ооо

МЕДИКО-ГЕНЕТИЧЕСКИЕ ТЕХНОЛОГИИ

Лицензия № 54 – 01 – 000970

г. Новосибирск, ул Арбузова,6. Тел. 8(383)310 78 50, 8 913 910 77 23

www.mgtnsk.narod.ru; e-mail: [email protected]

Молекулярно - генетический анализ и интерпретация

ФИО: Авдеев Максим Дата поступления: 13.10.2014

Возраст: 6 лет Номер анализа: МГТ901

Пол м Анализ выполнен .

Врач Подпись__________________

Диагноз Дата выдачи результата: 23 октября 2014 г.

Ген Кодируемый белок Полимор Локализа Резуль

физм ция тат Шифр

Антиоксидантная защита

MnSOD Митохондриальная супероксидисмутаза C/T Ala16Val C/T 2

Аутоиммунные заболевания

НЕ нашли? Не то? Что вы ищете?

IL2/IL21 region Межгенный район IL2/IL21 (4q27) g.48057142G>T G/G 1

Иммунный ответ

HLA-DQ2.2 Человеческий лейкоцитарный антиген A/G A/A 1-

HLA-DQ2.2 Человеческий лейкоцитарный антиген T/G T/T 1-

HLA-DQ2.2 Человеческий лейкоцитарный антиген T/C T/T 1

HLA-DQ2.5 Человеческий лейкоцитарный антиген A/G G/G 3+

HLA-DQ7 Человеческий лейкоцитарный антиген G/A G/A 2-

HLA-DQ8 Человеческий лейкоцитарный антиген C/T C/C 1-

Метаболизм лекарств

GSTM глютатион S трансфераза - мю del del 3-

GSTP1 глютатион S трансфераза P C2285T A114V C/T 2

GSTP1 глютатион S трансфераза P A1405G I105V G/G 3-

GSTT глютатион S трансфераза - тета del + 1

SLC19A1 Транспортер фолатов G80A G/A 2

Остеогенез

VDR рецептор витамина Д T325C(TaqI) T/T 1

VDR рецептор витамина Д G-3731A Promotor G/G 1

VDR рецептор витамина Д G9T(ApaI) T/T 3-

Плазменный гемостаз

FGB фибриноген бета G-455A Promoter G/G 1

FII II коагуляционный фактор (протромбин) G20210A 3'-UTR G/G 1

FV V коагуляционный фактор свертываемости крови (фактор G1691A Arg506Gln G/G 1

Лейдена)

PAI1 Ингибитор активатора плазминогена 675 5G/4G 5G/4G 2

Ренин - ангиотензин - алдостероновая система (РААС)

ACE агиотензин-превращающий фермент I/D Intron16 I/D 2-

Фолатный цикл

BHMT бетаин-гомоцистеин метилтрансфераза G742A Arg239Gln G/G 1

BHMT бетаин-гомоцистеин метилтрансфераза G7961A G/G 1

CBS Цистатион бета-синтаза 844 D/I Ile278Thr D/D 1 MTHFD метилентетрагидрофолат дегидрогеназа G1958A Arg653Gly G/G 1

MTHFR метилентетрагидрофолатредуктаза C677T Ala223Val C/C 1

MTHFR метилентетрагидрофолатредуктаза A1298C E429A C/C 3-

MTR метионин редуктаза A2756G Asp918Gly A/G 2

MTRR метионин синтаза-редуктаза A66G Ile22Met A/G 2

SHMT серин гидроксиметил трансфераза C1420T T/T 3-

Эндотелий

NOS3(e) эндотелиальная NO-синтаза VNTR Intron4 5R/4R 2

NOS3(e) эндотелиальная NO-синтаза G894T Glu298Asp G/G 1

Примечание: 1- гомозигота частый аллель (норма/норма),

2- гетерозигота (норма/мутация),

3- гомозигота редкий аллель (мутация/мутация),

знак минус – патологический эффект, знак плюс – протективный эффект.

Алгоритм генетического тестирования и интерпретация

результата ДНК анализа

При молекулярно-генетическом тестировании выявлены полиморфные варианты генов, связанные с изменением функционирования различных систем организма и развитием заболеваний:

MnSOD Ala16Val	гетерозигота	Полиморфизм MnSOD C/T (гетерозигота), связанный с нарушением превращения супероксид радикалов в пероксид водорода и молекулярный кислород.
GSTM	гетерозигота	Полиморфизм GSTM del, связанный с тем, что фермент мю-1 глутатион S-трансфераза (GSTM1) не образуется, снижена инактивации электрофильных органических веществ, способность организма избавляться от некоторых вредных соединений значительно снижается.
GSTP114 A114V	гетерозигота	Полиморфизм GSTP114 C2285T (гетерозигота), связанный со снижением субстратспецифичной каталитической активности и тепловой стабильности фермента глютатион S трансфераза pi (GSTP1).
GSTP105 I105V	гомозигота G/G	Полиморфизм GSTP105 A1405G (гомозигота), связанный со снижением каталитической активности и тепловой стабильности фермента GSTP1, которая играет важную роль в детоксикации, путем катализирования конъюгации многих гидрофобных и электрофильных компонентов с глютатионом.
VDR-ApaI	гомозигота T/T	Полиморфизм VDR-ApaI G/T (гомозигота), связанный с дисфункцией ядерного гормонального рецептора витамина Д3 (транскрипционный регуляторный фактор подобный рецепторам к стероидным и тиреоидным гормонам, вовлечен в минеральный обмен, иммунный ответ и онкологические процессы.
PAI1	гетерозигота	Полиморфизм PAI1 675 5G/4G (гетерозигота), связанный с повышением экспрессии гена PAI-1, инактивацией тканевого активатора плазминагена, повышеннием уровня PAI-1, снижением активности тромболитической системы.
ACE Intron16	гетерозигота	Полиморфизм ACE I/D (гетерозигота), связанный с повышением выработки ангиотензин-превращающего фермента (АПФ) и уровня ангиотензина 2, инактивацией вазодилатотора брадикинина.
MTHFR E429A	гомозигота C/C	Полиморфизм MTHFR A1298C (гомозигота), связанный со снижением активности MTHFR, нарушением перевода неактивной формы фолиевой кислоты в активную, которая играет ключевую роль в процессе метилирования ДНК и превращении гомоцистеина в метионин.
MTR Asp918Gly	гетерозигота	Полиморфизм MTR A2756G (гетерозигота), связанный с изменением активности MTR (кобаламин-зависимая метионин синтаза), которая катализирует конечный шаг в биосинтезе метионина.
MTRR Ile22Met	гетерозигота	Полиморфизм MTRR A66G (гетерозигота), связанный со снижением активности MTRR, нарушением восстановления функциональности метионин синтазы, через восстановительное метилирование.
NOS3(e)-V Intron4	гетерозигота	Полиморфизм NOS3(e)-V VNTR(гетерозигота), связанный с нарушением синтеза оксида азота в клетках сосудистого эндотелия, нарушениями стимулирования гуанилат-циклазы.
SLC19A1 G80A	гетерозигота	Полиморфизм SLC19A1 G80A гетерозигота , связан с дефицитом RFC1(reduced folate carrier 1) – первичного белка для интернализации 5-метилтетрагидрофолата и тиамина монофосфата, нарушением абсорбции фолатов и недостаточностью поступления их в клетку, развитием побочных эффектов при приеме некоторых лекарственных препаратов, например, метотрексата (антагонист фолиевой кислоты). Повышен риск дефектов невральной трубки.
SHMT Rs1979277	гомозигота T/T	Полиморфизм SHMTC1420T (гомозигота T/T), связанный с поступлением одноуглеродного фрагмента в цикл метаболизма фолиевой кислоты. Кроме того, SHMT катализирует необратимую реакцию превращения 5,10-метенилтетрагидрофолата в 5-формилтетрагидрофолат. Ассоциация генотипа 1420TT c повышенным уровнем фолата и повышением гомоцистеина в плазме и клетках крови.

Индикаторная шкала области активности генов

Область активности генов	Индикаторная шкала по тестируемой системе
Эндотелиальная дисфункция	0.5 средний
Детоксикация ксенобиотиков. Метаболизм лекарств	1.5 очень высокий
Остеогенез	0.67 средний
Плазменный гемостаз	0.12 средний
Ренин-ангиотизин-альдостероновая система	1 выше среднего
Фолатный цикл. Реметилирование гомоцистеина	1 выше среднего

Индикаторная шкала функционирования систем организма

Системы организма	Индикаторная шкала по тестируемой системе	Область активности, конролируемая тестируемой группой генов	Индикаторная шкала по области активности тестируемых генов
Нарушение обмена веществ	1,46	нарушение обмена аминокислот (белковый обмен)	1,46
гипергомоцистеинемия	2,25
нарушение метаболизма кальция	0,67
Нарушение метаболического цикла метионина	1,46	изменение уровня метионина	0,67
изменение уровня гомоцистеина	2,25
Нарушение реметилирования	1,75	нарушение метилирования	0,67
гипергомоцистеинемия, уровень метионина нормальный или сниженны, снижение уровня метилирования ДНК, нестабильность генома	3,38
Нестабильность генома	1,32	нарушение метилирования ДНК	1,46
оксидативный стресс	0,5
Тромбофилическое состояние	0,88	развитие метаболической формы тромбофилии (гипергомоцистеинемия)	1,46
развитие метаболической формы тромбофилии (эндотелиальная дисфункция - тонус сосудистой стенки)	0,73
развитие тромбофилии, обусловленной нарушением фибринолиза	0,5
Эндотелиальная дисфункция	0,68	эндотелиальная дисфункция - тонус сосудистой стенки	0,73
эндотелиальная дисфункция - чувствительность эндотелия к окислительному стрессу	0,5
Артериальная гипертензия	0,73	дисфункция эндотелия	0,6
дисфункция ренин-ангиотизин-альдостероновой системы ( РААС)	1
Система очищения организма от ксенобиотиков в т. ч. медикаментов. Химический канцерогенез	2,17	нарушение 2-й фазы детоксикации ксенобиотиков, снижене эффективности очистки организма от многих чужеродных веществ	1,99
снижение уровня метилирования ДНК и развитие нестабильности генома	3,38
оксидативный стрес	0,5
Атерогенез	1,94	нарушения в метаболическом цикле метионина	3,38
дисфункция ренинин ангиотензин - альдостероновой системы	1
Система гемостаза	0,12	неэффективный фибринолиз	0,5

Внимание!

При своевременном регулярном использовании диеты, профилактических и оздоровительных программ, которые составлены с учетом Вашего генотипа и здоровом образе жизни. Вы можете существенно снизить риск развития заболеваний, к которым выявлена генетическая предрасположенность.

Жить долго! Быть здоровыми! Оставаться молодыми!

Индикаторная шкала профилактики заболеваний, связанных полиморфными локусами генов

Заболевание/состояние	Индикаторная шкала
Онкологические заболевания
Лейкемия	1,67
Лейкемия острая миелоидная	1,5
Колоректальный рак	-1,12
Рак мочевого пузыря	1,67
Рак ротовой полости	1,25
Полипоз кишечника	2,25
Колоректальная аденома	2,25
Лимфома	0,5
Рак легкого	1
Рак простаты	0,5
Лейкемия индуцированная химическим фактором	4
Рак глотки	2
Рак яичка	2
Репродуктивная система
Нерасхождение хромосом ри сперматогенезе. Синдром Дауна и др. анеуплоидии плода по мужской причине.	1,67
Нервнопсихическое и физическое развитие
Задержка умственного и физического развития	1,17
Заболевания сердечно-сосудистой системы
Артериальная гипертония	0,33
Артериальный стеноз	0,5
Атеросклероз	0,92
Атеросклероз почечных сосудов	0,5
Инфаркт миокарда	0,78
Ишемическая болезнь сердца	0,94
Стенокардия	0,5
Тромбоз	0,94
Тромбоз мозговых сосудов	0,5
Тромбоз венозный	0,92
Инсульт	0,1
Коронарная болезнь	0,75
Атеротромбоз	2,25
Антифосфолипидный синдром	2,25
Гипертрофия миокарда	1
Ревматическое поражение сердца	1
Сердечная недостаточность	1
Заболевания аутоиммунного и инфекционно-иммунного генеза
Бронхиальная астма	1,17
Бронхиальная астма, аллергия	1,67
Остеопороз	1,3
Заболевания соединительной ткани
Дисплазия соединительной ткани	1,08
Наследственные заболевания
Гомоцистинурия (MIM 236250), обусловленная недостаточностью функции гена MTHFR	2,25
Заболевания нервной системы
Мигренеподобные головные боли	2,25
Аутоподобное состояние	2,25
Болезнь Альцгеймера	2
Болезнь Альцгеймера (позднее начало)	1
Депрессия	1
Цереброваскулярные заболевания
Ишемическая болезнь головного мозга (ИБМ)	1

Интерпретация результатов молекулякно-генетического тестирования на предрасположенность к целиакии

Выявлен гаплотип для генов главного комплекса гистосовместимости HLA второго класса DQA1 и DQB1: DQX-DQ7

Соответствующая гаплотипу группа риска развития целиакии выделена в таблице:

Группа риска по системе HLA	Гаплотип DQ
Очень высокий	DQ2.5/ DQ2.5
DQ2.5/ DQ2.2
Высокий	DQ2.2/ DQ7
Средний	DQ2.5/ DQ7
DQ2.5/ DQ8
DQ2.5/ DQX(3,4,5)
Слабый	DQ2.2/ DQ2.2
DQ2.2/ DQ8
DQ8/ DQ8
Низкий	Другие

Межгенный регион IL2/IL21 – гомозигота частый аллель.

Заключение: По рассматриваемым генетическим предикторам риск развития целиакии низкий по отношению к среднепопуляционному.

Интерпретация:

В результате генетического тестирования генов обмена фолатов, метионина, цистеина, эндотелия, детоксикации ксенобиотиков, антиоксидантной защиты, остеогенеза, системы гемостаза выявлены полиморфные варианты генов, связанные с:

аммиака

нарушением минерального обмен, иммунного ответа, обусловленных дисфункцией ядерного гормонального рецептора витамина Д3 (VDR - G9T(ApaI) (гомозигота T/T).

Заключение

Выявлена генетическая предрасположенность к нарушению обмена серосодержащих аминокислот (метионина, гомоцистеина, цистеина), обусловленная сочетанным эффектом полиморфных локусов генов 2-го пути реметилирования гомоцистеина, связанных с

нарушением обмена фолатов (снижением поступления одноуглеродного фрагмента в цикл метаболизма фолиевой кислоты (SHMT C1420T гомозигота T/T), нарушением перевода неактивной формы фолиевой кислоты в активную (MTHFR A1298C гомозигота C/C), нарушением транспорта фолатов (SLC19A1 G80A гетерозигота. нарушением конечного шага биосинтеза метионина (недостаточностью метионин синтазы (MTR A2756G гетерозигота ), недостаточностью редуктазы метионин синтазы и нарушением восстановления функциональности метионин синтазы(MTRR A66G (гетерозигота)

Повышен риск изменения уровня гомоцистеина в крови. При дефиците в организме фолиевой кислоты и витамина В12 возможно развития гипергомоцистеинемии (повышение уровня гомоцистеина в крови). Возможно развитие тромбофилического состояния (повышения свертываемости крови) на фоне гипергомоцистеинемии (SHMT C1420T гомозигота T/T, MTHFR A1298C гомозигота C/C, SLC19A1 G80A гетерозигот, MTR A2756G гетерозигота, MTRR A66G гетерозигота, , снижения тромборезистентности и артерио и протективной функции эндотелия (NOS3 VNTR 5R/4R гетерозигота).

Повышен риск нарушения S-аденозилметионин (SAM) – зависимой реакции метилирования, и изменение уровня SAM. Возможно снижение уровня SAM - донора метильных групп для более, чем 80 реакций метилирования, включая метилирование ДНК и РНК, синтез холина, фосфатидилхолина, адреналина, карнитина, креатинина и др.

Выявлен высокий риск нарушения 2-й фазы детоксикации ксенобиотиков (чужеродных организму веществ) и инактивации электрофильных органических веществ (GSTM del,) и конъюгации хлорметанов и других индустриальных канцерогенов с глутатионом ( GSTP A1405G гомозигота G/G, GSTP C2285T гетерозигота ). Повышен риск нарушения очищения организма от аммиака, металлов, электрофильных соединений, включая канцерогены, медикаментов, экологических токсинов и продуктов окислительного стресса.
Выявлено носительство полиморфных локусов генов, связанных с недостаточностью эндотелиальной NO-синтазы (NOS3 VNTR 5R/4R гетерозигота и нарушением синтеза оксида азота в клетках сосудистого эндотелия и уменьшения концентрации окиси азота в кровяном русле. Возможно, недостаточное поступление NO в обмен аминокислот цикла мочевины и нарушение биосинтеза аргинина. Возможно нарушение регуляции кровотока: повышение тонуса сосудов на фоне понижения вазодилатации, и как следствие – повышение артериального давления, снижение тромборезистентности и артерио и протективной функции эндотелия.
Выявлено носительство полиморфного локуса гена, связанного с недостаточностью митохондриальной супероксидисмутазы (MnSOD Ala16Val гетерозигота/ гомозиготаT/T) и перегрузкой организма реактивными производными кислорода и развитием окислительного стресса на фоне нарушения превращения супероксид радикалов в пероксид водорода и молекулярный кислород. Возможно развитие нейрональных повреждений, микроглиальной активации, повышенной чувствительности эндотелия к окислительному стрессу и эндотелиальной дисфункции.

Общие рекомендации:

Рекомендуется врачам других специальностей учитывать выше изложенную информацию для ранней диагностики развития заболеваний, к которым имеется наследственная предрасположенность, а так же при выборе методов обследования, лечения и профилактики.

Обследование и наблюдение в динамике:

Б/х анализ: уровень гомоцистеина, фолиевой кислоты, витамина В12, глюкозы, креатинина, мочевой кислоты, коэффициент атерогенности (холестерин общий, ТГ, ЛПВП),общий билирубин, АСТ, АЛТ, фосфотаза щелочная магний, цинк.

Развернутая гемостазиограмма, реология эритроцитов. Общий (развернутый) анализ крови и мочи. УЗИ органов брюшной полости и почек.

Индивидуальная система профилактики

Регулярное проведение мероприятий, направленных на детоксикацию межклеточного пространства, восстановление про и антиоксидантного равновесия:

регулярный прием препаратов, содержащих пищевые волокна, биофлавоноиды, антиоксиданты. ежеквартальный прием ванн (на курс 12 ванн) с фитоминеральными композициями (соли для ванн) с целью выведения из организма биологически активных веществ, улучшения местных нейрорефлекторных реакций, активации оттока жидкости в лимфотическое пространство, нормализации активности симпатоадреналовой системы, улучшении микроциркуляции, восстановления проницаемости сосудов и улучшения метаболизма в сосудистой стенке. дыхательная гимнастика (по Бутейко, Стрельниковой, «Боди флекс» и др.) Коррекция обмена метионина: прием курсами витаминов группы В, доноров метильных групп:

Бетаин (трииметилглицин), гептрал. коферментные формы витамина В12: гидроксикобаламин, метилкобаламин, цианкобаламин витамин В6 фолиевая кислота
Назначения в репродуктивном периоде (период планирования рождения ребенка в семье (за 3 мес. до зачатия)): Консультация генетика. Фолиевая кислота 3 - 4 мг/сутки 1 мес. Под контролем гомоцистеина крови. Магне В6 (магния - 48 мг; пиридоксина гидрохлорид – 5 мг) по 2 таблетки 3 раза в день 3 недели (далее 2-3 раза в год). В12 (цианкобаламин) 500 мкг по 1 мл в/м 10 инъекций, чередовать с В6 (пиридоксин) 50 мг по 1 мл в/м 10 инъекций. Курс витаминов В12,В6 20 дней. Гептрал 400 мг по 1 табл. 2 раза в день 1 мес. Эссенциале форте Н по 2 табл. 3 раза в день 3 мес. Кисломолочные продукты с пробиотиками. Например Биовестин, Трилакт. Экофлор по 2,5 г 2 раза в день 14 дней. Два курса с перерывом 1 мес.

Диета:

При употреблении продуктов, содержащие большое количество метионина: мясо, сыр, творог, рыбы, (во время их употребления) принимать отвар солянки холмовой или Ацидин пепсин, свекольный сок (предварительно отстаивать 2-3 часа, купажировать с др. соками) – 3-4 мес. Рекомендуется включать в рацион продукты богатые, бетаином (препараты из солянки холмовой), витаминами В6,В12: шпинат, отруби, цельнозерновые продукты, бобы, дрожжи, свекла. Фолиевая кислота содержится в продуктах из цельной пшеницы, свежих овощах, особенно в свекле, горохе, фасоли. Лучший источник фолиевой кислоты - это свежая зелень. Фолиевая кислота в достаточном количестве содержится в зеленом чае, арахисе, печени и почках, желтых и оранжевых овощах, свежих соках из овощей (например:тыквенный). Гречневая крупа (лучше сырая)! Способ приготовления: вечером крупу промыть и залить холодной кипяченой водой, утром употреблять в холодном виде. Включать в рацион льняное масло, пищевые отруби. Напиток Ларикс & Солянка холмовая.

Для профилактики нарушения функционирования Вашего организма: рекомендуется:

следить за работой желудочно-кишечного тракта (стул 1-2 раза в день) вести подвижный образ жизни: регулярные занятия спортом исключить курение (в том числе и пассивное), злоупотребление алкоголем контролировать артериальное давление регулярные профилактические осмотры и контроль уровня гомоцистеина, холестерина, глюкозы крови

Примечание: данные рекомендации необходимо уточнить и скорректировать на очной консультации генетика! Результаты молекулярно-генетического анализа (ДНК диагностики) действительны всю жизнь их можно провести однократно.

Врач-генетик к. м.н.: //

Пояснения: *- Целиакия – хроническое генетически детерминированное заболевание желудочно-кишечного тракта, характеризующееся стойкой непереносимостью глютена (белок, содержащийся в злаковых растениях) с развитием хронической диареи. При данном заболевании возникает нарушение пищеварения, вызванное повреждением ворсинок тонкой кишки пищевыми продуктами содержащими глютен, сопровождающегося воспалением тонкого кишечника и связанного с ним синдрома мальабсорбции (снижения способности тонкого кишечника всасывать питательные вещества).

Причиной целиакии является возникновение специфического иммунного ответа с появлением ряда антител, в том числе, против глиадина (спирторастворимая фракция глютена), тканевой трансглутаминазы (фермент который участвует в переваривании глютена), эндомизиума (белок соединительной ткани, окружающей гладкомышечные элементы кишечных крипт). В результате возникает аутоиммунное поражение слизистой оболочки тонкой кишки. Недавние исследования установили что такой специфический имунный ответ возникает у пациентов имеющих определенные варианты генов системы HLA. В большинстве случаев пациенты с целиакией имеют гаплотип DQ2.5, который состоит из двух соседних аллелей генов DQA1*0501 и DQB1*0201, которые кодируют две субъединицы - DQ б5 и DQ в2. Гаплотипом риска также является DQ8 (который кодируется DQA1*03:DQB1*0302). Примерно 6% европейцев с целиакией не имеют гаплотипа DQ2.5 или DQ8 при чем 4% имеют гаплотип DQ2.2 а оставшиеся 2% не являются носителями ни одного из перечисленных гаплотипов.

Целиакия приводит к нарушению всасывания жиров, белков, углеводов, а также витаминов и минеральных веществ. Заболевание вызывает целый ряд симптомов, как «привязанных» к желудочно-кишечному тракту, так и более общих. Типичными признаками целиакии являются: диарея, большое количество жира в кале, вздутие живота и боли, потеря веса, анемия (малокровие), мышечная слабость, нарушения свертываемости крови. Страдающие целиакией дети растут медленнее своих сверстников. У женщин болезнь может приводить к бесплодию и выкидышам. У больных целиакией, при отсутствие лечения, в несколько раз повышен риск развития лимфом и карцином, особенно в кишечнике. Исследования показали что пациенты с целиакией имеют повышенный риск анемии и остеопороза. Однако исследование проведенное в Кембридже показало, что люди с целиакией имеют сниженный риск сердечно-сосудистых заболеваний (редко избыточный вес, низкий уровень холестерина).

Начало целиакии нередко совпадает с введением в пищевой рацион ребенка прикормов, содержащих мучные изделия. Поэтому заболевают чаще дети в возрасте 6-12 мес. Этот период особенно опасен в плане провокации целиакии.

Молекулярно - генетический анализ и интерпретация

Диета:

Домашний очаг

Справочная информация

Техника

Общество

Образование и наука

Мир

Бизнес и финансы