1, 2

МАЭ (Кунсткамера) РАН, Санкт-Петербург

(*****@***ru; 2 *****@***ru)

ПАЛЕОАНТРОПОЛОГИЯ И ПАЛЕОГЕНЕТИКА: НАУЧНЫЕ РЕЗУЛЬТАТЫ И ПЕРСПЕКТИВЫ ИЗУЧЕНИЯ КОЛЛЕКЦИЙ МАЭ РАН

       

В последние десятилетия интенсивно развиваются естественнонаучные методы анализа палеоантропологических материалов: – геометрическая морфометрия, 3D сканирование, создание многомерных цифровых копий, микрофокусная рентгенография, компьютерная томография. Особую популярность набирает палеогенетика – восстановление, изучение геномов древних людей непосредственно по их костным останкам.

Сложность применения таких методов связана с невосполнимой (деструктивной) утратой костных тканей: для абсолютной датировки С14 нужны от 3-х до 400 гр. костного материала; такие анализы, как микроэлементный (реконструкция систем питания), изотопный (реконструкция систем питания и/или установление региона формирования скелетных тканей в детстве) требуют каждый от 3-х до 10 гр. на определение.; палеогенетика от 3-х до 500 гр.

Палеогенетика – область исследований, находящаяся на стыке археологии, антропологии и молекулярной генетики. Занимается генетическими исследованиями древней ДНК, содержащейся в биологических останках и ископаемых организмах. Объектами палеогенетики человека являются останки организма человека и других гоминид. Палеогенетическое исследование древнего индивида включает в себя: – филогенетический (установление родственных/эволюционных связей между организмами, популяциями) – и филогеографический анализ (установление путей географического распространения популяций). Так же проводятся анализ маркеров половой принадлежности и поиск маркеров генетической предрасположенности к заболеваниям.

НЕ нашли? Не то? Что вы ищете?

Методы палеогенетики позволяют решать вопросы генетической истории групп населения, характера их взаимоотношений друг с другом и с современными популяциями, производить реконструкцию половой, семейной и социальной структуры древних сообществ человека. Комплексные исследования в областях молекулярной генетики, археологии, физической антропологии и лингвистики объективизируют реконструкции антропогенетических и этногенетических процессов – происхождение человека современного анатомического типа, изучение истории формирования населения того или иного региона, процессов миграции и смешивания древнего населения, их этнокультурное взаимодействие.

Первый совместный Проект (2008-2013 г. г.). МАЭ РАН, Центра древней ДНК (2008-2013 гг.) (Австралия) и Медико-генетического научного центра РАМН "Изучение митохондриальной ДНК материалов из могильников Южного Оленьего острова Онежского озера (Карелия) и Кольского Оленеостровского в Баренцевом море".

Основные выводы:

       1. Кольский Оленеостровский могильник (КОМ) эпохи раннего металла и современные саамы. Кардинальное различие их генофондов указывает, что популяция эпохи раннего металла не оставила следов в современном населении региона.

       2. Вырисовывается картина практически стопроцентного замещения генофонда (полной смены населения) на этой территории.

       3. Можно заключить, что популяция эпохи раннего металла Кольского полуострова (древние "лапландцы" из КОМ) сформировалась в результате миграции из Сибири (вероятно, вдоль арктического побережья по тундровой зоне). Впоследствии эта миграция из Сибири, вероятно, угасла, не оставив значимого следа в современном генофонде. Выводы генетиков полностью согласуются с данными палеоантропологии.

Второй Проект (2014-2015 гг.) МАЭ РАН и Центра геогенетики университета Копенгагена (Дания) "Верхнепалеолитический человек из Маркиной Горы (Костёнки XIV)".

Основные выводы:

       1. Скелет мужской (Y-chromosome gaplogroup C-M130).

       2. И mtDNA и nuclear DNA показывают, что геном человека из Маркиной Горы «предковый по отношению ко всем современным европейцам»;

       3. Африканских или австралоидных маркеров в геноме не выявлено.

Третий комплексный Проект (2012-2015 гг.) МАЭ РАН, Центра геогенетики Копенгаген (Дания), Гарвардского университета (США) и Института Макса Планка (ФРГ).

"Исследование популяций эпохи бронзы", Два больших международных исследовательских коллектива опубликовали результаты анализа геномов 170 обитателей различных районов Евразии, живших от 8000 до 2000 лет назад.

Основные выводы:

       1. Обе работы показали, что важнейшую роль в формировании генофонда современных европейцев сыграла произошедшее около 4500 лет назад массовое переселение кочевых скотоводов из Причерноморско-Каспийской степи («ямная культура») в Западную Европу, где потомки мигрантов сформировали «культуру шнуровой керамики» («культура боевых топоров»).

       2. С большой вероятностью древнее нашествие степняков непосредственно связано с распространением в Западной Европе индоевропейских языков. Последующие миграции этих популяций в восточном направлении, по-видимому, объясняют происхождение синташтинской и афанасьевской культур, а также тохарских языков.

       3. Исследование показало, что генофонд современных европейцев (как западных, так и восточных) складывается из трех, смешанных в разных пропорциях у разных народов, частей. а) первая часть – от палеолитических европейских охотников-собирателей; б) вторая – от неолитических переселенцев с Ближнего Востока, вместе с которыми в Европу пришло сельское хозяйство; в) третья – от причерноморских степняков бронзового века.

В целом, реализация совместных исследований данных краниологии и палеогенетики показала высокую степень совпадения результатов обеих систем – корреляция около 0.95-0.68.

К настоящему времени МАЭ РАН закончены следующие совместные Проекты.

1. 2013 г. Генетические особенности населения Севера-Запада России эпохи мезолита и палеометалла (могильники Южного Оленьего острова на Онежском озере и КОМ на острове в Баренцевом море). Научный партнер – Университет Аделаиды (Австралия). Опубликовано в  2-х статьях (в PLоS).

2. 2015г. Человек из Маркиной горы (Костёнки XIV). Научные партнеры – Центр Геогенетики Университета Копенгагена. Опубликовано в статье (Scienc)

3. 2015 г. Происхождение индоевропейцев (ямная, афанасьевская, андроновская, карасукская, окуневская, тагарская и др. культуры). Научные партнеры: а) Центр Геогенетики Университета Копенгагена и б) Гарвардский университет. Опубликовано в  3-х статьях (Nature, Cell).

4. Особенности сохранности ДНК в различных костных структурах. Партнёр-Университет Дублина. Опубликовано в статье (PLоS).

5. Early Divergent Strains of Yersinia pestis in Eurasia 5,000 Years Ago. Опубликовано (Cell).

Общая ситуация на международном «рынке» разработок в области палеоДНК – ужесточение конкуренции лабораторий, борьба лабораторий за палеоантропологические материалы («образцы»); постепенный переход от «сенсационных» и общих разработок на основании единичных находок (палеолит, мезолит), к популяционным исследованиям материалов более поздних эпох.

Основные проблемы при передаче материалов в лаборатории партнёров и подготовке результатов к публикации: а) не всегда сообщается о результатах работ; б) отсутствие (или неточность) ссылок на принадлежность материалов; в) некорректная археологическая атрибуция материалов; г) отсутствие ссылок на предшествующие работы российских авторов (археологов, антропологов, лингвистов).

БИБЛИОГРАФИЧЕСКИЙ СПИСОК

, , О роли популяций с территории Фенноскандии в формировании антропологического состава населения Российского Северо-Запада // Уральский исторический вестник, 2015. – № 48. – С. 87-95.

Хартанович С. В., , Шумкин археолого-антропологического исследования поздненеолитического могильника Большого Оленьего острова Кольского залива // Экология и демография человека в прошлом и настоящем. – М., 2009. – С. 29-30.

, Моисеев состав древнего населения Кольского полуострова (по краниологическим материалам могильника эпохи раннего металла на Большом Оленьем острове Баренцева моря // Мезолит и неолит Восточной Европы: хронология и культурное взаимодействие. – СПб.: ИИМК РАН/МАЭ РАН, 2012. – С. 153-159.

, Моисеев состав древнего населения Кольского полуострова (по краниологическим материалам могильника эпохи раннего металла на Большом Оленьем острове Баренцева моря // Мезолит и неолит Восточной Европы: хронология и культурное взаимодействие. – СПб.: ИИМК РАН/МАЭ РАН, 2016. – С. 128-145.

Шмидт могильник на Кольском заливе // Кольский сборник. Труды антрополого-этнографического отряда Кольской экспедиции. Материалы комиссии экспедиционных исследований. – Л., 1930. – Вып. 23. – С. 119-169.

, , итоги новых раскопок могильника на Большом Оленьем острове // Записки ИИМК., 2006. – № 1. – С. 42-52.

Шумкин Оленеостровский могильник эпохи раннего металла в Мурманской обл. // Проблемы изучения первобытности и раннего средневековья лесной зоны Восточной Европы: К 60-летию / Под ред. и . – Вып. IV. – Иваново: , 2015. – С. 177-188.

Der Sarkissian C, Balanovsky O, Brandt G, Khartanovich V, Buzhilova A, Koshel S, Zaporozhchenko V, Gronenborn G, Moiseyev V, Kolpakov E, Shumkin V, Alt K. W, Balanovska E, Cooper A, Haak W. Ancient DNA Reveals Prehistoric Gene-Flow from Siberia in the Complex Human Population History of North East Europe // PLoS Genet, 2013. – Volume 9. – Issue 2.
– DOI:org/10.1371/journal. pgen.1003296.

Der Sarkissian C., Brotherton P., Templeton J. E.L., Llamas B., Soubrier J., Cooper A., Haak W., Balanovsky O., Moiseyev V., Khartanovich V., Adhikarla S., Prasad A. K.G., Pitchappan R., Santhakumari A. V., Adler C. J., Bertranpetit J., Comas D., Haber M., Martнnez-Cruz B., Clarke A. C. et al. MITOCHONDRIAL GENOME SEQUENCING IN MESOLITHIC NORTH EAST EUROPE UNEARTHS A NEW SUB-CLADE WITHIN THE BROADLY DISTRIBUTED HUMAN HAPLOGROUP C1. // PLoS ONE. 2014. – Volume 9. – № 2. – P. e876.

Murashkin, A. I., Kolpakov, E. M., Shumkin, V. Ya., Khartanovich, V. I. & Moiseyev, V. G. Kola Oleneostrovskiy Grave Field: A Unique Burial Site in the European Arctic // New Sites, New Methods. The Finnish Antiquarian Society. Iskos 21. – Helsinki, 2016. – P. 187-199.

Khartanovich V. I.1, Moiseev V. G.2

MAE (Kunstkamera) RAS, Saint-Petersburg

(*****@***ru; 2 *****@***ru)

PALEOANTHROPOLOGY AND PALEOGENETICS: MAE RAS COLLECTIONS RESEARCH FINDINGS AND FURTHER STUDY POTENTIAL.

       

Over the past decades we've been witnessing an active development of new methods of paleo-anthropological materials study: - geometric morphometry, 3D scanning, creation of the multidimensional digital replicas, the microfocus x-ray study, and computer tomography. One of the most dynamically growing areas is the paleo-genetics - the recovery and the study of the ancient people genomes from the material obtained directly from their bone remains.

The difficulty of such methods application is related to the irretrievable (destructive) loss of bone tissue: the absolute C14 dating requires from 3 to 400 gr of bone material; such studies as the trace element analysis (food systems reconstruction), isotope (food systems reconstruction and/or establishing the region of the skeletal tissue formation in childhood) require each from 3 to 10 gr per each test; paleo-genetics - from 3 to 500 gr.

Paleo-genetics is an area of research at the junction of archeology, anthropology and molecular genetics. Its focus is the genetic study of ancient DNA from the biological remains and fossil organisms. The subjects of paleo-genetics of humans are the remains of humans and other Hominidae. A paleo-genetic study of an ancient individual includes the following: the phylogenetic (establishing kinship/evolutionary links between the organisms and the populations), and the phylogeographic analysis (establishing the routes of the geographic distribution of the populations). The same approach is taken for the gender markers analysis and the search for the family history of a particular disease markers.

The paleo-genetic methods allow addressing problems of the groups of population genetic history, the nature of their relationships with each other and with the modern populations, perform reconstructions of the gender, family and social structure of ancient human prehensive studies in the area of molecular genetics, archeology, physical anthropology and linguistics objectify the anthropogenetic and the ethnogenetic processes reconstructions  - the origins of the modern anatomical type humans, the study of the history of a particular region population formation, processes of migration and mixing of the ancient populations, and their ethno-cultural contacts. 

First joint project (2008-2013). MAE RAS, Ancient DNA Center (2008-2013) Australia and the Medico-Genetic Research Center RAMS "Mitochondrial DNA materials study from the burial sites of the South Oleny island, Onega Lake (Karelia) and the Kola Oleny island in the Barents Sea".

Main findings:

       1. The Kola Oleneostrovskiy Early Metal Age burial site (KOB) and the modern Sami. A cardinal difference in their gene pools demonstrated that the Early Metal Age population did not leave any traces in the modern population of the region.

       2. The resulting picture was an evidence of the practically 100% replacement of the gene pool (complete change of the population) in that territory.

       3. It may be assumed that the Early Metal Age population in the Kola peninsula (the ancient "Lapp" from the KOB) was formed as a result of migration from Siberia (presumably along the Arctic coast across the tundra zone). In later periods this migration from Siberia probably stopped without leaving any significant traces in the modern gene pool. The genetic analysis findings agreed well with the paleo-anthropology data.

Second project (2014-2015). MAE RAS and the Center of GeoGenetics of the University of Copenhagen (Denmark) "Upper Paleolithic Man from Markina Gora (Kostenki XIV)".

Main findings:

       1. The skeleton of a male  (Y-chromosome gaplogroup C-M130).

       2. Both mtDNA and nuclear DNA indicated that the Markina Gora man was an "ancestor type with regard to all modern Europeans";

       3. We have not identified any  African or Australoid markers in the genome.

Third interdisciplinary  project (2012-2015). MAE RAS, the Center of GeoGenetics of the University of Copenhagen (Denmark), Harvard University (USA), and Max Planck Institute (Germany)

"Study of the Bronze Age Populations". Two large international research teams published the results of the study of genomes of 170 people from various regions of Eurasia who lived there in the interval from 8,000 to 2,000 years ago.

Main findings:

       1. Both studies demonstrated that the most important role in the formation of the gene pool of the modern Europeans was played by a large scale migration about 4,500 years ago of nomadic pastoralists from the Black Sea and the Caspian Sea steppe ("pit grave culture") to Western Europe, where the migrants' successors formed the "cord ceramics culture"  ("Battle Axe culture").

       2. It may be assumed with high probability that the steppe people invasion was directly related with the spread of the Indo-European languages in Western Europe. Further migrations of those populations in the eastern direction may apparently explain the origins  of the Sintashta and the  Afanasjev  cultures, as well as the Tokhar languages.

       3. The study demonstrated that the gene pool of the modern Europeans (both the Western and the Eastern) was formed by the three,  mixed in various proportions in different ethnic groups, parts. a) first part - from the Paleolithic European hunters-gatherers; b) second - from the Neolithic migrants from the Middle East who also brought agriculture to Europe; c) third - from the Bronze Age Black Sea steppe pastoralists. 

On the whole the organization of joint research of the craniology and the paleo-genetics data demonstrated very good agreement of both systems' findings - about 0.95 - 0.68 correlation rate.

So far the MAE RAS has completed the following Joint Projects.

1. 2013. Genetic traits of the Russian North-West population in the Mesolithic and the Paleo-Metal periods (burial sites of the South Oleny island, Onega Lake  and the Kola Oleny island in the Barents Sea). Research partner - Adelaide University (Australia). Published in two articles (PLоS).

2. 2015. Man from Markina Gora (Kostenki XIV). Research partner - Center of GeoGenetics of the University of Copenhagen (Denmark). Article publication (Scienc).

3. 2015. Origin of the Indo-Europeans (the pit grave, the Afanasjev, the Andronov, the Karasuk, the Okunev, the Tagar and other cultures).  Research partners: a) Center of GeoGenetics of the University of Copenhagen, and b) Harvard University. Published in three articles (Nature, Cell).

4. DNA preservation in various types of bone tissue. Partner - Dublin University Article publication (PLоS).

5. Early Divergent Strains of Yersinia pestis in Eurasia 5,000 Years Ago. Published (Cell).

The general situation in the international "market" of paleoDNA research is characterized by strengthening of competition between the laboratories for paleo-anthropological materials ("samples"); gradual shift from the "sensational" and general studies based on individual finds (the Paleolithic, the Mesolithic) to the population studies on the later periods materials.

Main problems associated with the submission of materials to the partners' laboratories and preparation of the findings for publication may be summed up as follows: a) the findings are not always reported; b) lack (or inaccuracy) of references to the materials' origins; c) incorrect archaeological attribution of the materials; d) lack of references to previous works by the Russian authors (the archaeologists, the anthropologists, and the linguists).

REFERENCES

Moiseev V. G., Khartanovich V. I., Shirobokov I. G., Selezneva V. I. On the role of populations originating from Fennoscandia in the formation of anthropological composition of the Russian north-west population // Ural Historical Vestnik. 2015. – № 48. – PP. 87-95.

Khartanovich V. I., Borutskaya S. V., Vasiljev S. V., Shumkin V. Ya., Findings of the archeologo-anthropological study of the Late neolithic burial site of the Bolshoy Oleny island in the Kola Bay // Past and Present Ecology and Demography of Man. – M., 2009. – PP. 29-30.

Khartanovich V. I., Moiseev V. G. Anthropological composition of the of the ancient population of the Kola peninsula (on craniological materials from the Early Metal Age burial site on the Bolshoy Oleny Ostrov in the Barents Sea) // The Mesolithic and the Neolithic in eastern Europe: chronology and cultural contacts. – St. Petersburg, 2012. – PP. 153-159.

Khartanovich V. I., Moiseev V. G. Anthropological composition of the of the ancient population of the Kola peninsula (on craniological materials from the Early Metal Age burial site on the Bolshoy Oleny Ostrov in the Barents Sea)// The Mesolithic and the Neolithic in eastern Europe: chronology and cultural contacts. – St. Petersburg, 2016. – PP. 128-145.

Shmidt A. V. Ancient burial site in the Kola bay. // Kola papers. Papers of the anthropologo-ethnographic team of the Kola expedition. Expedition Commission Papers. 1930. – Issue 23 L. – PP. 119-169.

Shumkin V. Ya., Kolpakov E. M.,  Murashkin A. I. Preliminary findings of the new excavation of the burial site on the Bolshoy Oleny Ostrov // IHMC papers.  2006. – № 1. – PP. 42-52.

V. Ya. Shumkin. Kola Oleneostrovskiy Early metal burial site in the Murmansk region. // Problems of the East Europe forest zone pre-history and the Middle Ages study. – Ivanovo. 2015. –  PP. 177-188.

Der Sarkissian C, Balanovsky O, Brandt G, Khartanovich V, Buzhilova A, Koshel S, Zaporozhchenko V, Gronenborn G, Moiseyev V, Kolpakov E, Shumkin V, Alt K. W, Balanovska E, Cooper A, Haak W. Ancient DNA Reveals Prehistoric Gene-Flow from Siberia in the Complex Human Population History of North East Europe // PLoS Genet, 2013. – Volume 9. – Issue 2.
– DOI:org/10.1371/journal. pgen.1003296.

Der Sarkissian C., Brotherton P., Templeton J. E.L., Llamas B., Soubrier J., Cooper A., Haak W., Balanovsky O., Moiseyev V., Khartanovich V., Adhikarla S., Prasad A. K.G., Pitchappan R., Santhakumari A. V., Adler C. J., Bertranpetit J., Comas D., Haber M., Martнnez-Cruz B., Clarke A. C. et al. MITOCHONDRIAL GENOME SEQUENCING IN MESOLITHIC NORTH EAST EUROPE UNEARTHS A NEW SUB-CLADE WITHIN THE BROADLY DISTRIBUTED HUMAN HAPLOGROUP C1. PLoS ONE. 2014. – Vol. 9. – № 2. – PP. e876.

Murashkin, A. I., Kolpakov, E. M., Shumkin, V. Ya., Khartanovich, V. I. & Moiseyev, V. G. Kola Oleneostrovskiy Grave Field: Kola Oleneostrovskiy grave field – a unique burial site in the European Arctic // «New Sites, New Methods». The Finnish Antiquarian Society. Iskos 21. – Helsinki: 2016. – PP. 187-199.