Вариант 3 для специальности 050102 Биология ЗФО
1.6.2 Содержание разделов дисциплины.
1.6.3 Темы для самостоятельного изучения.
№ п/п | Наименование раздела дисциплины. Тема. | Форма самостоятельной работы | Кол-во часов | Форма контроля выполнения самостоятельной работы | |
1 | 2 | ||||
1. 2. 3. 4. 5. 6. | Методы молекулярной биологии. Генетический код. Структура рибосом Репликация, рекомбинация Транскрипция, трансляция Вирусы, плазмиды, транспозоны Итого: | вопросы для самостоятельного изучения контрольная работа контрольная работа решение задач решение задач решение задач | 20 10 8 4 4 4 50 | 10 6 5 4 4 4 33 | коллоквиум проверка контр. работ проверка контр. работ проверка тетрадей проверка тетрадей проверка тетрадей |
Примечание:
Вариант 1 для специальности 050102 Биология
Вариант 2 для специальности 050102.00 Биология с дополнительной специальностью география
1.7 Методические рекомендации по организации изучения дисциплины.
1.7.1 План последовательного проведения лабораторных занятий.
Лабораторная работа № 1. Идентификация патогенных бактерий с использованием полимеразной цепной реакции (виртуальная лаборатория).
План работы:
Выделение тотальной бактериальной ДНК из образцов проб крови пациентов. Амплификация фрагментов ДНК, кодирующих 16S рРНК. Секвенирование фрагментов ДНК. Анализ полученных последовательностей ДНК и идентификация бактерий.Вопросы для коллективного обсуждения:
Как осуществляется полимеразная цепная реакция? Для чего ее используют? Как отделить фрагменты ДНК, необходимые для данного анализа, от других фрагментов ДНК? Как работает ДНК-секвенсор?Лабораторная работа № 2. Синтез РНК и белка.
План работы: решение задач по теме.
Вопросы для коллективного обсуждения:
Отличительные особенности транскрипции у прокариот и эукариот. Регуляция транскрипции. Свойства генетического кода. Этапы синтеза белка в клетке. Регуляция трансляции у прокариот и эукариот.Лабораторная работа № 3. Репликация. Механизмы репарации.
План работы: решение задач по теме.
Вопросы для коллективного обсуждения:
Белки и ферменты, участвующие в репликации ДНК. Принципы репликации. Обратная транскрипция. Типы репарации ДНК.Лабораторная работа № 4. Механизмы генетической рекомбинации.
План работы: решение задач по теме.
Вопросы для коллективного обсуждения:
Типы генетической рекомбинации. Молекулярный механизм гомологической рекомбинации. Сайт-специфическая рекомбинация. Конверсия генов.Лабораторная работа № 5. Вирусы, плазмиды и транспозоны.
План работы: решение задач по теме.
Вопросы для коллективного обсуждения:
Типы генетического материала и механизм его репликации у разных вирусов. Типы взаимодействия вируса с клеткой-хозяином. Бактериальные плазмиды и эписомы. Подвижные генетические элементы бактерий и эукариот.1.8 Учебно-методическое обеспечение дисциплины.
1.8.1 Рекомендуемая литература:
Основная:
Коничев биология : учебник для студ. вузов, обуч. по спец. 032400 "Биология" / , - 2-е изд., испр. - М. : Академия, 2005. - 400 с. Плотникова биоорганические соединения, рассматриваемые в курсе биохимии и молекулярной биологии : учебно-метод. пособие : в 2 ч. / ; М-во образования РФ, МГПИ. - Мурманск, 2001. - 25 с. Современное естествознание : энциклопедия : в 10 т. : Т.8 : Молекулярные основы биологических процессов / Междунар. Соросовская Программа Образования в Области Точных Наук ; гл. ред. энцикл. ; ред. тома . - М. : Изд. Дом "МАГИСТР-ПРЕСС", 2000. - 408 с.Дополнительная:
Литература к практикуму:
, , Севастьянова по общей биохимии. — М.: Просвещение, 1982. Методы анализа белков и нуклеиновых кислот в тканях и органах насекомых: Методические разработки / Под ред. , . - Ч. 1. - М.: МГПИ им. , 1980. Практикум по биохимии / Под ред. , . — М.: Изд-во МГУ, 1989.1.9 Материально-техническое обеспечение дисциплины
1.9.1 Перечень используемых технических средств: компьютер, графопроектор.
1.9.2 Перечень используемых пособий: презентации, прозрачные пленки со схемами и рисунками.
1.9.3 Перечень видео - и аудиоматериалов программного обеспечения: CD “Holiday Lectures on Science CD-ROM” (Virtual Bacterial ID Lab).
1.10 Примерные зачетные тестовые задания.
Вариант 1
1. Произошла мутация в кодирующей последовательности
5'- CAG ААТ АСС TGA TTG ATA GCA -3'-
Мутантная последовательность имеет вид:
5'- CAG AAT ACT GAT TGA TAG CA -3'
Определите характер мутации:
А) делеция
Б) нонсенс
В) сдвиг рамки считывания
2. Нормальная аллель гена содержит 2 сайта узнавания для рестриктазы R, расстояние между которыми составляет 4 кб. Мутантная аллель возникла в результате замены пары оснований, приведшей к появлению дополнительного сайта рестрикции.
Определите генотип пациента по приведенному результату рестрикционного анализа:
| 4 кб |
2.5кб | |
1.5кб |
А) нормальная гомозигота
Б) мутантная гомозигота
В) гетерозигота
3. Для работы ДНК-полимеразы необходимо наличие:
A) однонитевой матричной ДНК
Б) инициируещего кодона
B) двунитевого участка на 3' конце молекулы
Г) четырех типов дезокситрифосфатов
Д) транспортных РНК
4. Идентификация в геномной ДНК участков, комплементарных ДНК-зонду, может осуществляться методом:
A) Нозерн блот-гибридизации
Б) Вестерн блот-гибридизации
B) блот-гибридизации по Саузерну
Г) гибридизации in situ на хромосомных препаратах
Д) гибридизации in situ на гистологических препаратах
1.11 Примерный перечень вопросов к зачету, экзамену.
1. Предмет и задачи молекулярной биологии. Предпосылки ее возникновения, основные открытия. Перспективы развития молекулярной биологии.
2. Физические, биохимические и биологические методы исследования в молекулярной биологии.
3. Первичная структура ДНК. Межнуклеотидная связь. Нуклеазы рестрикции. Физическое картирование ДНК. Секвенирование ДНК.
4. Вторичная структура ДНК. аргаффа. Модель ДНК Дж. Уотсона и Ф. Крика. Полиморфизм двойной спирали ДНК. Сверхспирализация ДНК.
5. Третичная структура ДНК вирусов и бактерий. Уровни организации хроматина в эукариотических клетках.
6. Доказательства генетической роли ДНК. Полуконсервативный механизм репликации ДНК (работы М. Мезельсона и Сталя).
7. Репликация ДНК. Ферменты репликации. Точность синтеза ДНК и коррекция. Основные принципы репликации.
8. Особенности репликации у прокариот и эукариот. Топологические проблемы репликации. Регуляция репликации.
9. Репарация ДНК и ее виды: прямая реактивация, темновая репарация, эксцизионная репарация. SOS-репарация. Репарация неспаренных нуклеотидов.
10. Молекулярные механизмы гомологичной рекомбинации. Генная конверсия. Сайт-специфическая рекомбинация.
11. Транскрипция у прокариот. Структура РНК-полимеразы. Цикл транскрипции. Понятие об опероне. Регуляция транскрипции у прокариот.
12. Особенности транскрипции у эукариот. Факторы транскрипции. Энхансеры и сайленсеры. Механизмы активации белков-регуляторов транскрипции. Значение гормонов в регуляции транскрипции.
13. Подвижные генетические элементы прокариот и эукариот, механизмы их перемещения и роль в эволюции.
14. Денатурация и ренатурация ДНК. Метод реассоциации в изучении генома эукариот. Сателлитная ДНК. Умеренные повторы и уникальные последовательности генома. Мозаичность строения эукариотических генов.
15. Репликация и транскрипция вирусных геномов.
16. Процессинг первичных транскриптов у прокариот и эукариот. Регуляция экспрессии генов путем альтернативного сплайсинга. Транс-сплайсинг.
16. Процессинг иРНК у прокариот и эукариот. Механизм сплайсинга и его виды. Регуляция экспрессии генов путем альтернативного сплайсинга. Транс-сплайсинг. Редактирование РНК.
17. Процессинг рРНК и тРНК у прокариот и эукариот. Аутосплайсинг. Природные и синтетические рибозимы (нуклеозимы, минизимы) и перспективы их использования.
17. Обратная транскрипция. Роль обратной транскрипции в эволюции и изменчивости генома. Ретротранспозоны, их типы. Псевдогены.
18. Аминокислотный состав белков. Пептиды. Первичная структура белков. Структурные особенности пептидной связи. Методы определения первичной структуры белка.
|
Из за большого объема этот материал размещен на нескольких страницах:
1 2 3 4 5 6 7 8 |
