Партнерка на США и Канаду по недвижимости, выплаты в крипто

  • 30% recurring commission
  • Выплаты в USDT
  • Вывод каждую неделю
  • Комиссия до 5 лет за каждого referral

Сравнение множественного выравнивания, полученного с помощью программы Clustalw, с «биологически правильным» выравниванием из BaliBase.

· Идентификатор выравнивания из BaliBase: 1pii_ref1;

· Идентификаторы последовательностей (Swiss-Prot accession numbers): O27694, P24920, P18304, P00911;

· Максимальный и минимальный процент совпадения последовательностей (по версии BaliBase): 35, 31;

· Заданный фрагмент выравнивания: 126-150.

Фрагмент выравнивания BaliBase:

TRPC_METTH KDFVVDEYQIyqarASGASSVLIIT

TRPC_PHYPR KDFIIDVYQLlearAYGADCVLLIV

TRPC_HALVO KDFIMNEAQL...dVVQSDLVLLIA

TRPC_ACICA KDFLIDPYNVvearALQADCILLIF

Фрагмент выравнивания Clustalw:

TRPC_METTH KDFLVDEYKIYQARASGASSVLLIT

TRPC_PHYPR KDFIIDVYQLLEARAYGADCVLLIV

TRPC_HALVO KDFIMNEAQLDVVQSD--LVLLIAR

TRPC_ACIAD KDFLIDPYNVVEARALQADCILLIV

ASGASSV – «правильные», т. е. биологически обоснованные участки выравнивания BaliBase
 и сравниваемые с ними фрагменты выравнивания Clustalw;

KDFIIDV – совпадающие «правильные» колонки;

V – аминокислоты ошибочно определенные в BaliBase.

Результаты:

· Длина фрагмента: 24 аминокислотных остатка;

· Доля «правильных» (биологически обоснованных колонок): ~83% (20 из 24);

· Число совпадающих «правильных» колонок: 11.

· Сходство выравниваний: 55% (11 из 20).

Совпадение выравниваний – чуть больше половины, как можно заметить это связано с различиями в выравнивании последовательности TRPC_HALVO. Также необходимо отметить различия в самих аминокислотных последовательностях, происходящие из-за неточного определения структурно похожих остатков при рентгено-структурном анализе и соответственно возникновения неточностей в БД BaliBase.