В точечной матрице:
А) строки соответствуют остаткам одной последовательности, а колонки остаткам его гомолога;
Б) строки соответствуют остаткам одной последовательности, а колонки остаткам другой;
В) строки и столбцы соответствуют остаткам одной последовательности;
Модуль TestSim, в программе IT Microcosm выдает данные
А) вероятности наличия активности у исследуемого соединения
Б) вероятности наличия и отсутствия активности
В) функции принадлежности к классу активных
Укажите сервис, который не предназначен для поиска доменов
А) InterProScan
Б) CD server
В) PFScan
Г) Все сервисы предназначены для поиска доменов
Д) Только А и В
Метод измерения расстояния между двумя последовательностями по Левенштайну заключается в определении:
А) максимального числа операций редактирования, необходимых для того, чтобы превратить одну строку в другую
Б) количества несовпадающих позиций между двумя последовательностями одинаковой длины
В) минимального числа операций редактирования, необходимых для того, чтобы превратить одну строку в другую
Г) количества совпадающих позиций между двумя последовательностями одинаковой длины
Сведемние вместе сходных предметов различая классы объектов, более сходных с любыми другими – это:
А) Иерархическая кластеризация
Б) Кластеризация
В) Подобие
Укажите способ, при котором невозможно использовать Профили
А) проводить выравнивание для малого объема выборок, с указанием всего набора характеристик данного семейства.
Б) проводить выравнивание дальнеродственных последовательностей
В) определение активного сайта и его функций, по набору остатков высокой степени консервативности
База данных, в которой представлена классификация укладок, основанная на выравнивании структур
А) SCOP Б) CATH В) FSSP Г) DDD
Многоступенчатое группирование классов – это:
А) Иерархическая кластеризация
Б) Кластеризация
В) Подобие
Выберите программу, которая сравнивает нуклеотидные последовательности
А) BLASTP
Б) BLASTX
В) TBLASTN
Вариант 18
Фолдинг белка – это
А) формирование первичной структуры
Б) модификация аминокислотных остатков
В) формирование третичной структуры
Г) транспорт в митохондрии
Выберите аминокислоты, которые относятся к типу гидрофобные остатки
А) Gly, Ala, Ser, Thr
Б) Cys, Val, Ile, Leu, Pro, Phe, Tyr, Met, Trp
В) Asn, Gln, His
Г) Asp, Glu
Д) Lys, Arg
Выберите программу, которая сравнивает аминокислотные последовательности
А) BLASTX
Б) PSI–BLAST
В) TBLASTX
Величина Z-score – это:
А) мера сходства среднего и стандартного отклонения весов полученных выравниваний
Б) мера сходства максимального и стандартного отклонения весов полученных выравниваний
В) мера сходства минимального и стандартного отклонения весов полученных выравниваний
Связный граф – это:
А) абстрактная структура, содержащая вершины и ребра
Б) группа последовательно соединенных ребер
В) структура, содержащая хотя бы один путь между вершинами
Г) структура, содержащая один и только один путь между любыми двумя точками
Как называется методы докинга, при котором докируются фрагменты молекул, которые затем сшиваются; фармакофорный докинг
А) Фрагментные
Б) Решеточные
В) Якорные
Г) С использованием скоринг–функций
Профили – это метод, в котором
А) подбираются данные для последовательностей, аналогичных запрошенной
Б) осуществляется описание тонких различий, существующих между семействами гомологичных последовательностей
В) выделяют наборы признаков, наблюдаемых в однородной выборке многих последовательностей
Водорастворимые белки, общая форма молекулы более или менее сферическая, называются:
А) Глобулярными
Б) Фибриллярными
В) Мембранными
База данных, в которой представлен словарь DALI доменов
А) SCOP
Б) CATH
В) FSSP
Г) DDD
Участки ДНК, распознаваемые регуляторами транскрипции или ферментами рестрикции, имеющие похожие последовательности, которые располагаются, то на одной цепи, то на другой – это
А) Делеции
Б) Повторы
В) Палиндромы
Вариант 19
Что такое edit script?
А) указание серий операций, которые трансформируют последовательность, индексирующую строки, горизонтально расположенную последовательность в последовательность, которая индексирует столбцы, - вертикально расположенную последовательность
Б) указание серий операций, которые трансформируют последовательность, индексирующую столбцы, вертикально расположенную последовательность в последовательность, которая индексирует ряды, - горизонтально расположенную последовательность
В) указание серий операций, которые трансформируют последовательность, индексирующую столбцы, горизонтально расположенную последовательность в последовательность, которая индексирует ряды, - вертикально расположенную последовательность
На какой базе данных основана матрица BLOSUM
А) UniProt
Б) BLOWMatrix
В) BLOCKS
Какое количество стратегий реализовано в программе IT Microcosm
А) 3
Б) 4
В) 5
Выберите аминокислоты, которые относятся к типу гидрофобные остатки
А) Gly, Ala, Ser, Thr
Б) Cys, Val, Ile, Leu, Pro, Phe, Tyr, Met, Trp
В) Asn, Gln, His
Г) Asp, Glu
Д) Lys, Arg
Как называется методы докинга, при котором группа атомов биомишени, попавших в одну ячейку пространственной решетки, заменяются «псевдоатомом»; «аминокислотные атомы» силового поля AMBER
А) Фрагментные
Б) Решеточные
В) Якорные
Г) С использованием скоринг–функций
Профили – это метод, в котором
А) подбираются данные для последовательностей, аналогичных запрошенной
Б) осуществляется описание тонких различий, существующих между семействами гомологичных последовательностей
В) выделяют наборы признаков, наблюдаемых в однородной выборке многих последовательностей
Выберите программу, которая сравнивает аминокислотные последовательности
А) BLASTX
Б) TBLASTX
В) TBLASTN
Попарное выравнивание применяется для:
А) нахождения консервативных участков в наборе гомологичных последовательностей.
Б) нахождения сходных участков
В) нахождения и сопоставления участков, одинаково уложенных в пространстве
Дерево – это:
А) абстрактная структура, содержащая вершины и ребра
Б) группа последовательно соединенных ребер
В) структура, содержащая хотя бы один путь между вершинами
Г) структура, содержащая один и только один путь между любыми двумя точками
Величина P-value – это:
А) вероятность того, что выравнивание не хуже, чем случайное
Б) вероятность того, что выравнивание такое же, как случайное
В) вероятность того, что выравнивание не лучше, чем случайное
Вариант 20
В точечной матрице:
А) строки соответствуют остаткам одной последовательности, а колонки остаткам его гомолога;
Б) строки соответствуют остаткам одной последовательности, а колонки остаткам другой;
В) строки и столбцы соответствуют остаткам одной последовательности;
Белким, части которых выступают в межклеточное окружение и цитоплазму клетки, называются:
А) Глобулярными
Б) Фибриллярными
В) Мембранными
Выберите формулу для определения цены мутации
А)
Б)
В)
Г)
Выберите ортогональную упаковку листов
А) 
Б) 
Программа PASS выдает данные
А) вероятности наличия активности у исследуемого соединения
Б) вероятности наличия и отсутствия активности
В) функции принадлежности к классу активных
Множественное выравнивание применяется для:
А) нахождения консервативных участков в наборе гомологичных последовательностей.
Б) нахождения сходных участков
В) нахождения и сопоставления участков, одинаково уложенных в пространстве
Метод измерения расстояния между двумя последовательностями по Хэммингу заключается в определении:
А) максимального числа операций редактирования, необходимых для того, чтобы превратить одну строку в другую
Б) количества несовпадающих позиций между двумя последовательностями одинаковой длины
В) минимального числа операций редактирования, необходимых для того, чтобы превратить одну строку в другую
Г) количества совпадающих позиций между двумя последовательностями одинаковой длины
Сведемние вместе сходных предметов различая классы объектов, более сходных с любыми другими – это:
А) Иерархическая кластеризация
Б) Кластеризация
В) Подобие
По аминокислотной последовательности белка с неизвестной структурой делаются предсказания какой структуры?
А) вторичной
Б) третичной
В) четвертичной
Выравнивание последовательностей в основном применяется для:
А) аннотирования геномов, а также для определения и функции генов.
Б) установления гомологии для двух и более последовательностей
В) расшифровки нового штамма вируса
Вариант 21
Для чего применяется информация о гидрофобности
А) используя карту гидрофобности, можно составить шкалу изменения гидрофобности вдоль аминокислотной последовательности белка
|
Из за большого объема этот материал размещен на нескольких страницах:
1 2 3 4 5 6 7 |
