиотиков третьего и четвертого поколений и хиральных соединений, биремедиация почв). Выполнение поисковых научно-исследовательских работ для государственных нужд создаст научно-технический задел и позволит обеспечить ускоренное развитие научно-технологического потенциала Российской Федерации в области биокаталитических, биосинтетических и биосенсорных технологий.

24

2011-1.2-512-067-024

Учреждение Российской академии наук Институт микробиологии им. РАН

Представленные материалы содержат информацию о квалификации участника

5,5

С даты заключения государственного контракта по 31.10.2012

С использованием современных методов молекулярной и структурной биологии, геномики, протеомики и рентгеноструктурного анализа нами будет установлена пространственная структура фибриллярного белка-адгезина бактериофага, обладающего ферментативной активностью – потенциального кандидата для использования в качестве альтернативного антибиотикам нового антибактериального препарата класса энзибиотиков.

Лот № 5. 2011-1.2-512-068. Создание метода генетической паспортизации сортов и гибридных форм пшеницы и/или льна на основании хромосомного маркирования.

25

2011-1.2-512-068-002

Учреждение Российской академии наук Институт цитологии и генетики Сибирского отделения РАН

Представленные материалы содержат информацию о квалификации участника

5,6

С даты заключения государственного контракта по 31.10.2012

В ходе выполнения НИР:

- будет выполнен аналитический обзор современной научно-технической и методической литературы по теме НИР;

- будут созданы хромосомные паспорта сортов и гибридов пшеницы;

- будет разработан план поиска маркеров для генетической паспортизации сортов и гибридных форм пшеницы;

- будет разработана методика генотипирования сортов пшеницы на основании хромосомного маркирования;

- будут разработаны новые молеку-лярно-цитогенетические маркеры для идентификации индивидуаль-ных хромосом и геномов пшеницы, а также функционально значимых районов хромосом на основе вас клонов и повторяющихся последовательностей ДНК

- будет разработана методика идентификации транслокаций и хромосомных перестроек в сортах и гибридах мягкой пшеницы

- будет разработан проект технического задания на проведение прикладной НИР, направленной на использование метода генетической паспортизации сортов и гибридов пшеницы в селекционных процессах.

26

2011-1.2-512-068-014

Учреждение Российской академии наук Институт молекулярной биологии им. РАН

Представленные материалы содержат информацию о квалификации участника

4,8

С даты заключения государственного контракта по 31.10.2012

В результате выполнения проекта впервые будет разработан принципиально новый метод генетической паспортизации сортов и форм мелко - и крупнохромосомных хозяйственно-ценных растений, включая такие важные для России сельскохозяйственные культуры лен и пшеницу, с использованием хромосомного маркирования. Метод позволит составить уникальные «хромосомные паспорта» – «штрих-коды» их генотипов на основе комплекса молекулярно цитогенетических маркеров и способа формализации образной информации, которые будут характеризовать сорта по комплексу признаков генома и наличию чужеродного генетического материала, что перспективно для создания хромосомных баз данных для ряда хозяйственно-ценных видов растений и очень важно для селекции и биотехнологии.

Подписи:

Заместитель председателя
Конкурсной комиссии: ___________

Члены Конкурсной комиссии: ___________

___________

Секретарь Конкурсной комиссии: ___________

Заказчик:

Директор Департамента приоритетных
направлений науки и технологий ___________