Основная
1. Белки и пептиды. /Ред. , М.: Наука, 1995 г.
2. , Савин биохимии: Учеб пособие. М.: МГУ, 1990.
3. Кнорре химия. М.: Высшая школа, 2002.
4. -Г. Наглядная биохимия. М.: Мир, 2004.
5. Биохимия: Молекулярные основы структуры и функций клетки: Пер. с англ. М.: Мир, 1974 г., 1976 г.
6. Основы биохимии: В 3-х т. Пер. с англ. М.: Мир, 1985 г.
7. Биохимия: В 3-х т. Пер. с англ. М.: Мир, 1980 г.
8. Современная биохимия в схемах. Пер. с англ. М.: Мир, 1981 г., 1984 г.
9. Нуклеиновые кислоты / Под редакцией Издательство: Бином. Лаборатория знаний, 2013
10. Овчинников химия. М.: Просвещение, 1987 г.
11. Остерман исследования белков и нуклеиновых кислот: электрофорез и ультрацентрифугирование. М.: Наука, 1981. http://*****/books/fold1002/book1701/content. php
12. Остерман белков и нуклеиновых кислот. М.: Наука, 1985.
13. Плакунов энзимологии. М., 2001 г.
14. Практическая химия белка: Пер. с англ. /Под ред. : Мир, 1989 г.
15. Проблемы белка: Химическое строение белка. /, , и др. М.: Наука, 1995 г.
16. Биохимия: В 3 т. М.: Мир, 1984–1985.
17. Филиппович биохимии. М.: Высшая школа, 1985.
18. А, Данченко . Издательство: Медицинская литература, 2010.
19. Биохимия и молекулярная биология. Пер. с англ. М., 1999 г.
20. -Д., Ешкайт X. Аминокислоты, пептиды, белки. М.: Мир, 1985. http://*****/rus/elibrary/jakubke/all. pdf
Дополнительная
1. Протеомика. Лидер науки ХХI века // Знание-сила. 2002. № 2. С. 4-6
2. Электрофорез в разделении биологических макромолекул. М., 1982. – 448 с.
3. , Иванов и пептидомика в фундаментальных и прикладных медицинских исследованиях //Биоорганическая химия. 2011. Т. 37, №2. – С. 199–215.
4. Кретович по истории биохимии в СССР. М.: Наука, 1984.
5. и др., Биохимия человека: Пер. с англ. М.:Мир, 2004.
6. Мутовин генетика. Геномика и протеомика наследственной патологии. – М.: Геотар-Медиа, 2010.
7. Новейшие методы исследования биосистем /Пер. с английского -Борисова. М.: Техносфера, 2005.
8. , , Шайтан протеомика в моделировании живой клетки. Белок-белковые взаимодействия //Успехи биологической химии. 2009. Т.49. С. 429–480.
9. , , Биохимические основы жизнедеятельности человека. М.: Владос, 2000.
10. , , Вахитов ДНК. М.: Наука, 1999.
5.2. Дисциплины по выбору аспиранта
Биохимия белка (ОД. А.04)
№ | Раздел дисциплины (количество часов самостоятельной работы) | Задания по самостоятельной работе аспирантов | Рекомендуемая литература | Форма контроля |
1 | История исследования белков. Эволюция представлений о природе белков (2 часа) | Проработать рекомендов. литературу | [1-5, 10-12] и дополнительная | Конспекты |
2 | Аминокислоты. Методы синтеза аминокислот Пептиды. Методы синтеза пептидов. Природные пептиды (5 часов) | Проработать рекомендов. литературу | [1-5, 8, 10-12] и дополнительная | Конспекты |
3 | Молекулярная масса белков. Форма и заряд белковых молекул. Цвиттер-ионная природа белковой молекулы. Растворимость. Факторы стабилизации белка в растворе. Денатурация и ренатурация белков. Изоэлектрическая и изоионная точки белков (2 часа). | Проработать рекомендов. литературу | [1-5, 10-12] и дополнительная | Конспекты |
4 | Методы выделения белков. Гель-хроматография. Ионообменная, гидрофобная, аффинная хроматография. Иммуносорбция. Определение гомогенности белков. Электрофорез белков. Перспективы использования белковой инженерии для выделения белков (5 часов) | Проработать рекомендов. литературу | [6-8] и дополнительная | Конспекты |
5 | Первичная структура как уровень организации белка. Мотивы в первичной структуре. Вариабельные и консервативные аминокислоты в первичной структуре белка. Гомология белков. Методы определения первичной структуры белков. Методы фрагментации полипептидной цепи. Методы определения N-концевой аминокислоты. Методы определения С-концевой аминокислоты. Химическое модифицирование белков. Принципиальная схема автоматического анализатора аминокислот. Высокоэффективная жидкостная хроматография аминокислот (ВЭЖХ). Масспектрометрический анализ белка и исследование его аминокислотной последовательности (6 часов) | Проработать рекомендов. литературу, лекции | [1-12] и дополнительная | Конспекты |
6 | Вторичная структура белка.. Карта Рамачандрана. Корреляции остаток – тип вторичной структуры. Стабильность вторичной структуры. Методы изучения вторичной структуры белков. Третичная структура белка. Понятие о конформации. Денатурация. Ренатурация. Термостабильные белки. Галофильные белки. Упаковка элементов вторичной структуры в третичную структуру. Мотив и домен. Супервторичные структуры. Предсказание структуры белка. Моделирование структуры белков и путей их сворачивания с помощью построения и анализа структурных деревьев (10 часов). | Проработать рекомендов. литературу, лекции | [1-12] и дополнительная | Конспекты |
7 | Четвертичная структура белка. Стехиометрия и геометрия четвертичной структуры. Гомомерные и гетеромерные белки. Функциональное значение четвертичной структуры белка. Взаимодействие белков с субстратами и кофакторами. Аллостерические эффекты. Способы исследования четвертичной структуры. Методы исследования функционально значимых группировок в молекуле белка (5 часов) | Проработать рекомендов. литературу, лекции | [1-12] и дополнительная | Конспекты |
8 | Разнообразие и классификация белков. Компьютерные базы данных о белках (10 часов). | Проработать рекомендов. литературу, лекции | [1-5, 10-12 | Конспекты |
9 | Биосинтез белка и его основные этапы. Регуляция биосинтеза белка. Нерибосомный синтез белка (5 часов) | Проработать рекомендов. литературу, лекции | [1-5, 10-12] и дополнительная | Конспекты |
10 | Фолдинг. Механизмы формирования пространственной структуры белка. Белковые факторы сворачивания белков. Протеиндисульфидизомераза. Пептидилпролин-цис-транс-изомераза (Циклофилин, FK 506-связывающий белок). Шапероны и шаперонины. Посттрансляционные модификации структуры белка. Пренелирование. Изоферменты (6часов). | Проработать рекомендов. литературу, лекции | [1-5, 10-12] и дополнительная | Конспекты |
11 | Распад белков в клетке. Средняя продолжительность жизни белковых молекул. Протеолитическая деградация белка. Убиквитин зависимая система протеолиза. Протеасома (6 часов). | Проработать рекомендов. литературу, лекции | [1-5, 10-12] и дополнительная | Конспекты |
Всего 62 часа | Зачет |
Рекомендуемая литература
Основная
1. Белки и пептиды. /Ред. , М.: Наука, 1995 г.
2. Кнорре химия. М.: Высшая школа, 2002.
3. -Г. Наглядная биохимия. М.: Мир, 2004.
4. Основы биохимии: В 3-х т. Пер. с англ. М.: Мир, 1985 г.
5. Биохимия: В 3-х т. Пер. с англ. М.: Мир, 1980 г.
6. Остерман исследования белков и нуклеиновых кислот: электрофорез и ультрацентрифугирование. М.: Наука, 1981. http://*****/books/fold1002/book1701/content. php
7. Остерман белков и нуклеиновых кислот. М.: Наука, 1985.
8. Практическая химия белка: Пер. с англ. /Под ред. : Мир, 1989 г.
9. Проблемы белка: Химическое строение белка. /, , и др. М.: Наука, 1995 г.
10. Биохимия: В 3 т. М.: Мир, 1984–1985.
11. А, Данченко . Издательство: Медицинская литература, 2010.
12. -Д., Ешкайт X. Аминокислоты, пептиды, белки. М.: Мир, 1985. http://*****/rus/elibrary/jakubke/all. pdf
Дополнительная
1. Протеомика. Лидер науки ХХI века // Знание-сила. 2002. № 2. С. 4-6
2. Электрофорез в разделении биологических макромолекул. М., 1982. – 448 с.
3. , Иванов и пептидомика в фундаментальных и прикладных медицинских исследованиях //Биоорганическая химия. 2011. Т. 37, №2. – С. 199–215.
4. Кретович по истории биохимии в СССР. М.: Наука, 1984.
5. Макурина белка и ферментов. Часть 1. Химия белка. Самара, 2007 (media. ssu. *****/lectures/biologiya/makurina/makurina. pdf -)
6. Современная биохимия в схемах. Пер. с англ. М.: Мир, 1981 г., 1984 г.
7. Мутовин генетика. Геномика и протеомика наследственной патологии. – М.: Геотар-Медиа, 2010.
8. Мушкабаров биология. М. 2003.
9. Мюльберг, белка : учеб. Пособие. СПб. : Изд-во С.-Петерб. ун-та, 2004.
10. Новейшие методы исследования биосистем /Пер. с английского -Борисова. М.: Техносфера, 2005.
11. , , Шайтан протеомика в моделировании живой клетки. Белок-белковые взаимодействия //Успехи биологической химии. 2009. Т.49. С. 429–480.
Перечень вопросов к зачету
1. Кислотно-основные свойства аминокислот. Химические реакции аминокислот: реакции аминогрупп, карбоксильных групп.
2. Методы синтеза аминокислот (химический, ферментативный).
3. Химические свойства пептидов. Кислотно-основные свойства пептидов.
4. Физико-химические свойства белков.
5. Цвиттер-ионная природа белковой молекулы.
6. Первичная структура как уровень организации белка. Методы определения первичной структуры.
7. Вторичная структура белка. Роль водородных связей в формировании вторичной структуры.
8. Третичная структура белка. Мотивы и домены в белках.
9. Стехиометрия и геометрия четвертичной структуры. Гомомерные и гетеромерные белки.
10. Функциональное значение четвертичной структуры
11. Классификация белков.
12. Особенности структурной организации глобулярных белков.
13. Особенности структурной организации фибриллярных белков.
14. Простые и сложные белки.
15. Выделение белков. Характерные свойства белков, на которых основано их разделение.
16. Методы изучения первичной структуры белка.
17. Методы изучения вторичной структуры белка.
18. Методы изучения пространственной структуры белка.
19. Особенности метода химического модифицирования белков.
20. Методы электрофореза белков
21. Основы хроматографии белков
22. Методы исследовании функционально значимых группировок в молекуле белка.
23. Ферменты. Активный и аллостерический центры.
24. G-белки. Особенности структурной организации, функции.
25. Иммуноглобулины. Молекулярная организация, центр связывания антигенов, многообразие.
26. Белковая наследственность. Прионы.
27. Мембранные белки. Особенности структурной организации, функции.
28. Гистоны. Особенности структурной организации, функции
29. Фолдинг белков и шапероны.
30. Биосинтез белка.
31. ДНК - взаимодействия белков.
32. РНК – взаимодействия белков.
33. Убиквитин зависимая система протеолиза.
34. Протеомика.
Биохимия нуклеиновых кислот (ОД. А.05)
№ | Раздел дисциплины (количество часов самостоятельной работы) | Задания по самостоятельной работе аспирантов | Рекомендуемая литература | Форма контроля |
1 | 2 | 3 | 4 | 5 |
1 | История открытия и исследования нуклеиновых кислот (НК). Биологическая роль НК (2 часа). | Проработать рекомендов. литературу | [1-10] и дополнительная | Конспекты |
2 | Физико-химические свойства НК Денатурация и ренатурация ДНК. Плавление ДНК (2 часа). | Проработать рекомендов. литературу | [1-10] и дополнительная | Конспекты |
3 | Химический состав НК. Пуриновые и пиримидиновые основания. Минорные и аномальные пуриновые и пиримидиновые основания. (Углеводные компоненты. Нуклеозиды и нуклеотиды. Проявление свойств нуклеотидных остатков в составе НК (4 часа). | Проработать рекомендов. литературу | [1-10] и дополнительная | Конспекты |
4 | Уровни организации молекул НК Первичная, вторичная, третичная, четвертичная структура НК (5 часов) | Проработать рекомендов. литературу | [1-10] и дополнительная | Конспекты |
5 | Типы НК: Различия между ДНК и РНК по составу главных и минорных азотистых оснований, углеводов, молекулярной массе, локализации в клетке и функциям (5 часов). | Проработать рекомендов. литературу, лекции | [1-10] и дополнительная | Конспекты |
6 | Виды рРНК (23-28 S, 16-18 S, 5S и 5,8 S) и их функции. Характерные особенности бактериальной мРНК. Свойства мРНК высших организмов: кэпы и поли(А)- фрагменты и их функциональное значение. Предшественники мРНК, процессинг мРНК. Информационная РНК как матрица для специфического биосинтеза белков. Ядерные РНК. Низкомолекулярные ядерные РНК (7 часов). | Проработать рекомендов. литературу, лекции | [1-10] и дополнительная | Конспекты |
7 | Синтез ДНК, субстраты, ферменты, условия синтеза. Обратная транскрипция, биологическая роль обратной транскрипции. Репликация. Ферменты (праймаза, ДНК-полимераза, ДНК-лигаза) и белковые факторы (ДНК - раскручивающие и ДНК- связывающие белки и др.), участвующие в репликации ДНК. Репликосома и праймосома, репликационная вилка. Этапы биосинтеза ДНК. Комплементарный механизм обеспечения специфичности воспроизведения первичной структуры при биосинтезе ДНК. Челночный механизм биосинтеза ДНК, фрагменты Оказаки. РНК- зависимая ДНК - полимераза (обратная транскриптаза). Механизмы регуляции репликации. Репликация кольцевых форм ДНК. (8 часов). | Проработать рекомендов. литературу, лекции | [1-10] и дополнительная | Конспекты |
8 | Транскрипция. Субстраты, ферменты, условия транскрипции. Механизмы регуляции транскрипции. Информосомы как первичные формы существования новообразованных РНК. Кэпирование и полиаденилирование мРНК в процессе ее созревания (8 часов). | Проработать рекомендов. литературу, лекции | [1-10] и дополнительная | Конспекты |
9 | Процессинг нуклеиновых кислот. Характер изменений строения нуклеиновых кислот после их первичного синтеза (5 часов). | Проработать рекомендов. литературу, лекции | [1-10] и дополнительная | Конспекты |
10 | Обмен нуклеиновых кислот. Распад нуклеиновых кислот. Нуклеазы желудочно-кишечного тракта. Распад пуриновых нуклеотидов, образование мочевой кислоты. Синтез пуриновых нуклеотидов. Субстраты синтеза, ключевые ферменты и регуляция синтеза пуриновых нуклеотидов. Распад пиримидиновых нуклеотидов до конечных продуктов. Представления о синтезе нуклеотидов: субстраты и ферменты синтеза. Повторное использование нуклеозидов для синтеза нуклеотидов. Нарушения обмена нуклеотидов (7 часов). | Проработать рекомендов. литературу, лекции | [1-10] и дополнительная | Конспекты |
11 | Механизм действия химических мутагенов на ДНК. Репарация ДНК (2 часа). | Проработать рекомендов. литературу, лекции | [1-10] и дополнительная | Конспекты |
12 | Методы изучения нуклеиновых кислот. Методы установления первичных последовательностей нуклеотидов в нуклеиновых кислотах (секвенирование). Идентификация специфических последовательностей ДНК полимеразной цепной реакцией. Значение для медицины. Клонирование ДНК. Банки данных генов. Генная инженерия. Генотерапия. Понятие о геномике (7 часов). | Проработать рекомендов. литературу, лекции | [1-10] и дополнительная | Конспекты |
Всего 62 часа | Зачет | |||
Рекомендуемая литература
|
Из за большого объема этот материал размещен на нескольких страницах:
1 2 3 4 5 6 |
