Кандидатуры на стипендии

Уважаемые члены Ученого совета!

Для аспирантов нашего Института на 2017/2018 учебный год выделена 1 (одна) стипендия Президента РФ и 1 (одна) - Правительства РФ.  Для утверждения Ученым советом предлагаются следующие кандидатуры:

1. (Тюлькина) – аспирант 3 года обучения

Научный руководитель –к. б.н.

Публикации:

, , Тюлькина (Антонова) Д. В., , Причина раковых мутаций: поправимая плохая жизнь или неизбежные стохастические ошибки репликации? // Молекулярная биология, 2016, Т. 50, № 6, с. 1–16. , , Тюлькина (Антонова) Д. В., , Белок активации фибробластов FAP как возможная мишень в противоопухолевой стратегии. // Молекулярная генетика, микробиология и вирусология, 2016, №3, с. 90-97. (Антонова), , академик РАН . Экспрессия гена FAP в нефибробластных клеточных линиях человека – создание моделей опухоль-ассоциированных фибробластов. // Доклады Академии Наук, 2016, Т. 470, № 1, с. 105–107. (Антонова). Создание рекомбинантных конструкций для исследования влияния гена CCN2 на миграционную активность опухолевых клеток при раке поджелудочной железы. // Медицинский академический журнал, 2016, том 16, №4, стр. 67-68.
Участие в конференциях:

1). III Всероссийская научная конференция молодых ученых «Проблемы биомедицинской науки третьего тысячелетия», Санкт-Петербург, 12-14 сентября 2016. Стендовый доклад. () «Создание рекомбинантных конструкций для исследования влияния гена CCN2 на миграционную активность опухолевых клеток при раке поджелудочной железы. Опубликовано – Медицинский академический журнал, 2016, том 16, №4, стр 67-68.

2) XXIX Зимняя молодежная научная школа «Перспективные направления физико-химической биологии и биотехнологии», Москва, 7-10 февраля 2017.

Очное участие, устный доклад.

Тезисы и доклад: Секция «Фундаментальные и прикладные аспекты биотехнологии и бионанотехнологии», стр. 5: Поиск модельных клеточных линий для использования FAP в качестве мишени при противоопухолевой терапии. , , .

5. Участие в грантах:

Руководитель:

1) Грант РФФИ №16-34-01222 мол_ «Исследование влияния факторов, экспрессируемых фибробластами, на подвижность клеток рака поджелудочной железы», (руководитель гранта), ; 2016-2017

Исполнитель:

1) Грант РФФИ № 16-04-01842. «Исследование функционального статуса трансгена, экспрессируемого в течение длительного времени в клетках опухоли поджелудочной железы», , ; 2016-2018

2) Грант РФФИ №15-04-04589. «Исследование влияния направленных модификаций положительно заряженных рекомбинантных белков на эффективность внутриклеточного транспорта их комплексов с ДНК», , ; 2016-2017

3) Грант Российского научного фонда № 14-50-00131 «Белки и пептиды в постгеномную эру. Структурно-функциональные исследования для решения фундаментальных задач и направленного конструирования инновационных лекарственных средств»,  направление «Мастер-регуляторные белки и гены развития и канцерогенеза на примере поджелудочной железы», рук. ; 2015-2018

Научное руководство дипломными работами

2016-2017 г., , студент 4-ого курса, защита бакалаврского диплома в июне 2017 г. на кафедре физико-химической биологии и биотехнологии Факультета биологической и медицинской физики МФТИ

2. – аспирант третьего года обучения

Научный руководитель к. б.н.

Публикации:

Kondratyeva LG, Sveshnikova AA, Grankina EV, Chernov IP, Kopantseva MR, Kopantzev EP, Sverdlov ED DOWNREGULATION OF EXPRESSION OF MATER GENES SOX9, FOXA2, AND GATA4 IN PANCREATIC CANCER CELLS STIMULATED WITH TGFВ1 EPITHELIAL-MESENCHYMAL TRANSITION // DoklBiochemBiophys. 2016 Jul;469(1):257-9. L. Kondratyeva, A. Sveshnikova, I. Chernov, E. Kopancev, E. SverdlovTHE PANCREATIC MASTER GENES EXPRESSION IN PANC1 CELLS STIMULATED WITH TGFВ1 // European Journal Of Human Genetics, May 2016, Volume 24 E-Supplement 1, P.296 , , KLF5, НОВЫЙ ИГРОК И НОВАЯ МИШЕНЬ В ПОСТОЯННО МЕНЯЮЩЕМСЯ СОСТАВЕ МОЛЕКУЛЯРНЫХ ДВИГАТЕЛЕЙ РАКА ПОДЖЕЛУДОЧНОЙ ЖЕЛЕЗЫ // Биоорганическая Химия, 2016, том 42, № 6, с. 668–674. , , ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ МАСТЕР-РЕГУЛЯТОРОВ ЭМБРИОНАЛЬНОГО РАЗВИТИЯ В ОПУХОЛЯХ ПОДЖЕЛУДОЧНОЙ ЖЕЛЕЗЫ // Доклады Академии Наук, 2017, в печати. , , ЗАВИСИМОСТЬ ЭКСПРЕССИИ МАСТЕР РЕГУЛЯТОРНЫХ ГЕНОВ ЭМБРИОНАЛЬНОГО РАЗВИТИЯ В КЛЕТКАХ РАКА ПОДЖЕЛУДОЧНОЙ ЖЕЛЕЗЫ ОТ ВНУТРИКЛЕТОЧНОЙ КОНЦЕНТРАЦИИ МАСТЕР РЕГУЛЯТОРА PDX1 // , Доклады Академии Наук, 2017, в печати. , , PCNA: КОНСТИТУТИВНЫЙ ПРОМОТОР ЧЕЛОВЕКА ДЛЯ ЭКСПРЕССИИ ГЕНОВ В ЦЕЛЯХ ИХ ФУНКЦИОНАЛЬНОГО И ГЕННО-ТЕРАПЕВТИЧЕСКОГО ИСПОЛЬЗОВАНИЯ // Молекулярная генетика, микробиология и вирусология, 2017, в печати.

       Участие в конференциях:

1. XXVIII Зимняя молодежная научная школа «Перспективные направления физико-химической биологии и биотехнологии», 8.02.16 - 11.02.16 Москва. Постерный доклад. «Изучение экспрессии генов мастер-регуляторных транскрипционных факторов ы клетках линии Panc1, стимулированных TGFb1», , сборник тезисов, стр.80

2. The EuropeanHuman GeneticsConference 2016, 20.05.16-24.05.16  Барселона, Испания. Постерный доклад. TGFв1” L. Kondratyeva, A. Sveshnikova, I. Chernov, E. Kopancev, E. Sverdlov,  European Human Gene«The pancreatic master genes expression in Panc1 cells stimulated with tics Conference 2016 Abstracts, Cancer Genetics, p. 296

3.  Всероссийская конференция с международным участием «Актуальные проблемы современной генетики» Казанского Федерального Университета, 20-22 октября 2016, Казань. Постерный доклад. «Оценка влияния сверхэкспрессии гена PDX1 на клетки рака поджелудочной железы» , ,  тезисы докладов, стр. 59-61

4. XXIХ Зимняя молодежная научная школа "Перспективные направления физико-химической биологии и биотехнологии", Москва, 7-10 февраля 2017. Устный доклад. «Экспрессия генов мастер регуляторов развития поджелудочной железы в опухолевых образцах» , , сборник тезисов. Стр. 24

5. 55-я Международная научная студенческая конференция МНСК-2017, Новосибирский государственный университет 16-20.04.2017. «Экспрессия мастер генов развития поджелудочной железы в образцах фетальной поджелудочной железы человека» , Тезисы в печати

Участие в грантах:

1. РНФ 14-50-00131. Белки и пептиды в постгеномную эру. Структурно-функциональные исследования для решения фундаментальных задач и направленного конструирования инновационных лекарственных средств. Мастер-регуляторные белки и гены развития и канцерогенеза на примере поджелудочной железы.  Исполнитель.

2.Грант РФФИ 15-04-07773 , , 2015. Поиск промоторов генов, обладающих повышенной экспрессией в клетках стромы опухоли. Исполнитель.

3. Грант РФФИ №16-34-01222 мол._ «Исследование влияния факторов, экспрессируемых фибробластами, на подвижность клеток рака поджелудочной железы», (руководитель гранта), ; 2016-2017. Исполнитель.

Исполнитель

3. -аспирант 2-го года обучения

Научный руководитель д. б.н.

Достижения:

1) Публикации:

Статьи

ZvyaginI. V., MamedovI. Z., TatarinovaO. V., KurnikovaE. E., BoyakovaE. V., BrilliantovaV., ShelikhovaL. N., BalashovD. N., KomechE. A., ShugayM., SychevaA. L., KasatskayaS. A., LebedevY. B., MaschanA. A., MaschanM. A., ChudakovD. M. TrackingT-cellimmunityreconstitutionafterTCR бв/CD19-depletedhematopoieticcellstransplantationinchildren // Leukemia (IF 12,104 на 2015 год), 2016. doi: 10.1038/leu.2016.321. [Epubaheadofprint].

Тезисы и конференции

Pogorelyy M. V., Sycheva A. L., Komech E. A., Marcou Q., Elhanati Y., Mora T., Walczak A., Mamedov I. Z., Lebedev Y. B. Deep TCR repertoire profiling after seasonal influenza vaccination // 4th European Congress of Immunology. 06-09 September 2015 Vienna, Austria.  Abstract book, p432. ECI 2015 http://www. eci-vienna2015.org/images/docs/ECI2015_Abstract-Book-v2.pdf (постер) Sycheva A. L.,Pogorelyy M. V., Komech E. A., Mamedov I. Z., Lebedev Y. B. Dynamics of human T cell repertoire in course of influenza vaccination and subsequent revaccination within a year // 4th European Congress of Immunology. 06-09 September 2015 Vienna, Austria.  Abstract book p433. ECI 2015 http://www. eci-vienna2015.org/images/docs/ECI2015_Abstract-Book-v2.pdf (постер) , , Динамика Т-клеточного репертуара человека в ходе противогриппозной вакцинации и ревакцинации // XXVIII зимняя молодежная научная школа «Перспективные направления физико-химической биологии и биотехнологии». Москва 8-11 февраля 2016 г. Сборник тезисовс. 27 (устныйдоклад) Sycheva A. L., PogorelyyM. V., KomechE. A., MamedovI. Z., Lebedev Y. B. Dynamics of human T cell repertoire in course of influenza vaccination and subsequent revaccination within a year // 12th EFIS-EJI Tatra Immunology Conference “Molecular determinants of T-cell immunity”. 03-07 September 2016, StrbskePleso, Slovakia. Abstract book p.68 (постер) , , Изучение малых субпопуляций активированных Т-лимфоцитов из крови доноров, вакцинированных против вируса жёлтой лихорадки // XXIXзимняя молодежная научная школа «Перспективные направления физико-химической биологии и биотехнологии». Москва 7-10 февраля 2017 г. Сборник тезисов с. 98 (постер)

2) Участие в грантах

РФФИ 14-04-01823a (2014-2016 гг.)  «Динамический анализ индивидуальных репертуаров периферических Т-лимфоцитов при вакцинации»

Руководитель:

Исполнители: , ,

Доля участия: 14,3%.

РФФИ 16-04-01881a (2016-2018 гг.) «Мониторинг динамики эффекторных и Т клеток памяти донора формирующих противовирусный иммунитет реципиента при различных типах аллогенной трансплантации клеток крови у детей»

Руководитель:

Исполнители: , ,

Доля участия: 20%.

РНФ 15-15-00178 (2015-2017) "Изучение динамики системы клеточного адаптивного иммунитета при флавивирусной инфекции"

Состав трудового коллектива:

  (рук.  гранта), ,

Доля участия: 12,5%.

РФФИ 17-04-01568 (2017-2019) «Анализ клонального спектра малых субпопуляций Т-лимфоцитов при формировании иммунного ответа у человека»

Руководитель:

Исполнители: , ,

Доля участия: 20%.

3) Грамоты и награды

Сертификат об участии в12th EFIS-EJI Tatra Immunology Conference “Molecular determinants of T-cell immunity”. StrbskePleso, Slovakia, September 3-7, 2016.

Диплом победителя в конкурсе молодых учёных за работу «Динамика Т-клеточного репертуара человека в ходе противогриппозной вакцинации и ревакцинации». XXVIII зимняя молодежная научная школа «Перспективные направления физико-химической биологии и биотехнологии». Москва 8-11 февраля 2016 г.

4) Научно-педагогическая деятельность

Выступление с докладом «Можно ли победить грипп?» на научно-популярном мероприятии «День биологии для школьников». Москва, 9 декабря 2016 г.

Выступление с лекцией «Эффективно и универсально: возможно ли создать лекарство от гриппа» в рамках научно-популярного проекта «Физтех. Читалка: лекции от студентов, аспирантов, преподавателей МФТИ и их друзей». Москва, 23 марта 2017 г.

Проведение практикума у студентов 4-го курса кафедры биоорганической химии Биологического факультета МГУ на тему «Полимеразная цепная реакция. Теоретические основы метода. ПЦР с обратной транскрипцией». 14-17 февраля 2017 г.

5) Отзыв руководителя

всегда ответственно подходит к работе. Аккуратно и в быстрые сроки выполняет поставленные задачи. Регулярно анализирует новую литературу по тематике своей работы. Успешно осваивает биоинформатические методы обработки больших объёмов данных секвенирования. Принимает участие как в разработке новых методов, так и в оптимизации уже используемых. Активно развивает новые экспериментальные направления в нашей лаборатории.

4. - аспирант 2 года обучения

Научный руководитель – .

Публикации за 2016 – 2017 гг

Igor E. Kasheverov, Anton O. Chugunov, Denis S. Kudryavtsev, Igor A. Ivanov, Maxim N. Zhmak, Irina V. Shelukhina, Ekaterina N. Spirova, Valentin M. Tabakmakher, Elena A. Zelepuga, Roman G. Efremov, Victor I. Tsetlin: High-Affinity б-ConotoxinPnIA Analogs Designed on the Basis of the Protein Surface Topography Method. Scientific Reports 11/2016; 6:36848., DOI:10.1038/srep36848 I. E. Kasheverov, E. V. Kryukova, D. S. Kudryavtsev, I. A. Ivanov, N. V. Egorova, M. N. Zhmak, E. N. Spirova, I. V. Shelukhina, A. V. Odinokov, M. V. Alfimov, V. I. Tsetlin: Analysis of binding centers in nicotinic receptors with the aid of synthetic peptides. Doklady Biochemistry and Biophysics 09/2016; 470(1):338-341., DOI:10.1134/S1607672916050070 Catherine A Vulfius, Ekaterina N Spirova, Marina V Serebryakova, Irina V Shelukhina, Denis S Kudryavtsev, Elena V Kryukova, Vladislav G Starkov, Nina V Kopylova, Maxim N Zhmak, Igor A Ivanov, Ksenia S Kudryashova, Tatyana V Andreeva, Victor I Tsetlin, Yuri N Utkin: Peptides from puff adder Bitisarietans venom, novel inhibitors of nicotinic acetylcholine receptors. Toxicon 08/2016; 121., DOI:10.1016/j. toxicon.2016.08.020 G. Faure, I. V. Shelukhina, D. Porowinska, M. A. Shulepko, E. N. Lyukmanova, D. A. Dolgikh, E. N. Spirova, I. E. Kasheverov, Yu. N. Utkin, J. - P. Corringer, V. I. Tsetlin: Interaction of three-finger proteins from snake venoms and from mammalian brain with the cys-loop receptors and their models. Doklady Biochemistry and Biophysics 05/2016; 468(1):193-196., DOI:10.1134/S1607672916030091

5.  Dina Manetti, Cristina Bellucci, Silvia Dei, ElisabettaTeodori, Katia Varani, Ekaterina Spirova, Denis Kudryavtsev, Irina Shelukhina, Victor Tsetlin, Maria Novella Romanelli: New quinoline derivatives as nicotinic receptor modulators. EuropeanJournalofMedicinalChemistry 01/2016; 110., DOI:10.1016/j. ejmech.2016.01.025

Конференции за 2016 – 2017 гг

, , Тестирование сродства классических и новых лигандов к б7 никотиновому ацетилхолиновому рецептору и его мутантным формам методом кальциевого имиджинга. XXVIII Зимняя молодежная научная школа “Перспективные направления физико-химической биологии и биотехнологии» 2016, Москва

Участие в грантах за 2015 – 2017 гг

Грант Президента РФ МК-6216.2016.4 Поиск новых природных и синтетических лигандов мышечного, а7 и а9 никотиновых ацетилхолиновых рецепторов в качестве прототипов лекарственных субстанций. Руководитель: ; Исполнители: , Продолжительность: два года 2016-2017.

Доля участия: 33,3%

Грант РНФ 16-14-00215 Конструирование и синтез пептидов – потенциальных лекарственных средств на основе белков Ly6 cемейства и пептидов Conus. Руководитель: ; Исполнители: , , Продолжительность: три года 2016-2018.

Доля участия: 10,0%

Гранты РФФИ:

16-04-01748 Альфа-нейротоксин змеиного яда: ковалентная димеризация – необходимость или случайность? Руководитель: ; Исполнители: , , . Продолжительность: три года 2016-2018.

Доля участия: 12,5%

16-34-00627 Исследование молекулярного механизма ингибирования мышечного никотинового рецептора макалувамином G. Руководитель: ; Исполнители: , , Продолжительность: два года 2016-2017.

Доля участия: 20,0%

15-04-08338 Создание нового пептидного инструмента исследования ионотропных рецепторов гамма-аминомасляной кислоты на основе альфа-конотоксинов. Руководитель: ; Исполнители: , , Продолжительность: три года 2015-2017.

Доля участия: 10,0%

Научное руководство

2016 – 2017        Дипломная работа , студентки 4-го курса бакалавриата Биологического факультета МГУ им. , кафедры Биоорганической химии

5. - аспирант 2 года обучения

  Научный руководитель – к. х.н.

Публикации:

, , HLA-DR как маркер особого функционального состояния NK-клеток человека (устный доклад). XXVII Зимняя молодёжная научная школа «Перспективные направления в физико-химической биологии и биотехнологии», 7-10 февраля, 2017, Москва. Тезисы докладов и стендовых сообщений, с. 15.

Kovalenko, E. I., Streltsova, M. A., Kanevskiy, L. M., Erokhina, S. A., and Telford, W. G. 2017. Identification of human memory-like NK cells. Curr. Protoc. Cytom. 79:9.50.1-9.50.11. doi:

10.1002/cpcy.13

Участие в конференциях

Erokhina S., Streltsova M., Kanevskiy L., Kovalenko E. Association of HLA-DR expression in NK cells with their differentiation stages. Natural Killer Cell Symposium, March 9-11, 2017, Dusseldorf, Germany. Abstract booklet (posters), p.10.

Kovalenko E., Streltsova M., Erokhina S., Kanevskiy L., Telford W. Characterization of NK cell populations and clones stimulated with IL-2 and modified K562 feeder cells. Natural Killer Cell Symposium, March 9-11, 2017, Dusseldorf, Germany. Abstract booklet (posters), p.12.

Streltsova M., Barsov E., Erokhina S., Kovalenko E. Retroviral transfer into IL-2/feeder cell-activated human NK cells. Natural Killer Cell Symposium, March 9-11, 2017, Dusseldorf, Germany. Abstract booklet (posters), p.17.

Erokhina, S., Streltsova, M., Kanevskiy, L., Kovalenko, E. Generation, characterization and functional analysis of HLA-DR-positive NK cells. European Journal of Immunology, Special Issue: Abstracts of ICI 2016 International Congress of Immunology, 21–26 August 2016, Melbourne, Australia, 46(s1), p. 119-120.

, Изучение возможной роли HLA-DR-экспрессирующих NK-клеток человека в иммунном ответе на M. tuberculosis (постерный доклад). XXVIII Зимняя молодежная научная школа «Перспективные направления физико-химической биологии и биотехнологии», Москва, 9-11 февраля, 2016. Тезисы докладов и стендовых сообщений, с. 111.

Участие в грантах:

Грант РФФИ №16-34-00836 – руководитель

Получение, анализ свойств и роли в иммунном ответе субпопуляции HLA-DR-позитивных NK-клеток (2016-2017 гг).

Грант РФФИ №17-04-00829

Поиск механизма непосредственной активации NK-клеток человека бактериальными липополисахаридами (2017-2019 гг) 

Процент участия 25%

Грант РФФИ №16-04-01867

Роль аллельных групп белка MICA, лиганда рецептора NKG2D, в регуляции противоопухолевой активности клеточного иммунитета (2016-2018 гг).

Процент участия 16,7%

Грант РНФ № 16-15-00309

Оптимизация NK-клеток для адаптивного переноса при восстановлении пациентов после интенсивной противоопухолевой терапии.