А) BLASTX
Б) PSI–BLAST
В) TBLASTX
4. Величина Z-score – это:
А) мера сходства среднего и стандартного отклонения весов полученных выравниваний
Б) мера сходства максимального и стандартного отклонения весов полученных выравниваний
В) мера сходства минимального и стандартного отклонения весов полученных выравниваний
5. Связный граф – это:
А) абстрактная структура, содержащая вершины и ребра
Б) группа последовательно соединенных ребер
В) структура, содержащая хотя бы один путь между вершинами
Г) структура, содержащая один и только один путь между любыми двумя точками
6. Как называется методы докинга, при котором докируются фрагменты молекул, которые затем сшиваются; фармакофорный докинг
А) Фрагментные
Б) Решеточные
В) Якорные
Г) С использованием скоринг–функций
7. Профили – это метод, в котором
А) подбираются данные для последовательностей, аналогичных запрошенной
Б) осуществляется описание тонких различий, существующих между семействами гомологичных последовательностей
В) выделяют наборы признаков, наблюдаемых в однородной выборке многих последовательностей
8. Водорастворимые белки, общая форма молекулы более или менее сферическая, называются:
А) Глобулярными
Б) Фибриллярными
В) Мембранными
9. База данных, в которой представлен словарь DALI доменов
А) SCOP
Б) CATH
В) FSSP
Г) DDD
10. Участки ДНК, распознаваемые регуляторами транскрипции или ферментами рестрикции, имеющие похожие последовательности, которые располагаются, то на одной цепи, то на другой – это
А) Делеции
Б) Повторы
В) Палиндромы
Вариант 19
1. Что такое edit script?
А) указание серий операций, которые трансформируют последовательность, индексирующую строки, горизонтально расположенную последовательность в последовательность, которая индексирует столбцы, - вертикально расположенную последовательность
Б) указание серий операций, которые трансформируют последовательность, индексирующую столбцы, вертикально расположенную последовательность в последовательность, которая индексирует ряды, - горизонтально расположенную последовательность
В) указание серий операций, которые трансформируют последовательность, индексирующую столбцы, горизонтально расположенную последовательность в последовательность, которая индексирует ряды, - вертикально расположенную последовательность
2. На какой базе данных основана матрица BLOSUM
А) UniProt
Б) BLOWMatrix
В) BLOCKS
3. Какое количество стратегий реализовано в программе IT Microcosm
А) 3
Б) 4
В) 5
4. Выберите аминокислоты, которые относятся к типу гидрофобные остатки
А) Gly, Ala, Ser, Thr
Б) Cys, Val, Ile, Leu, Pro, Phe, Tyr, Met, Trp
В) Asn, Gln, His
Г) Asp, Glu
Д) Lys, Arg
5. Как называется методы докинга, при котором группа атомов биомишени, попавших в одну ячейку пространственной решетки, заменяются «псевдоатомом»; «аминокислотные атомы» силового поля AMBER
А) Фрагментные
Б) Решеточные
В) Якорные
Г) С использованием скоринг–функций
6. Профили – это метод, в котором
А) подбираются данные для последовательностей, аналогичных запрошенной
Б) осуществляется описание тонких различий, существующих между семействами гомологичных последовательностей
В) выделяют наборы признаков, наблюдаемых в однородной выборке многих последовательностей
7. Выберите программу, которая сравнивает аминокислотные последовательности
А) BLASTX
Б) TBLASTX
В) TBLASTN
8. Попарное выравнивание применяется для:
А) нахождения консервативных участков в наборе гомологичных последовательностей.
Б) нахождения сходных участков
В) нахождения и сопоставления участков, одинаково уложенных в пространстве
9. Дерево – это:
А) абстрактная структура, содержащая вершины и ребра
Б) группа последовательно соединенных ребер
В) структура, содержащая хотя бы один путь между вершинами
Г) структура, содержащая один и только один путь между любыми двумя точками
10. Величина P-value – это:
А) вероятность того, что выравнивание не хуже, чем случайное
Б) вероятность того, что выравнивание такое же, как случайное
В) вероятность того, что выравнивание не лучше, чем случайное
Вариант 20
1. В точечной матрице:
А) строки соответствуют остаткам одной последовательности, а колонки остаткам его гомолога;
Б) строки соответствуют остаткам одной последовательности, а колонки остаткам другой;
В) строки и столбцы соответствуют остаткам одной последовательности;
2. Белки́, части которых выступают в межклеточное окружение и цитоплазму клетки, называются:
А) Глобулярными
Б) Фибриллярными
В) Мембранными
3. Выберите формулу для определения цены мутации 
А)
Б)
В)
Г)
4. Выберите ортогональную упаковку листов
А) 
Б) 
5. Программа PASS выдает данные
А) вероятности наличия активности у исследуемого соединения
Б) вероятности наличия и отсутствия активности
В) функции принадлежности к классу активных
6. Множественное выравнивание применяется для:
А) нахождения консервативных участков в наборе гомологичных последовательностей.
Б) нахождения сходных участков
В) нахождения и сопоставления участков, одинаково уложенных в пространстве
7. Метод измерения расстояния между двумя последовательностями по Хэммингу заключается в определении:
А) максимального числа операций редактирования, необходимых для того, чтобы превратить одну строку в другую
Б) количества несовпадающих позиций между двумя последовательностями одинаковой длины
В) минимального числа операций редактирования, необходимых для того, чтобы превратить одну строку в другую
Г) количества совпадающих позиций между двумя последовательностями одинаковой длины
8. Сведе́ние вместе сходных предметов различая классы объектов, более сходных с любыми другими – это:
А) Иерархическая кластеризация
Б) Кластеризация
В) Подобие
9. По аминокислотной последовательности белка с неизвестной структурой делаются предсказания какой структуры?
А) вторичной
Б) третичной
В) четвертичной
10. Выравнивание последовательностей в основном применяется для:
А) аннотирования геномов, а также для определения и функции генов.
Б) установления гомологии для двух и более последовательностей
В) расшифровки нового штамма вируса
Вариант 21
1. Для чего применяется информация о гидрофобности
А) используя карту гидрофобности, можно составить шкалу изменения гидрофобности вдоль аминокислотной последовательности белка
Б) используя шкалу гидрофобности, можно составить карту изменения свойств всей аминокислотной последовательности белка
В) используя шкалу гидрофобности, можно составить карту изменения гидрофобности вдоль аминокислотной последовательности белка
2. Выберите программу, которая сравнивает аминокислотные последовательности
А) BLASTX
Б) PSI–BLAST
В) TBLASTX
3. База данных, в которой представлены класс, архитектура, топология и гомология в суперсемействах
А) SCOP
Б) CATH
В) FSSP
Г) DDD
4. Профили – это метод, в котором
А) подбираются данные для последовательностей, аналогичных запрошенной
Б) осуществляется описание тонких различий, существующих между семействами гомологичных последовательностей
В) выделяют наборы признаков, наблюдаемых в однородной выборке многих последовательностей
5. Что используют для предсказания положений экспонированных на поверхности и погруженных в глобулу остатков
А) профиль гидрофобности
Б) сравнение с гомологичной последовательностью
В) анализ аминокислотной последовательности
6. Укажите сервис, который не предназначен для поиска доменов
А) InterProScan
Б) CD server
В) PFScan
Г) Все сервисы предназначены для поиска доменов
Д) Только А и В
7. База данных, в которой представлен словарь DALI доменов
А) SCOP
Б) CATH
В) FSSP
Г) DDD
8. Граф – это:
А) абстрактная структура, содержащая вершины и ребра
Б) группа последовательно соединенных ребер
В) структура, содержащая хотя бы один путь между вершинами
Г) структура, содержащая один и только один путь между любыми двумя точками
9. Измерение сходств и отличий независимо от источника сходства – это:
А) Иерархическая кластеризация
Б) Кластеризация
В) Подобие
10. Попарное выравнивание применяется для:
А) нахождения консервативных участков в наборе гомологичных последовательностей.
Б) нахождения сходных участков
В) нахождения и сопоставления участков, одинаково уложенных в пространстве
Вариант 22
1. Для того, чтобы найти оптимальное выравнивание, необходимо определить критерий
А) критерий оптимизации
Б) качества выравнивания
В) критерий оптимальности
2. Чем больше редакционное расстояние, тем
А) больше разумных эволюционных путей между двумя последовательностями
Б) меньше разумных эволюционных путей между двумя последовательностями
В) количество разумных эволюционных путей между двумя последовательностями не связано с редакционным расстоянием
3. Выберите аминокислоты, которые относятся к типу маленькие неполярные остатки
А) Gly, Ala, Ser, Thr
Б) Cys, Val, Ile, Leu, Pro, Phe, Tyr, Met, Trp
В) Asn, Gln, His
Г) Asp, Glu
Д) Lys, Arg
4. Программа PASS выдает данные
|
Из за большого объема этот материал размещен на нескольких страницах:
1 2 3 4 5 6 7 |
