Микробные биотехнологии (стр. 1 )

1.  Название лаборатории: Микробные биотехнологии

2.  Девиз: Эффлюкс и Хромосома

3.  Руководитель лаборатории (ФИО, эл почта, телефон): , *****@***com 8-917-891-6189

4.  Научный консультант/координатор/отв. исполнитель (ФИО, эл почта, телефон): , *****@***ru, 89503124054

5.  Штатное расписание лаборатории (по «головам», с учетом совместительства):

Ставка	ШДС 2015 вну/вне/осн	ШДС 2016 вну/вне/осн
М. н.с.	0/0/8	0/0/8
Н. с.	0/0/0	0/0/1
С. н.с.	1/1/2	4/1/1
В. н.с.	0/2/0	1/2/0
Г. н.с.	0/0/0	1/0/0
ППС	0/0/0	0/0/0
УВП	0/0/0	0/0/1

6.  Цель реализации Проекта, решаемые задачи, связь с основными приоритетными международными направлениями фундаментальных и прикладных исследований (пункт из ТЗ проекта – Приложение 2 к приказу о создании-финансирования проекта):

Цель Проекта - организация виртуальной лаборатории OpenLab Микробные биотехнологии в медицине и растениеводстве (далее – Лаборатория) и обеспечение эффективности проведения научных исследований на начальном этапе ее деятельности.

Проект направлен на обеспечение проведения исследований мирового уровня по приоритетным направлениям Программы повышения конкурентоспособности КФУ «Биомедицина и фармацевтика».

Областью фундаментальных исследований в рамках указанных направлений ППК является разработка новых подходов к пониманию молекулярных механизмов и генетических факторов, ответственных за развитие антибиотикоустойчивости у бактерий, в частности вклад эффлюкс систем в этот процесс, а также к идентификации генов, ответственных за установление внутривидовой вариации в длине теломер, разработка эффективной технологии получения трансгенных растений для улучшения роста и урожайности сельскохозяйственных растений, и изучение метаболизма растений.

Решаемые в ходе выполнения Проекта задачи включают:

6.1. Подготовка и утверждение Положения о лаборатории, конкурсной документации на избрание руководителя Проекта;

6.2. Проведение переговоров с инопартнером, согласование планов НИР;

6.3. Организация и проведение закупок научного оборудования, химических и биологических реактивов и расходуемых материалов;

6.4. Проведение рекрутинга и заключение трудовых договоров для работы в Лаборатории ведущих приглашенных ученых и молодых ученых;

6.5. Подготовка молодых ученых для последующей работы в штате Проекта в качестве пост-докторантов, соискателей, аспирантов и магистрантов;

6.6. Привлечение финансовых ресурсов по тематике проведения исследований в области биологии теломер и механизма старения клеток, антибиотикоустойчивости бактерий и микробного патогенеза, биотехнологии растений.

7.  Основные требования к реализации Проекта (пункт из ТЗ проекта – Приложение 2 к приказу о создании-финансирования проекта):

7.1. Реализация Проекта должна соответствовать мерам по реализации научно-исследовательских проектов с привлечением к руководству ведущих иностранных и российских ученых, в соответствии с Уставом КФУ, в соответствии с Программой фундаментальных исследований в Российской Федерации, приказом ректора КФУ от 01.01.2001 г. №01-06/88 «О создании виртуальных OpenLab» решением ЭК и Дирекции ППК КФУ (протокол №___ от г.),

7.2. Проект должен обеспечить функционирование Лаборатории путем проведения переговоров и организации конкурса на должность руководителя, оснащения помещений в лабораторном корпусе по адресу ул. Парижской Коммуны д.9, подготовки молодых ученых для работы в составе Лаборатории и привлечения финансирования в виде грантов и хоздоговоров на исполнение НИР по тематике Лаборатории.

7.3. Проект должен обеспечить согласование и утверждение дирекцией ППК программы исследований мирового уровня по тематике Проекта и привлечение финансовых средств на выполнение НИР от внешних источников.

7.4. Функционирование Лаборатории должно обеспечивать выполнение показателей KPI, приведенных в п.5. Техзадания.

8.  Основные характеристики выполняемых работ (пункт из ТЗ проекта – Приложение 2 к приказу о создании-финансирования проекта):

8.1. Руководитель Проекта выполняет свои функции до организации и проведения конкурса на замещение вакантной должности руководителя лаборатории Микробные технологии.

8.2. Научный консультант Проекта назначается из числа сотрудников КФУ для обеспечения взаимодействия между Лабораторией и основным подразделением КФУ (Институт фундаментальной медицины и биологии).

8.3. Закупки оборудования осуществляются после подписания предварительного договора о намерениях с кандидатом на должность руководителя Лаборатории по согласованному с дирекцией ППК КФУ списку в рамках установленного сметой лимита средств.

8.4. Выполнение проекта проводится в кооперации с Техасским университетом A&M (США) и университетом Техаса в Остине (США).

8.5. Проект обеспечивает выполнение показателей в 2014 году путем проведения исследований в рамках тематики Проекта молодыми учеными, аспирантами, магистрами, студентами, проходящими стажировку в Техасском университете A&M (США) и университете Техаса в Остине (США).

9.  Действующие проекты 2016 года:

Название проекта	Источник финансирования (Девиз)	Размер финанс., руб	Кол-во статей 2016 (WoS)	Суммарный импакт фактор или SNIP
"Эффлюкс система МасАВ и ее роль в физиологии грамотрицательных бактерий" н/р	РНФ 16-14-10200	6 000 000	1 WoS
"Гетерологичная экспрессия микробных фитаз в Arabidopsis thaliana для улучшения роста растений на фитат-обогащенных почвах" н/р	РФФИ-а №16-08-00583	480 000	1 WoS
"Секретируемые сидерофоры Seratia marcescens и их роль в защите клеток от оксидативного стресса" н/р	РФФИ-а №15-04-02110	500 000	1 WoS
"Анализ естественной вариации популяций Arabidopsis thaliana по способности к росту на различных почвенных источниках фосфора" н/р	РФФИ-а №15-04-01645	360 000	1 WoS
"Роль бактериальных сидерофоров в процессах биоминерализации и электрогенезиса" н/р	РФФИ № 16-34-60200	1 700 000	1 WoS
"Сравнительный протеогеномный анализ штаммов Bacillus pumilus - продуцентов внеклеточных протеиназ и их мутантов" н/р	РФФИ-мол-а-дк №16-34-60198	1 700 000	1 Wos
«Разработка эффективных систем экспрессии фитаз для специфического получения мио-инозитол фосфатов» н/р	РФФИ-мол-а-дк № 16-34-60191	1 700 000	1 WoS
"Вклад в секретом и особенности экспрессии гена минорной метцинкиновой эндопептидазы бацилл" н/р	РФФИ-мол-а №16-34-01150	450 000	1 WoS
Итого		12,890,000	8 WoS

10.  Краткое описание действующих проектов 2016 года (информация может быть скопирована из грантовой заявки)

10.1.  Наименование проекта 1: РНФ "Эффлюкс система МасАВ и ее роль в физиологии грамотрицательных бактерий"

Руководитель/ответственный исполнитель проекта: /

Краткая аннотация (0,5 страницы):

Развитие множественной антибиотикоустойчивости у бактерий является одной из самых актуальных проблем здравоохранения во всем мире. Лечение таких инфекций затруднено ввиду отсутствия эффективных антимикробных препаратов, что приводит к более тяжелому течению заболеваний, развитию осложнений на фоне первичной инфекции, увеличению количества госпитализаций, увеличению экономических затрат на лечение пациентов. Особую озабоченность вызывает тот факт, что бактериальная устойчивость к существующим антибактериальным препаратам продолжает возрастать на фоне замедления темпов разработки и внедрения новых антибиотиков. Несмотря на значительный прогресс в понимании механизмов, приводящих к формированию антибиотикоустойчивости, наши знания о фундаментальных основах этого процесса сильно ограничены. В частности, известно, что эффлюкс системы бактерий (мембранные комплексы белков, осуществляющих активный выброс антибиотиков за пределы бактериальных клеток) играют важную роль в защите микроорганизмов от антибиотиков, что делает их привлекательной мишенью для разработки новых антимикробных препаратов. В данном проекте мы предлагаем провести детальное изучение молекулярного механизма действия эффлюкс системы МасАВ на примере S. marcescens. Для решения данной цели мы предлагаем:

1. Идентифицировать естественный субстрат эффлюкс системы MacAB и изучить его роль в защите бактерий от токсичного действия активных форм кислорода (АФК).

2. Определить и охарактеризовать белки-партнеры эффлюкс системы MacAB. Во второй части проекта мы воспользуемся методами молекулярной биологии и биохимии для идентификации белков-партнеров эффлюкс системы МасАВ в условиях оксидативного стресса.