РНКтранскрипт (первичный) — молекулы РНК, образующиеся в процессе транскрипции.
Сплайсинг—процесс вырезания последовательностей, комплементарных интронам, из молекулы первичного РНК-транскрипта.
Сплайсосома, сплайсеосома, сплайсинговый комплекс - многокомпонентный комплекс факторов сплайсинга (SF) и малых ядерных РНК (мяРНК), катализирующих сплайсинг ядерных предшественников РНК (про-РНК), в результате чего образуется зрелая иРНК у эукариот.
Транс-сплайсинг – явление, при котором происходит образование ковалентных связей между фрагментами РНК, синтезированными на разных генах.
Лекция № 14, 15. Разнообразие структур и функций белков.
Абзимы - моноклональные антитела, обладающие каталитической активностью. Абзимы связываются и стабилизируют молекулы промежуточных реакций в процессе образования конечного продукта.
Аминокислоты - органические кислоты, содержащие одну или несколько аминогрупп.
Белки – природные полипептиды с молекулярной массой более 6 кДа.
Белки теплового шока - специфические белки, известные у большинства организмов, вырабатываются в ответ на тепловой шок, когда биосинтез многих других белков подавлен. Индукция синтеза белков теплового шока может происходить и под действием некоторых химических агентов (этиловый спирт, экдистерон, хлорид кадмия и др.), в связи с чем их иногда называют стрессовыми белками. Они высоконсервативны у различных организмов – наиболее распространены белки теплового шока размером около 70 кД (семейство hsp-70).
Вторичная структура белка - укладка полипептидной цепи в альфа-спиральные участки и бета-структурные образования (слои); в образовании вторичной структуры белка участвуют водородные связи.
Домен - участок полипептидной цепи белка, выполняющий какую-либо его функцию (например, цитоплазматический домен, трансмембранный домен и т. п.). По мнению некоторых генетиков, каждый домен кодируется участком гена, расположенным между соседними интронами (т. е. одним экзоном), что обусловливает эволюционный консерватизм положения интронов (например, в генах альфа - и бета-гемоглобина млекопитающих).
Пептиды - природные или синтетические соединения, молекулы которыхрых построены из остатков б-аминокислот, соединенных между собой пептидными (амидными) связями C(O)NH. По числу аминокислотных остатков, входящих в молекулы пептидов, различают дипептиды, трипептиды, тетрапептиды и т. д. Пептиды, содержащие до 10 аминокислотных остатков, называются олигопептидами, содержащие более 10 аминокислотных остатков – полипептидами.
Первичная структура белка – порядок чередования аминокислотных остатков в полипептидной цепи белка.
Приомны — особый класс инфекционных агентов, чисто белковых, не содержащих нуклеиновых кислот, вызывающих тяжёлые заболевания центральной нервной системы у человека и ряда высших животных (т. н. «медленные инфекции»).
Прионизация – процесс превращения нормального клеточного белка в прионный, сопровождаемый многократным увеличением доли в-структур.
Третичная структура белка - высшая пространственная структура, образующаяся в результате фолдинга отдельной полипептидной цепи.
Радикалы – боковые цепи аминокислот, не участвующие в образовании пептидных связей.
Фолдинг - процесс сворачивания полипептидной цепи в правильную пространственную структуру. В результате на внешней поверхности белковой глобулы формируются полости активных центров, а также места контактов субъединиц мультимерных белков друг с другом и с биологическими мембранами.
Четвертичная структура белка - свойственная только полимерным белкам форма пространственной организации, обусловленная различными вариантами взаиморасположения и взаимодействия отдельных полипептидных цепей.
Шапероны – специфические белки, обеспечивающие формирование третичной структуры полипептидных цепей других белков.
Лекция № 16. Генетический код.
Антикодон - группа из трех оснований, занимающая фиксированное положение в транспортной РНК, которая комплементарна кодону в информационной (матричной) РНК.
Генетический код - система записи наследственной информации в молекулах нуклеиновых кислот, основанная на определении чередований последовательностей нуклеотидов в ДНК или РНК, образующих кодоны соответствующих аминокислот белков. Каждый кодон кодирует одну молекулу аминокислоты.
Кодон — последовательность из трех нуклеотидов в молекуле мРНК, соответствующая аминокислоте или сигналу терминации трансляции.
Стартовый кодон, сайт инициации трансляции - тринуклеотид (у прокариот - AUG, GUG; у эукариот - AUG) в информационной РНК, инициирующий синтез полипептидов. Стартовый кодон кодирует N-формилметионин у бактерий и метионин у эукариот.
Стоп-кодон, нонсенс-кодон, терминатор - тринуклеотид в информационной РНК, сигнализирующий об окончании синтеза полипептида и освобождении полной полипептидной цепи от рибосомы. Существует три различных типа стоп-кодонов: UAG (амбер), UGA (опал) и UAA (охра). Ни один из них не соответствует антикодону тРНК.
Лекция № 17. Рибосомы и их роль в биосинтезе белка.
Аминоацильный центр рибосомы – участок 50S субчастицы рибосомы, к которому присоединяется несущая аминокислоту (аминоацил-тРНК) тРНК, если антикодон этой тРНК соответствует кодону иРНК, находящемуся в данный момент в аминоацильном центре.
Пептидильный центр рибосомы – участок рибосомы, к которому присоединяется пептидил-тРНК в процессе транялсции.
Пептидилтрансферазный центр рибосомы – участок 50S субчастицы рибосомы, в котором идет синтез пептидной связи.
Полирибосома, полисома - молекула РНК с несколькими расположенными на ней активными рибосомами, на каждой из которых синтезируется молекула белка.
Рибосома - органелла клетки, рибонуклеопротеидная частица, с участием которой осуществляется биосинтез белка (трансляция). Рибосома состоит из двух (большой и малой) субчастиц, для взаимодействия которых необходимы ионы магния.
Лекция № 18, 19. Биосинтез белка.
Аминоацилирование тРНК – присоединение аминокислоты к 3’-концу тРНК, катализируемое АРСазой. Происходит за счет энергии АТФ.
Аминоацил-тРНК-синтетазы, АРСазы - специфические ферменты, катализирующие активирование аминокислот и связывание последних с определенными тРНК.
Изоакцепторные тРНК - различные виды тРНК, специфичные к одной и той же аминокислоте, которые в ряде случаев узнают различные кодоны.
Рамка считывания — нуклеотидная последовательность, выраженная в кодирующих триплетах, начинающаяся со стартового кодона и заканчивающаяся нонсенс-кодоном.
Реакция транспептидирования – синтез пептидной связи с участием аминоацил-тРНК.
Трансляция — синтез полипептидной цепи по молекуле мРНК.
Шайн-Далгарно последовательность — участок прокариотической мРНК, необходимый для посадки на неё рибосом и её правильной трансляции. Содержит последовательность нуклеотидов, комплементарную 3’-концу 16S рибосомной РНК.
Лекция № 20. Межмолекулярные взаимодействия.
Онкогены — гены, чьи продукты обладают способностью трансформировать эукариотические клетки так, что они приобретают свойства опухолевых клеток.
Протоонкогены — нормальные хромосомные гены, мутации которых могут привести к злокачественному перерождению клетки.
РАЗДЕЛ 5. Практикум по решению задач (практических ситуаций) по темам лекций (одна из составляющих частей итоговой государственной аттестации).
- Примеры решения задач (практических ситуаций) по темам, на которые предложены аналогичные задания в экзаменационных (зачетных) билетах.
Характер решения задач по молекулярной генетике можно рассмотреть на следующем примере.
Задача 1. Приведите графическую модель гена, если белковая молекула имеет следующий состав и последовательность аминокислот: глицин-лизин-пролин-серин.
Запишем возможную последовательность нуклеотидов соответствующего участка и-РНК в соответствии с генетическим кодом, приведенным в таблице 1. Белок: глицин—лизин—пролин—серин (для серина использовали только 4 триплета)
ГГУ | ААА | ЦЦУ | УЦУ | ||||
и-РНК | ГГЦ | ААГ | ЦЦЦ | УЦЦ | |||
ГГА | ЦЦА | УЦА | |||||
ГГГ | ЦЦГ | УЦГ | |||||
4 | Ч | 2 | Ч | 4 | Ч | 4 | =128 |
Как видно, участок белка с этой последовательностью аминокислот мог образоваться в процессе трансляции у 128 вариантов и-РНК.
И-РНК переписывает информацию о структуре белка в процессе транскрипции с гена. Определенное разнообразие возможных и-РНК (128) могло образоваться на основе такого же разнообразия генов.
Следовательно, графически можно изобразить 128 вариантов гена, содержащих информацию о данной молекуле белка.
Один из вариантов следующий (по первой строке триплетов):
___________________________
Ген ДНК ЦЦА ТТТ ГТА АГА
и-РНК ГГУ ААА ЦЦУ УЦУ
Таблица 1 Последовательность нуклеотидов в кодонах и-РНК для разных аминокислот
Аминокислоты | Кодоны | |||||
1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | |
Фенилаланин (фен) | УУУ | УУЦ | ||||
Лейцин (лей) | УУА | УУГ | ЦУУ | ЦУЦ | ЦУА | ЦУГ |
Изолейцин (илей) | АУУ | АУЦ | АУА | |||
Метионин (мет) старт | АУГ | |||||
Валин (вал) | ГУУ | ГУЦ | ГУА | ГУГ | ||
Серин (сер) | УЦУ | УЦЦ | УЦА | УЦГ | АГУ | АГЦ |
Пролин (про) | ЦЦУ | ЦЦЦ | ЦЦА | ЦЦГ | ||
Треонин (тре) | АЦУ | АЦЦ | АЦА | АЦГ | ||
Алании (ала) | ГЦУ | ГЦЦ | ГЦА | ГЦГ | ||
Тирозин (тир) | УАУ | УАЦ | ||||
Гистидин (гис) | ЦАУ | ЦАЦ | ||||
Глутамин (глн) | ЦАА | ЦАГ | ||||
Аспарагин (асн) | ААУ | ААЦ | ||||
Аспарагиновая кислота (асп) | ГАУ | ГАЦ | ||||
Лизин (лиз) | ААА | ААГ | ||||
Глутаминовая кислота (глу) | ГАА | ГАГ | ||||
Цистеин (цис) | УГУ | УГЦ | ||||
Триптофан (трип) | УГГ | |||||
Аргинин (арг) | ЦГУ | ЦГЦ | ЦГА | ЦГГ | АГА | АГГ |
Глицин (гли) | ГГУ | ГГЦ | ГГА | ГГГ | ||
«Охра» (терм) | УАА | |||||
«Амбер» (терм) | УАГ | |||||
«Опал» (терм) | УГА |
- Тексты задач (практических ситуаций) для самостоятельного решения при подготовке к итоговой аттестации (не более 2-х).
РАЗДЕЛ 6. Изменения в рабочей программе, которые произошли после
утверждения программы.
Характер изменений в программе | Номер и дата протокола заседания кафедры, на котором было принято данное решение | Подпись заведующего кафедрой, утверждающего внесенное изменение | Подпись декана факультета (проректора по учебной работе), утверждающего данное изменение |
РАЗДЕЛ 7. Учебные занятия по дисциплине ведут:
Ф. И.О., ученое звание и степень преподавателя | Учебный год | Факультет | Специальность |
2005/2006 | ЕГФ | Биология | |
2006/2007 | ЕГФ | Биология | |
2007/2008 | ЕГФ | Биология | |
, к. б.н. | 2009/2010 | ЕГФ | Биология-География |
, к. б.н. | 2010/2011 | ЕФКиБЖД | Биология |
, к. б.н. | 2011/2012 | ЕФКиБЖД | Биология-География |
, к. б.н. | 2012/2013 | ЕФКиБЖД | Биология |
|
Из за большого объема этот материал размещен на нескольких страницах:
1 2 3 4 5 6 7 8 |
