2.6.1
- публикации в рецензируемых журналах:
1: Egorov ES, Merzlyak EM, Shelenkov AA, Britanova OV, Sharonov GV, Staroverov
DB, Bolotin DA, Davydov AN, Barsova E, Lebedev YB, Shugay M, Chudakov DM.
Quantitative profiling of immune repertoires for minor lymphocyte counts using
unique molecular identifiers. J Immunol. 2015 Jun 15;194(12):6155-63. doi:
10.4049/jimmunol.1500215. Epub 2015 May 8. PubMed PMID: 25957172.
2: Shugay M, Britanova OV, Merzlyak EM, Turchaninova MA, Mamedov IZ, Tuganbaev
TR, Bolotin DA, Staroverov DB, Putintseva EV, Plevova K, Linnemann C, Shagin D,
Pospisilova S, Lukyanov S, Schumacher TN, Chudakov DM. Towards error-free
profiling of immune repertoires. Nat Methods. 2014 Jun;11(6):653-5. doi:
10.1038/nmeth.2960. Epub 2014 May 4. PubMed PMID: 24793455.
3: Srivatsa S, Parthasarathy S, Britanova O, Bormuth I, Donahoo AL, Ackerman SL,
Richards LJ, Tarabykin V. Unc5C and DCC act downstream of Ctip2 and Satb2 and
contribute to corpus callosum formation. Nat Commun. 2014 Apr 17;5:3708. doi:
10.1038/ncomms4708. PubMed PMID: 24739528; PubMed Central PMCID: PMC3997811.
4: Britanova OV, Putintseva EV, Shugay M, Merzlyak EM, Turchaninova MA,
Staroverov DB, Bolotin DA, Lukyanov S, Bogdanova EA, Mamedov IZ, Lebedev YB,
Chudakov DM. Age-related decrease in TCR repertoire diversity measured with deep
and normalized sequence profiling. J Immunol. 2014 Mar 15;192(6):2689-98. doi:
10.4049/jimmunol.1302064. Epub 2014 Feb 7. PubMed PMID: 24510963.
5: Putintseva EV, Britanova OV, Staroverov DB, Merzlyak EM, Turchaninova MA,
Shugay M, Bolotin DA, Pogorelyy MV, Mamedov IZ, Bobrynina V, Maschan M, Lebedev
YB, Chudakov DM. Mother and child T cell receptor repertoires: deep profiling
study. Front Immunol. 2013 Dec 25;4:463. doi: 10.3389/fimmu.2013.00463.
eCollection 2013. PubMed PMID: 24400004; PubMed Central PMCID: PMC3872299.
6: Mamedov IZ, Britanova OV, Zvyagin IV, Turchaninova MA, Bolotin DA, Putintseva
EV, Lebedev YB, Chudakov DM. Preparing unbiased T-cell receptor and antibody cDNA
libraries for the deep next generation sequencing profiling. Front Immunol. 2013
Dec 23;4:456. doi: 10.3389/fimmu.2013.00456. eCollection 2013. PubMed PMID:
24391640; PubMed Central PMCID: PMC3870325.
7: Bolotin DA, Shugay M, Mamedov IZ, Putintseva EV, Turchaninova MA, Zvyagin IV,
Britanova OV, Chudakov DM. MiTCR: software for T-cell receptor sequencing data
analysis. Nat Methods. 2013 Sep;10(9):813-4. doi: 10.1038/nmeth.2555. Epub 2013
Jul 28. PubMed PMID: 23892897.
8: Turchaninova MA, Britanova OV, Bolotin DA, Shugay M, Putintseva EV, Staroverov
DB, Sharonov G, Shcherbo D, Zvyagin IV, Mamedov IZ, Linnemann C, Schumacher TN,
Chudakov DM. Pairing of T-cell receptor chains via emulsion PCR. Eur J Immunol.
2013 Sep;43(9):2507-15. doi: 10.1002/eji.201343453. Epub 2013 Jun 26. PubMed
PMID: 23696157.
9: Fish JL, Villmoare B, Kцbernick K, Compagnucci C, Britanova O, Tarabykin V,
Depew MJ. Satb2, modularity, and the evolvability of the vertebrate jaw. Evol
Dev. 2011 Nov-Dec;13(6):549-64. doi: 10.1111/j.1525-142X.2011.00511.x. PubMed
PMID: 23016939.
10: Bolotin DA, Mamedov IZ, Britanova OV, Zvyagin IV, Shagin D, Ustyugova SV,
Turchaninova MA, Lukyanov S, Lebedev YB, Chudakov DM. Next generation sequencing
for TCR repertoire profiling: platform-specific features and correction
algorithms. Eur J Immunol. 2012 Nov;42(11):3073-83. doi: 10.1002/eji.201242517.
Epub 2012 Sep 24. PubMed PMID: 22806588.
11: Britanova OV, Bochkova AG, Staroverov DB, Fedorenko DA, Bolotin DA, Mamedov
IZ, Turchaninova MA, Putintseva EV, Kotlobay AA, Lukyanov S, Novik AA, Lebedev
YB, Chudakov DM. First autologous hematopoietic SCT for ankylosing spondylitis: a
case report and clues to understanding the therapy. Bone Marrow Transplant. 2012
Nov;47(11):1479-81. doi: 10.1038/bmt.2012.44. Epub 2012 Mar 12. PubMed PMID:
22410749.
12: Baranek C, Dittrich M, Parthasarathy S, Bonnon CG, Britanova O, Lanshakov D,
Boukhtouche F, Sommer JE, Colmenares C, Tarabykin V, Atanasoski S. Protooncogene
Ski cooperates with the chromatin-remodeling factor Satb2 in specifying callosal
neurons. Proc Natl Acad Sci U S A. 2012 Feb 28;109(9):3546-51. doi:
10.1073/pnas.1108718109. Epub 2012 Feb 14. PubMed PMID: 22334647; PubMed Central
PMCID: PMC3295291.
13: Mamedov IZ, Britanova OV, Bolotin DA, Chkalina AV, Staroverov DB, Zvyagin IV,
Kotlobay AA, Turchaninova MA, Fedorenko DA, Novik AA, Sharonov GV, Lukyanov S,
Chudakov DM, Lebedev YB. Quantitative tracking of T cell clones after
haematopoietic stem cell transplantation. EMBO Mol Med. 2011 Apr;3(4):201-7. doi:
10.1002/emmm.201100129. Epub 2011 Mar 4. PubMed PMID: 21374820; PubMed Central
PMCID: PMC3377069.
14: Britanova OV, Staroverov DB, Chkalina AV, Kotlobay AA, Zvezdova ES, Bochkova
AG, Chudakov DM. Single high-dose treatment with glucosaminyl-muramyl dipeptide
is ineffective in treating ankylosing spondylitis. Rheumatol Int. 2011
Aug;31(8):1101-3. doi: 10.1007/s00296-010-1663-3. Epub 2010 Nov 30. PubMed PMID:
21116819.
15: Zvyagin IV, Mamedov IZ, Britanova OV, Staroverov DB, Nasonov EL, Bochkova AG,
Chkalina AV, Kotlobay AA, Korostin DO, Rebrikov DV, Lukyanov S, Lebedev YB,
Chudakov DM. Contribution of functional KIR3DL1 to ankylosing spondylitis. Cell
Mol Immunol. 2010 Nov;7(6):471-6. doi: 10.1038/cmi.2010.42. Epub 2010 Sep 6.
PubMed PMID: 20818412; PubMed Central PMCID: PMC4002958.
16: Shcherbo D, Shemiakina II, Ryabova AV, Luker KE, Schmidt BT, Souslova EA,
Gorodnicheva TV, Strukova L, Shidlovskiy KM, Britanova OV, Zaraisky AG, Lukyanov
KA, Loschenov VB, Luker GD, Chudakov DM. Near-infrared fluorescent proteins. Nat
Methods. 2010 Oct;7(10):827-9. doi: 10.1038/nmeth.1501. Epub 2010 Sep 5. PubMed
PMID: 20818379; PubMed Central PMCID: PMC4425247.
17: Moldrich RX, Gobius I, Pollak T, Zhang J, Ren T, Brown L, Mori S, De Juan
Romero C, Britanova O, Tarabykin V, Richards LJ. Molecular regulation of the
developing commissural plate. J Comp Neurol. 2010 Sep 15;518(18):3645-61. doi:
10.1002/cne.22445. PubMed PMID: 20653027; PubMed Central PMCID: PMC2910370.
18: Leder L, Stark W, Freuler F, Marsh M, Meyerhofer M, Stettler T, Mayr LM,
Britanova OV, Strukova LA, Chudakov DM, Souslova EA. The structure of Ca2+ sensor
Case16 reveals the mechanism of reaction to low Ca2+ concentrations. Sensors
(Basel). 2010;10(9):8143-60. doi: 10.3390/s100908143. Epub 2010 Aug 30. PubMed
PMID: 22163646; PubMed Central PMCID: PMC3231237.
2.6.2
Список грантов:
РФФИ
1.ИсполниЯФ_а; Cенсоры мембранного потенциала на основе оптимизированных красных флуоресцентных белков 2011 -2012
2. Исполнитель:12-04-00229-а; Исследование закономерностей старения адаптивного иммунитета методом массированного секвенирования ограниченного пула Т клеточных рецепторов. 2012 -2014
3. Исполни; Молекулярное баркодирование как инструмент количественного анализа, нормирования, частотного спаривания цепей, и коррекции ошибок при NGS анализе репертуаров антител и Т-клеточных рецепторов 05.07.2012
4. Руководи; Исследование индивидуальных репертуаров антител человека методами массированного секвенирования 15.08.2012-наст. вр
5. Исполни; Сравнительный анализ состояния адаптивного иммунитета здоровых доноров и больных, прошедших курс лечения циклофосфаном, с использованием NGS-тест-системы для точного определения индивидуального разнообразия репертуаров Т-клеточных рецепторов человека. 18.07.2013-наст. вр
6. МКБ грант
Исполни; Системная геномика Т-клеточного иммунитета; Конкурс 2014 года «Проведение фундаментальных научных исследований и поисковых научных исследований коллективами существующих научных лабораторий (кафедр)»
7. ФЦП Исследования и разработки
Исполнитель: «Разработка комплексных тест-систем на основе массированного секвенирования генов Т - и B-клеточного рецептора для мониторинга минимальной остаточной болезни при терапии острых лейкозов у детей»
Соглашение от 01.01.01 г. № 14.604.21.0118
Сроки: 2014 - 2016
2.6.3
Конференция 2nd International Conference on Immune Tolerance, 22.10.2011 - 25.10.2011 (Amsterdam); Представление постера: First HSCT for Ankylosing spondylitis: case report and long term tracking of TCR repertoire changes by massive sequencing
2.6.5
Научное руководство дипломными (за последние 5 лет – 4 дипломные работы) и курсовыми работами
