Рабочая программа подготовки аспирантов по специальности научных работников 03.01.04 – биохимия (стр. 5 )

Основная

1.  Кнорре химия. М.: Высшая школа, 2002.

2.  -Г. Наглядная биохимия. М.: Мир, 2004.

3.  Основы биохимии: В 3-х т. Пер. с англ. М.: Мир, 1985 г.

4.  Биохимия: В 3-х т. Пер. с англ. М.: Мир, 1980 г.

5.  Нуклеиновые кислоты / Под редакцией Издательство: Бином. Лаборатория знаний, 2013

6.  Остерман исследования белков и нуклеиновых кислот: электрофорез и ультрацентрифугирование. М.: Наука, 1981. http://*****/books/fold1002/book1701/content. php

7.  Остерман белков и нуклеиновых кислот. М.: Наука, 1985.

8.  Биохимия: В 3 т. М.: Мир, 1984–1985.

9.  А, Данченко . Издательство: Медицинская литература, 2010.

10.  Биохимия и молекулярная биология. Пер. с англ. М., 1999 г.

Дополнительная

1.  Электрофорез в разделении биологических макромолекул. М., 1982.

2.  Кретович по истории биохимии в СССР. М.: Наука, 1984.

3.  Мутовин генетика. Геномика и протеомика наследственной патологии. – М.: Геотар-Медиа, 2010.

4.  Новейшие методы исследования биосистем /Пер. с английского -Борисова. М.: Техносфера, 2005.

5.  , , Вахитов ДНК. М.: Наука, 1999.

Перечень вопросов к зачету

1.  История открытия и исследования нуклеиновых кислот (НК).

2.  Физико-химические свойства НК. Денатурация и ренатурация ДНК. Плавление ДНК.

3.  Химический состав НК. Пуриновые и пиримидиновые основания. Минорные и аномальные пуриновые и пиримидиновые основания. Углеводные компоненты. Нуклеозиды и нуклеотиды. Проявление свойств нуклеотидных остатков в составе НК.

4.  Уровни организации молекул НК Первичная, вторичная, третичная, четвертичная структура НК (10 час)

5.  Типы НК: Различия между ДНК и РНК по составу главных и минорных азотистых оснований, углеводов, молекулярной массе, локализации в клетке и функциям.

6.  Виды рРНК (23-28 S, 16-18 S, 5S и 5,8 S) и их функции.

7.  Характерные особенности бактериальной мРНК.

8.  Информационная РНК как матрица для специфического биосинтеза белков.

9.  Ядерные РНК.

10.  Репликация. Механизмы регуляции репликации. Репликация кольцевых форм ДНК.

11.  Транскрипция. Механизмы регуляции транскрипции.

12.  Процессинг нуклеиновых кислот.

13.  Обмен нуклеиновых кислот.

14.  Синтезе нуклеотидов.

15.  Механизм действия химических мутагенов на ДНК.

16.  Репарация ДНК (4 час).

17.  Методы изучения нуклеиновых кислот.

18.  Понятие о геномике.

Энзимология (ОД. А.05)

№	Раздел дисциплины (количество часов самостоятельной работы)	Задания по самостоятельной работе	Рекомендуемая литература	Форма контроля
1	2	3	4	5
1	История развития энзимологии как научной дисциплины. Инженерная энзимология. Иммобилизованные ферменты. Методы иммобилизации. Применение ферментов в научных исследованиях, медицине, промышленности, биомониторинге окружающей среды (2 часа).	Проработать рекомендов. литературу	[1-11] и дополнительная	Конспекты
2	Классификация ферментов. Принципы классификации. Характеристика классов и важнейших групп ферментов. Положения систематической и тривиальной номенклатуры ферментов (2 часа)	Проработать рекомендов. литературу	[1-11] и дополнительная	Конспекты
3	Термодинамическая характеристика ферментативных реакций. Кинетика ферментативных реакций. Работы Анри, Брауна, Михаэлиса-Ментон, Бриггса, Холдейна. Уравнение михаэлиса-Ментон. Субстратная константа и константа Михаэлиса. Максимальная скорость реакции. Число оборотов фермента. Определение кинетических констант. Многостадийность ферментативных реакций. Двухсубстратные ферментативные реакции. Кинетика аллостерических ферментов (10 часов).	Проработать рекомендов. литературу	[1-11] и дополнительная	Конспекты
4	Влияние различных факторов на скорость ферментативной реакции. Влияние температуры, концентрации водородных ионов Ингибиторы ферментов. Классификация ингибиторов. Необратимое и обратимое ингибирование. Типы ингибирования. Константа ингибирования и методы ее определения. Частные случаи ингибирования (торможение субстратом и продуктом реакции) и их возможные механизмы (5 часов).	Проработать рекомендов. литературу	[1-11] и дополнительная	Конспекты
5	Способы количественного выражения активности ферментов. Единицы ферментов. Удельная активность, молекулярная активность, активность каталитического центра. Методы определения активности ферментов. Методы выделения и очистки ферментов. Критерии чистоты ферментных препаратов (5 часов)	Проработать рекомендов. литературу	[1-11] и дополнительная	Конспекты
6	Структурная организация ферментов. Уровни организации: первичный, вторичный, супервторичный, доменный, третичный, четвертичный. Мономерные, олигомерные ферменты. Мультиферментные комплексы, мультиферментные коньюгаты, ферментные ансамбли. Методы исследования различных уровней организации ферментов. Структура активных центров на примере лактатдегидрогеназы, супероксиддисмутазы (СОД), карбоксипептидазы А. (13 часов)	Проработать рекомендов. литературу, лекции	[1-11] и дополнительная	Конспекты
7	Кофакторы. Классификация и биохимические функции. Истинные металлоэнзимы (СОД, карбоксипептидаза А, цитохромоксидаза и др.). Металлоэнзимные комплексы (NAD-зависимая изоцитратдегидрогеназа) (5 часов).	Проработать рекомендов. литературу, лекции	[1-11] и дополнительная	Конспекты
8	Ферментативный катализ. Взаимодействие метаболитов с активными центрами ферментов. Фермент-субстратный комплекс. Факторы эффективности и специфичности ферментативного катализа (эффект сближения, ориентации, напряжения, индуцированного соответствия, кислотно-основного и ковалентного катализа). Методы исследования механизмов ферментативного катализа (изотопный обмен, спектрофотометрический, кинетические методы, ингибиторный анализ). Механизмы действия протеолитических ферментов (лизоцима и карбоксипептидазы А), аминотрансфераз. Абзимы-примитивные ферменты. (10 часов)	Проработать рекомендов. литературу, лекции	[1-11] и дополнительная	Конспекты
9	Принципы регуляции ферментативных процессов. Образование ферментов из неактивных предшественников. Регуляция активности ферментов внутриклеточными сигналами. Изостерическая регуляция (субстратом, продуктом реакции, кофактором). Аллостеричесая регуляция. Ретроингибирование. Химическая модификация ферментов как механизм регуляции активности внешними сигналами. Полифункциональные ферменты. Регуляция активности мультиферментных комплексов (метаболонов) на примере ферментов гликолиза и цикла лимонной кислоты. Регуляция биосинтеза ферментов на генетическом уровне. Репрессия и индукция. Конститутивные и индуцибельные ферменты (15часов).	Проработать рекомендов. литературу, лекции	[1-11] и дополнительная	Конспекты
	Всего 62 часа			Зачет

Рекомендуемая литература

Основная

1.  Белки и пептиды. /Ред. , М.: Наука, 1995 г.

2.  Биссвангер X. Практическая энзимология. М.: БИНОМ, 2010.

3.  Ферменты. 1-3 т. М.: Мир, 1982.

4.  Кнорре химия. М.: Высшая школа, 2002.

5.  Кретович по истории биохимии в СССР. М.: Наука, 1984.

6.  -Г. Наглядная биохимия. М.: Мир, 2004.

7.  Основы биохимии: В 3-х т. Пер. с англ. М.: Мир, 1985 г.

8.  Биохимия: В 3-х т. Пер. с англ. М.: Мир, 1980 г.

9.  Плакунов энзимологии. М., 2001 г.

10.  Биохимия: В 3 т. М.: Мир, 1984–1985.

11.  А, Данченко . Издательство: Медицинская литература, 2010.

Дополнительная

1.  Современная биохимия в схемах. Пер. с англ. М.: Мир, 1981 г., 1984 г.

2.  Новейшие методы исследования биосистем /Пер. с английского -Борисова. М.: Техносфера, 2005.

3.  , , Биохимические основы жизнедеятельности человека. М.: Владос, 2000.

4.  Варфоломеев энзимология. М.: Академия-Центр, 2005.

Перечень вопросов к зачету

1.  История развития энзимологии как научной дисциплины.

2.  Применение ферментов в научных исследованиях, медицине, промышленности, биомониторинге окружающей среды.

3.  Классификация ферментов. Положения систематической и тривиальной номенклатуры ферментов.

4.  Кинетика ферментативных реакций.

5.  Влияние различных факторов на скорость ферментативной реакции.

6.  Ингибиторы ферментов.

7.  Способы количественного выражения активности ферментов.

8.  Методы определения активности ферментов.

9.  Методы выделения и очистки ферментов.

10.  Структурная организация ферментов.

11.  Методы исследования различных уровней организации ферментов.

12.  Ферментативный катализ.

13.  Методы исследования механизмов ферментативного катализа

14.  Механизмы действия протеолитических ферментов (лизоцима и карбоксипептидазы А), аминотрансфераз. Абзимы-примитивные ферменты.

15.  Принципы регуляции ферментативных процессов

16.  Полифункциональные ферменты.

17.  Регуляция активности мультиферментных комплексов (метаболонов) на примере ферментов гликолиза и цикла лимонной кислоты.

18.  Регуляция биосинтеза ферментов на генетическом уровне.

Биохимия животных (ОД. А.07)

№	Раздел дисциплины (количество часов самостоятельной работы)	Задания по самостоятельной работе аспирантов	Рекомендуемая литература	Форма контроля самост. работы
1.	Химический состав нервной ткани. Обмен веществ в нервной ткани. Общая характеристика мышечной ткани. Химический состав скелетных мышц. Обмен веществ в мышечной ткани. (15 часов)	Проработать рекомендов. литературу	[1,2,3,4,5]	Конспекты
2.	Химический состав костной ткани. Процессы минерализации костной ткани. Обмен веществ в костной ткани. Химический состав соединительной ткани. Обмен веществ в соединительной ткани. Биохимические изменения соединительной ткани при патологии. (15 часов)	Проработать рекомендов. литературу	[4,5,6,]	Конспекты
3.	Физико-химические свойства крови. Химический состав крови. Дыхательная функция крови. Природа основных факторов свертывания крови. Лимфа и ее свойства. Химический состав тканей печени. Обмен веществ в тканях печени. Выделительная функция печени и состав желчи. Обезвреживающая функция печени. Изучение функционального состояния печени (17 часов).	Проработать рекомендов. литературу	[6,7,8,9]	Конспекты
4.	Химический состав почек. Обмен веществ в почках. Химизм образования мочи. Общая характеристика мочи (15 часов).	Проработать рекомендов. литературу	[6,7,8,9]	Конспекты
Всего 62 часа			Зачет

Рекомендуемая литература

1.  Биохимия: В 3 т. М.: Мир, 1984–1985.

2.  Филиппович биохимии. М.: Высшая школа, 1985.

3.  , Савин биохимии. М.: МГУ, 1990.

4.  Биохимия животных / , , и др. M.: Высшая школа, 1982.

5.  Бохински P. Современные воззрения в биохимии. M.: Мир, 1987.

6.  Васильева E. А. Клиническая биохимия сельскохозяйственных животных. M.: Россельхозиздат, 1982.

7.  Вишняков обмен в организме животных. M.: Агропромиздат, 1988.

8.  Герасименко продуктивности и резистентности животных. К.: Вища школа, 1987.

9.  Основы биохимии патологических процессов. M.: Медицина, 1985.

Перечень вопросов к зачету

10.  Химический состав нервной ткани.

11.  Обмен веществ в нервной ткани.

12.  Общую характеристику биохимических процессов в мышечной ткани.

13.  Химический состав скелетных мышц.

14.  Обмен веществ в мышечной ткани.

15.  Химический состав костной ткани.

16.  Процессы минерализации костной ткани.

17.  Обмен веществ в костной ткани.

18.  Химический состав соединительной ткани.

19.  Обмен веществ в соединительной ткани.

20.  Биохимические изменения соединительной ткани при патологии.

21.  Физико-химические свойства крови.

22.  Химический состав крови.

23.  Дыхательная функция крови.

24.  Природа основных факторов свертывания крови.

25.  Лимфа и ее свойства.

26.  Химический состав тканей печени.

27.  Обмен веществ в тканях печени.

28.  Выделительная функция печени и состав желчи.

29.  Обезвреживающая функция печени.

30.  Химический состав почек.

31.  Обмен веществ в почках.

32.  Химизм образования мочи. Общая характеристика мочи.

5.3.  Факультативные дисциплины

(7 кредитов, 252 часа)

Протеомика (ФД. А.01)

№	Раздел дисциплины (количество часов самостоятельной работы)	Задания по самостоятельной работе аспирантов	Рекомендуемая литература	Форма контроля
1	Протеомика как постгеномная технология. Роль протеомики в развитии современной биологии (2 час).	Проработать рекомендов. литературу	[1-13]	Конспекты
2	Функциональная и структурная протеомика (20 час)	Проработать рекомендов. литературу	[1-13]	Конспекты
3	Принципы и методы анализа протеома Базы данных по протеомике (20 час).	Проработать рекомендов. литературу	[1-13]	Конспекты
4	Механизмы формирования пространственных структур биологических макромолекул. Самоорганизация макромолекулярных комплексов (10 час).	Проработать рекомендов. литературу	[1-13]	Конспекты
5	Методы предсказания пространственных структур и функций белков. Методы моделирования взаимодействий между макромолекулярными комплексами (12 час).	Проработать рекомендов. литературу, лекции	[1-13]	Конспекты
6	Протеомика в медицине и биотехнологии. Поиск белковых маркеров для диагностики и терапии социально-значимых заболеваний (4 час).	Проработать рекомендов. литературу, лекции	[1-13]	Конспекты
	Всего 68 час.			Зачет

Рекомендуемая литература