Первичная, вторичная и третичная структура транспортной РНК. Аминоацилирование тРНК. Этапы синтеза белка на рибосомах (инициация, элонгация, терминация). Инициация трансляции. Общие принципы, значение, основные этапы инициации. Инициация трансляции у прокариот и эукариот. Белковые факторы инициации. Элонгация трансляции. Поступление аминоацил-тРНК в рибосому. Транспептидация. Транслокация. Факторы элонгации. Терминация трансляции: терминирующие кодоны, белковые факторы терминации, гидролиз пептидил-тРНК.
Вопросы для самопроверки:
Этапы биосинтеза белка. Этапы инициации трансляции, ее особенности у прокариот и эукариот. Этапы элонгации трансляции. Особенности терминации трансляции.Литература:
, Севастьянова биология. – М.: ACADEMA, 2003. Молекулярная биология клетки / Б. Альбертс и др. — М.: Мир, 1994. — Т. 1-3. Молекулярная биология: Структура рибосом и биосинтез белка / Под ред. . — М.: Высшая школа, 1986.Лекция № 19. Биосинтез белка.
Регуляция трансляции. Трансмембранный перенос белков. Котрансляционные и посттрансляционные модификации белков. Бесклеточные системы трансляции. Понятие о белковой и ферментной инженерии.Вопросы для самопроверки:
Позитивная и негативная регуляция трансляции. Регуляция трансляции у бактериофагов. Регуляция трансляции рибосомных белков. Структура и механизм воздействия бактериальных токсинов на биосинтез белка. Бесклеточные системы трансляции и перспективы их использования для внеклеточного синтеза белков.Литература:
Лекция № 20. Межмолекулярные взаимодействия.
Белок-белковые взаимодействия и их значение для самосборки белков-мультимеров и надмолекулярных белковых структур. Белково-нуклеиновые взаимодействия в процессе регуляции активности генома, при самосборке субклеточных структур, вирусов и фагов. Белково-липидные взаимодействия и формирование биологических мембран. Липопротеины, их классификация и функции. Межклеточная химическая сигнализация и ее типы. Рецепторы пептидных гормонов и нейротрансмиттеров. Молекулярные аспекты взаимодействия различных видов животных, растений и микроорганизмов в экосистемах. Молекулярная биология развития.Вопросы для самопроверки:
Понятие о ключевых регуляторных белках у животных и человека (белки теплового шока и пр.). Белковые факторы транскрипции эукариот: особенности их структуры и взаимодействия с ДНК. Рецепторы гормонов, их типы и особенности узнавания ДНК.Литература:
, Севастьянова биология. – М.: ACADEMA, 2003. Корочкин гены контролируют развитие клеток // Соросовский образовательный журнал. 1996. № 1. С. 17-22. ДНК-липидные взаимодействия in vitro и in vivo // Успехи современной биологии. М. 2000. Т. 120. Вып. 5. С. 466-476. Спирин трансляции мРНК связывающими факторами у высших эукариот // Успехи биологической химии. М. 1996. Т. 36. С. 3-48.РАЗДЕЛ 4. Словарь терминов (Глоссарий).
Лекция № 1. История возникновения и развития молекулярной биологии.
Бактериофаги – вирусы бактерий.
Биоинформатика — наука, использующая средства информатики для решения различных биологических задач (статистический анализ нуклеотидных последовательностей ДНК, моделирование свёртывания белка, анализ его аминокислотной последовательности; предсказание функций по первичной структуре биополимеров; моделирование пространственной структуры биополимеров).
Геномика – наука, изучающая структуру геномов живых организмов.
Протеомика – наука, исследующая полные наборы белков, функционирующих на разных этапах развития организма.
Рентгеноструктурный анализ – анализ трехмерного расположения атомов в молекулах, основанный на дифракции рентгеновских лучей.
Лекция № 2. Методы молекулярной биологии.
Бесклеточные системы - многокомпонентные системы in vitro, используемые в биохимии для воспроизведения в пробирке всех этапов синтеза биополимеров.
Метод радиоавтографии - метод регистрации веществ, меченых изотопами.
Изоэлектрофокусирование – метод разделения белков в зависимости от их заряда в градиенте рН, создаваемом с помощью специальных реагентов (амфолинов).
Клеточная линия - культура однородных клеток, происходящих чаще всего от одной родительской пары клеток, и обладающих определенными и относительно постоянными свойствами и характеристиками.
Культура ткани, культура клеток - метод, позволяющий сохранять жизнеспособность клетки и выращивать клетки, ткани, небольшие органы (или их части) животного, включая человека, или растения вне организма на/в питательной среде.
Моноклональные антитела — антитела, вырабатываемые иммунными клетками, принадлежащими к одному клеточному клону, то есть произошедшими из одной плазматической клетки-предшественницы.
Ультрацентрифугирование - метод разделения и исследования высокомолекулярных соединений, вирусов и субклеточных частиц под действием центробежных сил.
Хроматография - физико-химический метод разделения и анализа смесей, основанный на распределении их компонентов между двумя фазами - неподвижной и подвижной (элюент), протекающей через неподвижную.
Электрофорез — разделение электрически заряженных полимеров в электрическом поле. Обычно ведется в гелях (гель-электрофорез), чтобы зоны разделяемых молекул не размывались тепловым движением.
Лекция № 3. Основы генетической инженерии.
Амплификация — искусственный специфический синтез большого числа копий небольшого фрагмента ДНК на базе ПЦР.
Библиотека генов — набор клонированных фрагментов ДНК, полностью перекрывающих исходную молекулу ДНК, выделенную из какого-либо специфического источника.
Блот-гибридизация по Саузерну — метод идентификации участков ДНК, содержащих комплементарные ДНК-зонду последовательности, среди электрофоретически разделенных фрагментов ДНК, фиксированных на твердом матриксе (нитроцеллюлозных или нейлоновых фильтрах).
Вектор (ДНК) — модифицированные плазмидные, фаговые, вирусные, дрожжевые или бактериальные ДНК, обеспечивающие проникновение экзогенной ДНК в клетки хозяина.
Вестерн-блот гибридизация (иммуноблот) — метод идентификации с помощью меченых антител электрофоретически разделенных антигенов, фиксированных на твердом матриксе (нитроцеллюлоз-ных или нейлоновых фильтрах).
Геномная ДНК — тотальная ДНК, выделенная из любого биологического источника.
ДНК-зонд—любая однонитевая ДНК ограниченного размера, используемая для поиска комплементарных последовательностей в молекуле большего размера или среди пула разнообразных молекул ДНК.
ДНК-экспрессионные системы — клеточные культуры (бактериальные, дрожжевые или эукариотические), синтезирующие чужеродные белки.
Клонирование — встраивание чужеродной ДНК в векторную молекулу ДНК или РНК и введение этой конструкции в фаговые, бактериальные или эукариотические клетки хозяина.
Комплементарная ДНК (кДНК) — однонитевая ДНК, образующаяся при обратной транскрипции мРНК.
Липкие концы — комплементарные однонитевые участки ДНК, расположенные на концах молекул ДНК.
Нозерн-блот гибридизация — метод идентификации молекул РНК, содержащих комплементарные ДНК-зонду последовательности, среди электрофоретически разделенных РНК, фиксированных на твердом матриксе (нитроцеллюлозных или нейлоновых фильтрах).
Нуклеазы — общее название ферментов, расщепляющих молекулы нуклеиновых кислот.
Плазмиды — небольшие кольцевые двухцепочечные молекулы ДНК, способные к автономной репликации, которые могут присутствовать в различном числе копий в бактериальных клетках; часто используются в качестве векторных молекул.
Полимеразная цепная реакция (ПЦР), или специфическая амплификация ДНК — избирательный синтез in vitro большого числа копий (порядка миллиона) небольшого фрагмента ДНК размером обычно от 50 до нескольких тысяч нуклеотидов по матричной молекуле ДНК.
Рекомбинантная ДНК - химерные молекулы ДНК, составленные из фрагментов разного происхождения.
Рестриктаза (эндонуклеаза) — фермент бактериального происхождения, разрезающий на фрагменты двунитевую молекулу ДНК в местах, соответствующих специфической последовательности из 4-12 нуклеотидов.
Рестрикты — фрагменты ДНК, образовавшиеся после её гидролиза рестриктазой.
Рестрикционная карта — схема молекулы ДНК, на которой указаны места разрезания её различными рестриктазами.
Рестрикционный анализ — метод молекулярной диагностики мутаций, случайным образом затрагивающих сайты рестрикции.
Сайт — определенное место в молекуле ДНК.
Сайт рестрикции — специфическая последовательность из 4-12 нуклеотидов, узнаваемая эндонуклеазой; место взаимодействия рестриктазы с ДНК.
Секвенирование — определение нуклеотидной последовательности молекулы ДНК.
Лекция № 4, 5. Нуклеиновые кислоты.
Азотистое основание – гетероциклическая азотсодержащая молекула, входящая в состав ДНК и РНК. Наибольшее распространение имеют 5 оснований: пуриновые - аденин (A), гуанин (G) и пиримидиновые – цитозин (C), тимин (T) и урацил (U). Тимин специфичен для ДНК, а урацил – для РНК.
Гибридизация — отжиг денатурированных нуклеиновых кислот различного происхождения с образованием ДНК/РНК - или ДНК/ДНК-гибридов.
Дезоксирибонукпеиновая кислота (ДНК) — вещество наследственности; единственный тип молекул, способных к самовоспроизводству и кодированию генетической информации; нитевидная молекула, в которой остов из чередующихся остатков дезоксирибозы и фосфорной кислоты ковалентно соединен с 4 азотистыми основаниями, расположенными в варьирующем порядке: аденином, тимином, гуанином и цитозином; может существовать как в однонитевой, так и в двунитевой форме за счет образования водородных связей между комплементарными парами оснований по правилу А-Т, Г-Ц.
Денатурация ДНК (плавление ДНК) – переход ДНК из двухнитевой формы в однонитевую при разрыве водородных связей между комплементарными парами оснований под воздействием высоких температур.
|
Из за большого объема этот материал размещен на нескольких страницах:
1 2 3 4 5 6 7 8 |
