Аспиранты 2015 г. поступления (стр. 1 )

Аспиранты 2015 г. поступления

(Обучение по ФГОС )

1.

Лаборатория мутагенеза и генетической токсикологии

Зачислена в очную аспирантуру на бюджетной основе 30 октября 2015 года. Приказ №24/а §1 от 15 октября 2015 года.

Научный руководитель: Инге- - академик РАН, директор Санкт-Петербургского филиала ИОГен РАН.

2.

Лаборатория цитогенетики

Зачислена в очную аспирантуру на бюджетной основе 30 октября 2015 года.

Приказ № 24/а §2 от 01.01.01 года.

Научный руководитель: – д. б.н., проф., заведующая. лабораторией цитогенетики.

3.

Лаборатория генетики микроорганизмов

Зачислена в очную аспирантуру на бюджетной основе 30 октября 2015 года.

Приказ № 24/а §3 от 01.01.01 года.

Научный руководитель: , - д. б.н., проф., заведующий лабораторией генетики микроорганизмов.

4.

Лаборатория функциональной геномики

Зачислена в очную аспирантуру на бюджетной основе 30 октября 2015 года. Приказ № 24/а §4 от 01.01.01 года.

Научный руководитель: : к. б.н., доцент, заведующий лабораторией функциональной геномики

Аспиранты 2014 г. поступления

(Обучение по ФГОС )

1.

Лаборатория генетики микроорганизмов

Зачислена в очную аспирантуру на бюджетной основе 31 октября 2014 года.

Приказ № 25/а § 1 от 17 октября 2014 года.

Научный руководитель: - д. б.н., проф., заведующий лабораторией генетики микроорганизмов.

Тема исследования: «Гены и генные системы бифидобактерий, участвующие в коммуникации с нервной системой человека».

Утверждена на заседании Ученого Совета ИОГен РАН 23 декабря 2014 года. Протокол № 9.

Промежуточная аттестация за 1-ый год – аттестована 1 октября 2015 года с рекомендацией (по просьбе аспиранта и согласии научного руководителя) изменить название темы на «Сравнительный эволюционный и функциональный анализ генов видоспецифической серин-треониновой протеинкиназы Pkh-2 у рода Bifidobacterium».

2.

Лаборатория эволюционной геномики

Зачислена в очную аспирантуру на бюджетной основе 31 октября 2014 года.

Приказ № 25/а §2 от 01.01.01 года.

Научный руководитель: : д. б.н., проф., заведующий лабораторией эволюционной геномики.

Тема исследования: «Молекулярно-генетический и эволюционный анализ древних животных Голарктики».

Утверждена на заседании Ученого Совета ИОГен РАН - 23 декабря 2014 года. Протокол № 9.

Промежуточная аттестация за 1-ый год – аттестована 1 октября 2015 года.

3.

Научно-вспомогательное подразделение ЦКП ОБН РАН «Генетический полимофизм»

Зачислена в очную аспирантуру на бюджетной основе 31 октября 2014 года.

Приказ № 25/а §3 от 01.01.01 года.

Научный руководитель: – д. б.н., заведующий ЦКП ОБН РАН "Генетический полиморфизм".

Тема исследования: «Профиль малых РНК в плазме крови человека как диагностический маркер различных физиологических состояний»

Утверждена на заседании Ученого совета ИОГен РАН - 23 декабря 2014 года. Протокол № 9.

Промежуточная аттестация за 1-ый год – аттестована 1 октября 2015 года.

4.

Лаборатория экологической генетики

Зачислена в очную аспирантуру на бюджетной основе 31 октября 2014 года.

Приказ № 25/а §4 от 01.01.01 года.

Научный руководитель: – д. б.н., гл. научный сотрудник лаборатории экологической генетики.

Тема исследования: «Ассоциативное генетическое исследование риска развития и осложненного течения инфекционно-воспалительных заболеваний нижних дыхательных путей».

Утверждена на заседании Ученого Совета ИОГен РАН - 23 декабря 2014 года. Протокол № 9.

Промежуточная аттестация за 1-ый год – аттестована 1 октября 2015 года.

5.

Лаборатория генетики развития

Зачислена в очную аспирантуру на бюджетной основе 31 октября 2014 года.

Приказ № 25/а § 5 от 01.01.01 года.

Научный руководитель: – д. б.н., заведующая лабораторией генетики развития.

Тема исследования: «Эпигенетическая регуляция дифференцировки плюрипотентных клеток по гемопоэтическому пути».

Утверждена на заседании Ученого Совета ИОГен РАН 23 декабря 2014 года. Протокол № 9.

Промежуточная аттестация за 1-ый год – аттестована 1 октября 2015 года.

6.

Лаборатория функциональной геномики

Зачислен в очную аспирантуру на бюджетной основе 31 октября 2014 года.

Приказ № 25/а § 6 от 01.01.01 года.

Научный руководитель: - к. б.н., доцент, заведующий лабораторией функциональной геномики

Тема исследования: «Влияние эпигенетических факторов на развитие иммуновоспалительных заболеваний кожи».

Утверждена на заседании Ученого Совета ИОГен РАН 23 декабря 2014 года. Протокол № 9

Промежуточная аттестация за 1-ый год – аттестован 1 октября 2015 года.

7.

Лаборатория генетики развития

Зачислена в очную аспирантуру на бюджетной основе 31 октября 2014 года.

Приказ № 25/а § 7 от 01.01.01 года.

Научный руководитель: – д. б.н., заведующая лабораторией генетики развития.

Тема исследования: «Изучение молекулярно-генетических механизмов несовершенного остеогенеза».

Утверждена на заседании Ученого Совета ИОГен РАН 23 декабря 2014 года. Протокол № 9.

Промежуточная аттестация за 1-ый год – аттестована 1 октября 2015 года.

Аспиранты 2013 г. поступления

(Обучение по ФГТ)

1. 

Лаборатория системной биологии и вычислительной генетики

Зачислен в очную аспирантуру на бюджетной основе 19 августа 2013 года.

Приказ № 25/а от 19 августа 2013 года.

Научный руководитель: – д. ф.-м..н., заведующий лабораторией системной биологии и вычислительной генетики.

Тема исследования: «Анализ аллельных взаимодействий в формировании предрасположенности к нейродегенеративным заболеваниям».

Утверждена на заседании Ученого Совета ИОГен РАН 5 ноября 2013 года, протокол № 7.

Промежуточная аттестация за 1-ый год: - аттестован 1 октября 2014 года.

Промежуточная аттестация за 2-ой год - аттестован 1 октября 2015 года.

2.

Лаборатория генетики микроорганизмов

Зачислен в очную аспирантуру на бюджетной основе 12 августа 2013 года.

Приказ № 24/а § 1 от 01.01.01 года.

Научный руководитель: , д. б.н., проф., заведующий лабораторией генетики микроорганизмов.

Тема исследования: «Идентификация и характеристика новых биомишеней Streptomyces fradiae для действия антибиотика олигомицина А».

Утверждена на заседании Ученого Совета ИОГен РАН 5 ноября 2013 года, протокол № 7.

Промежуточная аттестация за 1-ый год: - аттестован 1 октября 2014 года.

Промежуточная аттестация за 2-ой год - аттестован 1 октября 2015 года.

Конференции:

1.  МОБИХим 2015 – устный доклад: «Тест-система для скрининга и отбора новых природных и полусинтетических производных олигомицина А, перспективных антиактиномикозных препаратов, на основе Streptomyces fradiae ATCC 19609». 27-30 сентября 2015 г. Новый Свет, Крым. Сборник тезисов – стр. 81.

2.  Публикации:

1.  Bekker OB, Klimina KM, Vatlin AA, Zakharevich NV, Kasianov AS, Danilenko VN. 2014. Draft genome sequence of Streptomyces fradiae ATCC 19609, a strain highly sensitive to antibiotics. Genome Announc. 2(6):e01247-14. doi:10.1128/genomeA.01247-14.

Aleksey A. Vatlin, Olga B. Bekker, Ludmila N. Lysenkova, Valery N. Danilenko 2015. Draft genome sequence of Streptomyces fradiae ATCC 19609- resistant strain to nitron-oligomycin. Genome Announc. issue 5.

3.

Лаборатория системной биологии и вычислительной генетики.

Зачислен в очную аспирантуру на бюджетной основе 12 августа 2013 года.

Приказ № 24/а §2 от 01.01.01 года.

Научный руководитель: – д. ф.-м..н., заведующий лабораторией системной биологии и вычислительной генетики.

Тема исследования: «Влияние полиморфизма в регуляторных участках ДНК на аффинность связывания регуляторных белков».

Утверждена на заседании Ученого Совета ИОГен РАН 5 ноября 2013 года, протокол № 7.

Промежуточная аттестация за 1-ый год: - аттестован 1 октября 2014 года.

Промежуточная аттестация за 2-ой год - аттестован 1 октября 2015 года.

Публикации:

Yulia A Medvedeva. EpiFactors: a comprehensive database of human epigenetic factors and complexes. / Yulia A Medvedeva, Andreas Lennartsson, Rezvan Ehsani, Ivan VKulakovskiy, Ilya E Vorontsov, Pouda Panahandeh, Grigory Khimulya, Takeya Kasukawa, Finn Drabløs, FANTOM Consortium. // Database -- 2015 -- bav067. doi: 10.1093/database/bav067

I. E. Vorontsov. PERFECTOS-APE - Predicting Regulatory Functional Effect of SNPs by Approximate P-value Estimation. / I. E. Vorontsov, I. V. Kulakovskiy, G. Khimulya, D. D. Nikolaeva

and V. J. Makeev. // Proceedings of the International Conference on Bioinformatics Models, Methods and Algorithms (BIOINFORMATICS-2015) -- 2015 -- pages 102-108. doi:10.5220/0005189301020108

Alistair R. R. Forrest. A promoter-level mammalian expression atlas. / Alistair R. R. Forrest., ..., Ilya E. Vorontsov, ... The FANTOM Consortium. // Nature -- 2014 -- 507, 462–470 (27 March 2014). doi:10.1038/nature13182

I. V. Kulakovskiy. HOCOMOCO: a comprehensive collection of human transcription factor binding sites models. / I. V. Kulakovskiy, Y. A. Medvedeva, U. Schaefer, A. S. Kasianov, I. E. Vorontsov, V. B. Bajic, V. J. Makeev // Nucleic Acids Research -- 2013 -- 41(D1): D195-D202. doi: 10.1093/nar/gks1089