Аберрантное метилирование ряда генов хромосомы 3(3р).
Диагностика и лечение рака молочной железы (РМЖ) остается сложной задачей и лидирующей причиной смерти среди гинекологических раков в мире. Эпигенетические изменения считаются одним из наиболее перспективных инструментов для ранней диагностики рака. Цель исследования изучить метилирование генов хромосомы 3 (3р): RHOA, GPX1, USP4, DAG1, MGMT и RASSF1A, RARbeta2, SEMA3B для разработки критериев диагностики и прогноза РМЖ. Материалы и методы. Метилирование определялось метилчувсвительным рестрикционным анализом (МЧРА), гиперметилированные образцы подтверждались бисульфитным секвинированием. Дополнительный контроль включал 10 образцов тканей молочной железы, полученных от доноров без онкологических заболеваний в анамнезе.
Результаты. Метилирование RHOA, GPX1, DAG1 и USP4 в первичных опухолях выявлялось с частотой от 12% до 30%. В образцах морфологически нормальной ткани тех же пациенток метилирование наблюдалось с частотой от 9% до 12% Метилирование RASSF1A, RARв2, SEMA3B было значительно выше: 78% (32/41), 46% (26/56), 35% (22/65), соответственно. Эти гены метилировались в опухоли значительно чаще, чем в морфологически нормальной ткани (0-10%). При исследовании контрольной ДНК от онкологически здоровых доноров метилирования перечисленных генов обнаружено не было. Метилирование DAG1 и USP4 коррелировало с размером опухоли и (P = 0.0008) и метастазами в регионарнарные лимфоузлы и отдаленными метастазами (P = 0.0141). Аберрантное метилирование RARв2 and SEMA3B ассоциировалось со степенью дифференцировки опухоли и со стадией заболевания. RASSF1A и MGMT метилировались более часто в низкодиффренцированых опухолях (P=0,0008) и в трижды негативном РМЖ (33% (5/15), 40% (6/15), соответственно). Метилирование промоторного региона RHOA наиболее часто выявлялось (57%) в трижды негативном РМЖ.
Заключение. Изученные гены расширяют профиль эпигенетических изменений в генах хромосомы 3(3р), позволяют понять роль эпигенетических изменений при РМЖ. Полученные данные могут быть использованы для формирования диагностической панели, включающей гены наиболее часто метилирующиеся при РМЖ. Аберрантное метилирование генов RHOA, GPX1, USP4, RASSF1A, RARв2, SEMA3B, MGMT может быть индикатором прогрессии первичной опухоли на разных стадиях РМЖ и это открывает возможности в будущей деметилирущей терапии для разработки ингибиторов метилирования ДНК.
Эта работа поддерживалась грантом Российского Научного Фонда (РНФ) # 14-15-00654.
Ключевые слова: Рак молочной железы, эпигенетические изменения, гены хромосомы 3.
