В О П Р О С Ы
промежуточного экзамена (МИДТЕРМ) по дисциплине «Современные методы молекулярной биологии», 1 курс, Phd, специальность «Биотехнология» , русское отделение
1.Центральная догма молекулярной биологии: что такое передача - ДНК → ДНК, ДНК → РНК и РНК → белок: РНК → ДНК и РНК → РНК
2 Современные молекулярные методы: разрезание и сшивание, рестрикционные ферменты
3 Современные молекулярные методы: разрезание и сшивание, ДНК-лигазы. создание новых молекул ДНК
4. Разделение молекул ДНК и белков: электрофорез в геле. Обработка химически выделенной из организма ДНК рестриктазами и выделение смеси фрагментов ДНК, различающиеся по длине.
5. Способы визуализации результатов электрофореза. Первый, наиболее часто используемый в последнее время — добавление в гель веществ, флуоресцирующих в присутствии ДНК (бромистый этидий и изотопы). Сущность метода, недостатки и достоинства
6 Выявление определенной последовательности ДНК в смеси. Саузерн блоттинг. гибридизации ДНК. Как понять, какая из полос содержит фрагмент со строго определенной последовательностью. Гибридизация ДНК.
7 Клонирование ДНК. Репликация в бактериях. Сущность клонирования ДНК. Что такое амплификация, возможности выделения участков ДНК копий и получения его в достаточном для изучения.. Как это можно сделать?
8. Полимеразная цепная реакция (ПЦР). Полимеразная цепная реакция — молекулярно-биологический метод, позволяющий добиться колоссального (до 1012 раз) увеличения числа копий определенного фрагмента ДНК in vitro. На чем основан метод Отличие от репликации ДНК в клетках живых организмов.
9. Естественные клеточные процессы in vitro. Молекулярно-биологические процессы in vitro (то есть, в пробирке). Пример, ПЦР как аналог репликации ДНК; какие условия необходимы для транскрипции, трансляции, обратной транскрипции.
10. In vitro-мутагенез в растениях и в клетках животных и человека
Способы создания полностью неработающего гена. Один из таких способов — вставка какого-то фрагмента ДНК в геном. Способ точного изменения последовательности гена и, соответственно, белка. Про один из таких методов — сайт-специфичный мутагенез. Дайте пояснения
11. Использование и клонированте гена в плазмиде. Проведение ПЦР с одним праймером, включающего в себя последовательность, которую мы хотим изменить. Синтез второй цепи ДНК плазмиды, содержащей праймер, в нее будет внесена мутация, которая заменится на Ц.
12. Секвенирование ДНК. Важнейшие методы манипуляции с ДНК. Определение собственно нуклеотидной последовательности цепи в молекуле. Определение нуклеотидной последовательности ДНК, имеющее крайне важное значение для множества фундаментальных и прикладных задач.
13. Системная РНК-интерференция. РНК-интерференция —открытый феномен подавления экспрессии генов в присутствии определенных коротких фрагментов РНК. Биомолекула описывающая про РНК-интерференцию на примере гена во всех клетках червя. Дайте пояснения
14. Изучение экспрессии генов: ДНК-микрочипы. Что надо знать при изучении функции гена. Число генов тканей. Выделение РНК из ткани, для анализа обратной транскриптазы комплементарной ДНК. Проведение количественного ПЦР анализа.
15. Практическая молекулярная биология и ее достижения. Молекулярная биология - наука объединяющая грани между химией, биологией и физикой. Объекты исследования и синтез белковых структур, передача информации на генетическом уровне. Открытие существования бактериофагов и бактерий, которые является носителями вирусов. Методология молекулярной биологии и ее роль для медицины, промышленности и селского хозяйства.
