Фамилия, имя, отчество научного работника:
Структурное подразделение: Лаборатория молекулярной биоинженерии__________
1. Наличие трудов научного работника 2009 – 2014 по разделам:
№ | Разделы | Кол-во |
1.1 | Публикации в рецензируемых журналах | 17 |
1.2 | Статьи в научных сборниках и продолжающихся научных изданиях | |
1.3 | Монографии и главы в монографиях | |
1.4 | Публикации в материалах научных мероприятий | 33 |
1.5 | Патенты и свидетельства о регистрации программ для ЭВМ и баз данных | |
1.6 | Препринты | |
1.7 | Научно-популярные книги и статьи | 4 |
1.8 | Другие публикации по вопросам профессиональной деятельности | 2 |
2. Перечень трудов научного работника по соответствующим разделам
Публикации в рецензируемых журналах
, , "Пространственная реконструкция капсида и идентификация поверхностных белков бактериофага SN Pseudomonas aeruginosa электронно-микроскопическими методами" Биоорганическая химия (2009) т. 35, №6, с.808-815 , , Плетенeва Е. А., , Лавинье P., , "Поиск факторов разрушения бактериальных биофильмов: Сравнение свойств группы бактериофагов Pseudomonas putida и специфичности их продуктов, образующих ореол" Генетика. (2009) т.45, №2, с.185-195 Lecoutere E., Ceyssens P. J, Miroshnikov K. A., Mesyanzhinov V. V., Krylov V. N., Noben J. P., Robben J., Hertveldt K., Volckaert G., Lavigne R."Identification and comparative analysis of the structural proteomes of phiKZ and EL, two giant Pseudomonas aeruginosa bacteriophages" Proteomics. (2009); V.9(11), P.3215-3219. Ceyssens P. J., Miroshnikov K., Mattheus W., Krylov V., Robben J., Noben J. P., Vanderschraeghe S., Sykilinda N., Kropinski A. M., Volckaert G., Mesyanzhinov V., Lavigne R."Comparative analysis of the widespread and conserved PB1-like viruses infecting Pseudomonas aeruginosa" Environ Microbiol. (2009);V.11(11), P.2874-2883. Чупров-, , «Бета-спиральный домен бактериофага Т4 управляет укладкой фрагмента длинных хвостовых фибрилл в составе химерного белка» Биоорганическая химия (2010) т.36, №2, с.193-199 , , «Межвидовая миграция и эволюция бактериофагов семейства phiKZ: цели и критерии поиска новых phiKZ-подобных бактериофагов» Генетика (2010) т.46, №.2, с.159-167 , , «Псевдолизогения бактерий Pseudomonas aeruginosa, инфицированных phiKZ-подобными бактериофагами» Генетика (2010) т.46, №1, с.26-32 Timofeev V. I., Chuprov-Netochin R. N., Samygina V. R., Bezuglov V. V., Miroshnikov K. A.. Kuranova I. P. «X-ray investigation of crystallized gene-engineered human insulin complexed with polysialic acid» Acta Crystalogr. D (2010) v.66, №3, p.259-263 , , Крылов генома фагов вида EL Pseudomonas aeruginosa: Исследование мутантов, проявляющих вирулентность. Генетика (2011) Т. 47. № 2. С. 183-189 , Чупров-, , , Мирошников пептидогликанлизирующего фермента бактериофага цPMG1 Pseudomonas aeruginosa Биоорганическая химия. (2011) Т.37, № 6, с. 1–8 Chuprov-Netochin R. N., Amarantov S. V., Shneider M. M., Sykilinda N. N., Filchikov M. V., Ivanova M. A., Mesyanzhinov V. V., Miroshnikov K. A. Peptidyl-prolyl isomerase SLyD controls the recombinant folding of bacteriophage T4 long tail fibers Biopharmaceutical J. (2011) V. 3.№1, p.30-36 , , "Свойства нового D3-подобного бактриофага рhiPMG1 Pseudomonas aeruginosa: структура генома и перспективы использования в фаготерапии. Генетика (2012) Т.48 №9, с.1057-1067 Sycheva L. V., Shneider M. M., Sykilinda N. N., Ivanova M. A., Miroshnikov K. A., Leiman P. G."Crystal structure and location of gp131 in the bacteriophage phiKZ virion."Virology (2012) V.434(2):P.257-64. Tafoya D. A., Hildenbrand Z. L., Herrera N., Molugu S. K., Mesyanzhinov V. V., Miroshnikov K. A., Bernal R. A.”Enzymatic characterization of a lysin encoded by bacteriophage EL.” Bacteriophage. (2013); V. 3(2):e25449. , , «Новый умеренный бактериофаг phi297 Pseudomonas aeruginosa. Специфические особенности структуры генома» Генетика. (2013). Т.49 (8): с. 806-818. , , «Молекулярно-биологические и генетические принципы селекции терапевтических бактериофагов Pseudomonas и Staphylococcus» Прикладная биохимия и микробиология (2014) Т.50 (3): с.1-7 Sykilinda N. N., Bondar A. A., Gorshkova A. S., Kurochkina L. P., Kulikov E. E., Shneider M. M., Kadykov V. A., Solovieva N. V., Kabilov M. R., Mesyanzhinov V. V., Vlassov V. V., Drukker V. V., Miroshnikov K. A. “Complete Genome Sequence of the Novel Giant Pseudomonas Phage PaBG” Genome announc (2014) V2 (1), e00929-13
1.2. Статьи в научных сборниках и продолжающихся научных изданиях
нет
1.3. Монографии и главы в монографиях
нет
1.4. Публикации в материалах научных мероприятий
1.4.1. Chuprov-Netochin R. N., Shneider M. M., Mesyanzhinov V. V., Miroshnikov K. A. "Bacteriophage T4 beta-helical domain and peptidyl-prolyl isomerase drives the folding of the long tail fiber fragment into a functional chimeric protein" Conference Jaques Monod, Protein folds in infectious and neurodegenerative diseases. Aussois, France, April 25-29, 2009
1.4.2. , , "Электронно-микроскопическое картирование поверхностных белков и объемная реконструкция капсидов бактериофагов Pseudomonas aeruginosa" IV Российский симпозиум "Белки и пептиды" Казань, 23-27 июня 2009
1.4.3. Чупров-, , "Использование бета-спирального домена и пептидил-пролил изомеразы для получения биологически активного рекомбинантного gp37 бактериофага Т4" IV Российский симпозиум "Белки и пептиды" Казань, 23-27 июня 2009
1.4.4. Semenov A. M., Chuprov-Netochin R. N., Sykilinda N. N., Miroshnikov K. A. "Fibrous adhesin gp131 of Pseudomonas aeruginosa giant bacteriophage phiKZ" 18th Evergreen International Phage Biology Meeting, Olympia, WA, USA, Aug 9-14, 2009
1.4.5. Bernal R. A., Hildenbrandt Z., Natchiar K., Sernova N., Herrera N., Kurochkina L. P., Mesyanzhinov V. V., Miroshnikov K. A. "Cryo-EM reconstructions of a virus-encoded chaperonin point to a unique protein folding mechanism" 18th Evergreen International Phage Biology Meeting, Olympia, WA, USA, Aug 9-14, 2009
1.4.6. Molugu S., Hildenbrandt Z., Natchiar K., Sernova N., Kurochkina L. P., Herrera N., Mesyanzhinov V. V., Miroshnikov K. A., Bernal R. A. "Cryo-EM reconstruction of the first virus-encoded chaperonin" 18th Evergreen International Phage Biology Meeting, Olympia, WA, USA, Aug 9-14, 2009
1.4.7. Lecoultere E., Ceyssens P-J., Miroshnikov K. A., Mesyanzhinov V. V., Krylov V. N., Noben J-P., Robben J., Hertveldt K., Lavigne R. "The structural proteomes of phages phiKZ and EL"18th Evergreen International Phage Biology Meeting, Olympia, WA, USA, Aug 9-14, 2009
1.4.8. Herrera N., Filchikov M. V., Hildenbrandt Z., Molugu S., Mesyanzhinov V. V., Miroshnikov K. A., Bernal R. 'Cloning, expression, purification and crystallization of a lysozyme encoded by bacteriophage SN" 18th Evergreen International Phage Biology Meeting, Olympia, WA, USA, Aug 9-14, 2009
1.4.9. , Чупров-, , "Белковая инженерия на основе пептидил-пролил изомеразы SlyD для получения биологически активных рекомбинантных рецепторных белков бактериофагов Pseudomonas aeruginosa" Международная научная конференция по биоорганической химии, биотехнологии и бионанотехнологии, посвященная 75-летию со дня рождения академика , Москва-Пущино, 28 сентября - 2 октября 2009
1.4.10. , , "Пространственная реконструкция капсидов и идентификация поверхностных белков бактериофагов Pseudomonas aeruginosa электронно-микроскопическими методами" Международная научная конференция по биоорганической химии, биотехнологии и бионанотехнологии, посвященная 75-летию со дня рождения академика , Москва-Пущино, 28 сентября - 2 октября 2009
1.4.11 Чупров-, , "Бета-спиральный домен бактериофага Т4 и пептидил-пролил изомераза управляют укладкой фрагмента длинных хвостовых фибрилл в составе химерного белка" Международная научная конференция по биоорганической химии, биотехнологии и бионанотехнологии, посвященная 75-летию со дня рождения академика , Москва-Пущино, 28 сентября - 2 октября 2009
1.4.12 , , "Препаративная очистка бактериофагов Pseudomonas aeruginosa хроматографическими методами" Международная научная конференция по биоорганической химии, биотехнологии и бионанотехнологии, посвященная 75-летию со дня рождения академика , Москва-Пущино, 28 сентября - 2 октября 2009
1.4.13. Chuprov-Netochin R. N., Shneider M. M., Sykilinda N. N., Mesyanzhinov V. V., Miroshnikov K. A. "Active recombinant bacteriophage T4 gp37 produced by protein fusion engineering" 3rd Symposium on Phages in Interaction, Leuven, Belgium, December 18, 2009
1.4.14. Krylov S., Pleteneva E., Shaburova O., Burkaltseva M., Miroshnikov K., Krylov V."Virulent mutants of Pseudomonas aeruginosa bacteriophage EL" 3rd Symposium on Phages in Interaction, Leuven, Belgium, December 18, 2009
1.4.15. Burkaltseva M., Pleteneva E., Shaburova O., Krylov S., Miroshnikov K., Pechnikova E., Sokolova O., Krylov V."Halo-producing Pseudomonas aeruginosa phages: Specificities of the capsule disrupting products" 3rd Symposium on Phages in Interaction, Leuven, Belgium, December 18, 2009
1.4.15. Miroshnikov K. A., Sykilinda N. N., Shkatula S. V., Kulikov E. E. "Liquid chromatography for preparative purification of Pseudomonas aeruginosa bacteriophages" 3rd Symposium on Phages in Interaction, Leuven, Belgium, December 18, 2009
1.4.16. «Современные принципы подбора компонентов для фаготерапевтических препаратов. Селекция, характеристика, очистка» II симпозиум «Биофарма-2010» Ереван, Армения, 17-20 мая 2010.
1.4.18. Miroshnikov K. A. “Selection and purity of the phages used in therapeutic mixtures” IV Conference on bacteriophage research Osaka, Japan; September 9-10, 2010
1.4.19. Чупров-, , «ПЦР – генотипирование бактериофагов Pseudomonas aeruginosa, входящих в состав лекарственных препаратов» Вакцинология-2010. Москва. 9-10 ноября 2010
1.4.20. Browning C., Shneider M., Miroshnikov K., Leiman P. “Structure of the bacteriophage T4 gp25 – the highly conserved protein of phages with contractile tails” Viruses of Microbes, Paris, France, June 21-25.2010
1.4.21. Miroshnikov K., Sykilinda N., Kulikov E. “Tailed bacteriophages of different morphology purified by liquid chromatography” Viruses of Microbes, Paris, France, June 21-25.2010
1.4.22. Ivanova M., Miroshnikov K., Shneider M., Mesyanzhinov V. “Recombinant fibrous adhesin gp131 of Pseudomonas aeruginosa bacteriophage phiKZ produced by protein engineering” Viruses of Microbes, Paris, France, June 21-25.2010
1.4.23. Sykilinda N., Kovadlo A., Kadykov V., Shneider M., Kurochkina L., Dutova N., Drucker V., Miroshnikov K., Mesyanzhinov V "Bacteriophage diversity of Lake Baikal” Viruses of Microbes, Paris, France, June 21-25.2010
1.4.24. Popov D., Pchelintsev S., Ozerov M., Popov V., Miroshnikov K., Ackermann H-W., Karkischenko N., Grishin D. “Phage use in therapy of anthrax” Viruses of Microbes, Paris, France, June 21-25.2010
1.4.25. Сыкилинда_Н. Н., , «Молекулярно-генетические и биологические характеристики бактериофагов Pseudomonas aeruginosa озера Байкал». 3-й Байкальский микробиологический симпозиум с международным участием «Микроорганизмы и вирусы в водных экосистемах», г. Иркутск, 3-8 октября 2011 г.
1.4.26. «Фаготерапия как путь решения проблемы антибиотикорезистентности" Конгресс "Инфекционные болезни у детей: Диагностика, лечение и профилактика", Санкт-Петербург, 5-6.октября 2011
1.4.27. Miroshnikov K. A. “PCR-based genotyping of therapeutic Pseudomonas bacteriophages" 1st Sympisium on Antimicrobial Research" Beijing, China, December 1-3, 2011
1.4.28. Sycheva L., Shneider M., Miroshnikov K., Leiman P. Crystal Structure of the product of gene 131 of the Pseudomonas aeruginosa bacteriophage phikz 25th Rhine-Knee Regional Meeting on X-ray Chrystallography of Biomacromolecules, Sursee, Switzerland September 28-30. 2011
1.4.29. Sycheva L., Shneider M., Miroshnikov K., Leiman P. Crystal Structure of the product of gene 131 of the Pseudomonas aeruginosa bacteriophage phikz XXII Phage/Virus Aseembly, Port Aransas, Texas, USA, October 9-14 2011
1.4.30. Miroshnikov K., Tsyganova M., Romanova I., Sykilinda N., Kulikov E., Darbeeva O. PCR-based genotyping of therapeutic Pseudomonas and Staphylococcus bacteriophages. Viruses of Microbes. From exploration to the - omics era. Brussel, Belgium, July 16-20, 2012.
1.4.31. , , ПЦР-типирование терапевтических фагов Staphylococcus aureus и Pseudomonas aeruginosa. III научно-практическая конференция "Постгеномные методы анализа в биологии, лабораторной и клинической медицине". Казань, 22-24 ноября 2012.
1.4.32. , , «ПЦР система типирования терапевтических бактериофагов Pseudomonas aeruginosa” Международная научно-практическая конференция «Бактериофаги. Теортические и практические аспекты применения в медицине, ветеринарии и пищевой промышленности» 23-25 апреля 2013, Ульяновск.
1.4.33. , , Куликов NextGen секвенирования в геномике бактериофагов. Международная конференция «Высокопроизводительное секвенирование в геномике» 21-25 июля 2013, Новосибирск.
1.5. Патенты и свидетельства о регистрации программ для ЭВМ и баз данных
нет
1.6. Препринты
нет
1.7. Научно-популярные книги и статьи
1.7.1. «Пожиратели бактерий» Популярная механика (2013) №10 http://elementy. ru/lib/432141
1.7.2. омментарий к статье А. Кучук «Врачи-инфекционисты: «Супербактерия» может мутировать и добраться до России» Комсомольская правда-Здоровье+ 20 сентября 2010 http://www. kp. ru/daily/24560.5/735215/
1.7.3. омментарий к статье «Эра антибиотиков кончается, но замена им есть» Аргументы и Факты – Здоровье 12 февраля 2013 http://www. aif. ru/health/life/4028
1.7.4. интервью в статье «Когда антибиотики бессильны» Эксперт №9 (888) 24 февраля 2014 http://expert. ru/expert/2014/09/kogda-antibiotiki-bessilnyi/
1.8. Другие публикации по вопросам профессиональной деятельности
1.8.1. «Альтернативные противомикробные препараты» видеолекция на портале ПостНаука 10 марта 2013 http://postnauka. ru/video/9993
1.8.2. «Бактериофаги» видеолекция на портале «Постнаука» 18 февраля 2013 http://postnauka. ru/video/9563
СВЕДЕНИЯ О ЛИЧНОМ УЧАСТИИ В НАУЧНЫХ МЕРОПРИЯТИЯХ
(2009–2013 гг.)
Фамилия, имя, отчество научного работника:
Структурное подразделение: _лаборатория молекулярной биоинженерии________
Вид1) и наименование (тема) научного мероприятия | Статус доклада2) | Уровень мероприятия3) | Тема доклада | Дата и место проведения |
IV Российский симпозиум "Белки и пептиды" | секцион-ный | международный | Электронно-микроскопическое картирование поверхностных белков и объемная реконструкция капсидов бактериофагов Pseudomonas aeruginosa | 23-27 июня 2009, г. Казань |
18th Evergreen International Phage Biology Meeting | пленар-ный | международный | Fibrous adhesin gp131 of Pseudomonas aeruginosa giant bacteriophage phiKZ | 9-14 августа 2009, Олимпия, Вашингтон США |
Международ-ная научная конференция по биооргани-ческой химии, биотехнологии и бионанотех-нологии, по-священная 75-летию со дня рождения ака-демика | стендо-вый | международный | Препаративная очистка бактериофагов Pseudomonas aeruginosa хроматографи-ческими методами | 28 сент. - 2 октября 2009 Москва-Пущино |
3rd Symposium on Phages in Interaction | стендо-вый | международный | Liquid chromatography for preparative purification of Pseudomonas aeruginosa bacteriophages | 18 декабря 2009 Левен, Бельгия |
II симпозиум «Биофарма-2010 | секцион-ный | международный | Современные принципы подбора компонентов для фаготерапевтичес-ких препаратов. Селекция, харак-теристика, очистка | 17-20 мая 2010, Ереван, Армения |
IV Conference on bacterio-phage research | секцион-ный | международный | Selection and purity of the phages used in therapeutic mixtures | 9-10 сентября 2010, Осака, Япония |
Вакциноло-гия-2010 | секцион-ный | всероссий-ский | ПЦР – генотипирова-ние бактерио-фагов Pseudo-monas aerugi-nosa, входящих в состав лекар-ственных пре-паратов | 9-10 ноября, Москва |
Viruses of Microbes | стендо-вый | международный | Tailed bacteriophages of different morphology purified by liquid chromatography | 21-25 июня 2011, Париж, Франция |
Конгресс "Инфекцион-ные болезни у детей: Диаг-ностика, лече-ние и профи-лактика | секцион-ный | всероссий-ский | Фаготерапия как путь решения проблемы антибиотикорезистентности | 5-6 октября 2011, Санкт-Петербург |
1st Symposium on Antimic-robial Research | пленар-ный | международный | PCR-based genotyping of therapeutic Pseudomonas bacteriophages | 1-3 декабря 2011, Пекин, Китай |
Viruses of Microbes. From exploration to the - omics era | стендо-вый | международный | PCR-based genotyping of therapeutic Pseudomonas and Staphylo-coccus bacterio-phages | 16-20 июля 2012, Брюссель, Бельгия |
Международная научно-практическая конференция «Бактериофаги. Теоретические и практические аспекты приме-нения в меди-цине, ветерина-рии и пищевой промышленности | стендо-вый | международный | ПЦР система типирования терапевтичес-ких бакте-риофагов Pseudomonas aeruginosa | 23-25 апреля 2013, Ульяновск |
Международная конференция «Высокопроиз-водительное секвенирование в геномике» | пленар-ный | международный | Перспективы NextGen секвенирования в геномике бактериофагов | 21-25 июля 2013, Ново-сибирск |
Форма 2
Участие в выполнении грантов, контрактов, договоров
(2009–2014 гг.)
Фамилия, имя, отчество научного работника:
Структурное подразделение: Лаборатория молекулярной биоинженерии
Номер гранта, программы / контракта / договора | Тема, предмет гранта, программы / контракта / договора | Срок (период) действия гранта, программы / контракта / договора | Статус участия (руководитель, исполнитель) | Функции, выполняемые научным работником (его конкретная роль) |
1. Гранты, программы: | ||||
09-04-00335-а | Белковая инженерия с использованием пептидил-пролил изомераз типа SlyD в качестве матрицы фолдинга | 2009-2010 | руководитель | Разработка стратегии проекта, анализ данных исполнителей, взаимодействие с коллабораторами, ведение отчетности и публикаций. |
09-05-00725-а | Бактериофаги – новое трофическое звено в экосистеме уникального олиготрофного озера Байкал | 2009-2011 | исполнитель | Разработка методов экспресс-очистки и характеристики бактериофагов в природных пробах |
11G34.31.0004 | Химический дизайн бионаноматери- алов | 2011-2014 | исполнитель | Клонирование, синтез и очистка рекомбинантных пептидогликан-гидролаз, специфических против стафилококков |
12-04-00765-а | Генотипирование Терапевтических бактериофагов псевдомонад и стафилококков | 2012-2014 | руководитель | Идентификация фагов из различных источников с помощью ПЦР с использованием праймеров, разработанных в лаб. молекулярной биоинженерии |
2. Контракты, договоры: | ||||
20-3/5-09-ИБХ от 01.01.2001 | Проведение предполетной подготовки препаратов, преднаначен. для КЭ «Структура» в период МКС -18. Поиск условий кристаллизации, подготовка и заправка УБК | 2009 | руководитель | Планирование эксперимента, подбор белков для включения в программу КЭ, контроль чистоты предоставленных биопрепаратов, комплекности кристаллизатора, постановка опыта, отчетность |
ИО-02-09-ИБХ от 01.01.2001 | Анализ результатов рентгенографических исследований по КЭ «Интерлейкин-К», «Миметик-К», «Вакцина-К», «Гликопроте-ид», «КАФ». Подготовка итоговых отчетов | 2009 | руководитель | Анализ кристаллографических данных, полученных в ходе эксперимента «Структура» в период 2005 – 2008 гг. Предложения по стратегии постановки эксперимента на ближайший период |
22-05-10-ИБХ от 01.01.2001 | Проведение предполетной подготовки биопрепаратов и осаждающих агентов для КЭ «Структура» в период МКС -22 и МКС-25 | 2010 | руководитель | Планирование эксперимента, подбор белков для включения в программу КЭ, контроль чистоты предоставленных биопрепаратов, комплекности кристаллизатора, постановка опыта, отчетность |
11-405/10 от 01.01.2001 | Конструирование ПЦР-диагностической системы для характеристики бактериофагов Pseudomonas aeruginosa | 2010 | руководитель | Разработка стратегии проекта, анализ генетических данных, анализ результатов, отчетность. |
23/05-11 ИБХ от 01.01.2001 | Подготовка биопрепаратов, предназначен. для проведения КЭ «Структура» в период МКС -27 и МКС-29, оптимизация условий их кристаллизации | 2011 | руководитель | Планирование эксперимента, подбор белков для включения в программу КЭ, контроль чистоты предоставленных биопрепаратов, комплекности кристаллизатора, постановка опыта, отчетность |
24/3-11-ЦН от 01.01.2001 | Исследования кристаллизации белков в период МКС-27. Обработка результатов КЭ «Структура» основными экспедициями | 2012 | руководитель | Планирование эксперимента, подбор белков для включения в программу КЭ, контроль чистоты предоставленных биопрепаратов, комплекности кристаллизатора, постановка опыта, отчетность |
23-5/05-12-ИБХ от 01.01.2001 | Подготовка предназначен. для экспериментов биопрепаратов. Поиск условий их кристаллизации для КЭ «Структура» в период МКС -31 и МКС-33., | 2012 | руководитель | Планирование эксперимента, подбор белков для включения в программу КЭ, контроль чистоты предоставленных биопрепаратов, комплекности кристаллизатора, постановка опыта, отчетность |
25/3-12-ЦН от 01.01.2001 | Исследования кристаллизации белков в период в период МКС -31 и МКС-33., Обработка результатов реализации КЭ «Структура основными экспедициями 2012г. | 2012 | руководитель | Планирование эксперимента, подбор белков для включения в программу КЭ, контроль чистоты предоставленных биопрепаратов, комплекности кристаллизатора, постановка опыта, отчетность |
26/3-13-ЦН от 01.01.2001 | Исследования кристаллизации белков в период в период МКС -33 и МКС-35., Обработка результатов реализации КЭ «Структура основными экспедициями 2013г. | 2013 | руководитель | Планирование эксперимента, подбор белков для включения в программу КЭ, контроль чистоты предоставленных биопрепаратов, комплекности кристаллизатора, постановка опыта, отчетность |
№_23-7/05-13-ИБХ от 01.01.2001 | «Подготовка предназначенных для эксперимента биопрепаратов. Поиск условий их кристаллизации для КЭ «Структура» в период МКС-35 и МКС-37» | 2013 | руководитель | Планирование эксперимента, подбор белков для включения в программу КЭ, контроль чистоты предоставленных биопрепаратов, комплекности кристаллизатора, постановка опыта, отчетность |
Скрининг, дифференциация методом ПЦР и выделение вирулентных фаговых клонов Pseudomonas и Staphylococcus из образцов лечебно-профилактических препаратов бактериофагов | 2013 | руководитель | Характеристика вирулентных фаговых клонов из терапевтичес-ких препаратов производства НПО «Микроген». Разработка и реализация стратегии проекта. |
СВЕДЕНИЯ О ПЕДАГОГИЧЕСКОЙ ДЕЯТЕЛЬНОСТИ
(2009–2013 гг.)
Фамилия, имя, отчество научного работника:
Структурное подразделение: _Лаборатория молекулярной биоинженерии_______
Вид педагогической деятельности и место ее осуществления | Наименование (тематика) конкретного вида педагогической деятельности | Период осуществления конкретного вида педагогической деятельности | Документы, подтверждающие сведения |
1. Чтение курсов лекций: | |||
Спецкурс, магистратура МФТИ, кафедра молекулярной биофизики ФМБФ | Молекулярная вирусология, лекционный спецкурс (осенний семестр) | 2006-наст. время | |
2. Проведение семинаров: | |||
3. Научное руководство аспирантами: | |||
Чупров , научное руководство аспирантом, ИБХ РАН | Использование бета-спирального домена и пептидид-пролил изомеразы для инженерии биологически активных рекомбинантных белков бактериофагов | 2008 – 2010, диссертация защищена в 2012 | |
, научное руководство аспирантом, ИБХ РАН | Белковая инженерия с использованием пептидил-пролил изомераз типа SlyD в качестве матрицы фолдинга | 2009 – 2011 | |
, научное руководство аспирантом, ИБХ РАН | ПЦР-типирование терапевтических препаратов стафилококковых бактериофагов | 2011 – 2012 отчислилась из аспирантуры по семейным обстоятельствам | |
, научное руководство аспирантом, ИБХ РАН | Изучение функции минорных структурных белков бактериофага phiKMV | 2011 – н. в. | |
4. Другие виды педагогической деятельности1): | |||
, научное руководство дипломной работой, ИБХ РАН | Диплом магистра МФТИ «Разработка метода хромато-графической очистки бактериофагов Pseudomonas aeruginosa» | 2008 - 2009 | |
, научное руководство дипломной работой, ИБХ РАН | Диплом магистра МФТИ «Исследование фибриллярных рецептор-связывающих белков бактериофагов Pseudomonas aeruginosa» | 2008 - 2009 | |
, научное руководство дипломной работой, ИБХ РАН | Диплом МГУ (биологический ф-т каф. вирусологии) «Разработка метода выделения и очистки бактериофагов с помощью различных типов хроматографии» | 2009 - 2010 | |
, научное руководство дипломной работой, ИБХ РАН | Диплом МГУ (биологический ф-т каф. вирусологии) «ПЦР-дифференциация терапевтических бактериофагов Staphylococcus aureus по их функциональным генам» | 2009 - 2011 | |
, научное руководство дипломной работой, ИБХ РАН | Диплом МГУ (биологический ф-т каф. вирусологии) «ПЦР-дифференциация терапевтических бактериофагов Pseudomonas aeruginosa по их функциональным генам» | 2009 - 2011 | |
участие в экспертном совете, Ю | III и IV конкурсы научно-исследовательскихработ «Школьная академия наук» | 2010 и 2011 |
УЧАСТИЕ В РЕДАКЦИОННЫХ КОЛЛЕГИЯХ НАУЧНЫХ ЖУРНАЛОВ
Фамилия, имя, отчество научного работника:
Структурное подразделение: _Лаборатория молекулярной биоинженерии_______
Период | Наименование научного журнала (издания) | Сведения об участии научного работника в редколлегии научного журнала (выполняемые функции) | Какими документами подтверждаются сведения |
2012 – наст. время | The Bacteriophage (Landes Bioscience, Online ISSN:2159-7081) | Обсуждение стратегии выпусков журнала, переписка с рецензентами и авторами. | https://www. /journals/bacteriophage/editorialboard/ |
Научный работник:
(с. н.с., и. о. рук. лабораторией) (подпись) ()
Руководитель структурного подразделения:
(Директор ИБХ РАН) (подпись) ()
