Распознавание генов (стр. 5 )

Задание №3: изучить альтернативный сплайсинг с помощью программы BLAT (по базе Human Genome Browser (HGB) и привести его пример.

Результат №3:

Выдача программы BLAT:

BLAT Search Results

ACTIONS QUERY SCORE START END QSIZE IDENTITY CHRO STRAND START END SPAN

browser details Cjachomolog_of=Hum:88% 0410

browser details Cjachomolog_of=Hum:81 8% 17 + 39686

browser details Cjachomolog_of=Hum:8 8% 17 + 19339

browser details Cjachomolog_of=Hum:8 8% X + 21295

browser details Cjachomolog_of=Hum:8 8% 0211840 39

browser details Cjachomolog_of=Hum:8 8% 7 + 99793

Была выбрана первая находка, потому что она имеет хоть и не максимальное процентное сходство, но оно всё же велико, а длина у этого фрагмента самая большая.

Выдача программы после нажатия кнопки browser:

Абсолютно произвольно были выбраны две мРНК (на картинке-скриншоте – см. выше – эти выбранные мРНК обведены в красный кружочек) и исследованы на предмет того, какой сплайсинг мы имеем.

Описание этих мРНК:

Параметры	AL713798	AB209783
описание	Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp667F1810 (from clone DKFZp667F1810).	Homo sapiens mRNA for Fas-activated serine/threonine kinase isoform 1 variant protein.
ген	DKFZp667F1810	неопр.
организм	Homo sapiens	Homo sapiens
ткань	Лимфатический узел	мозговая
посл-сть мРНК	AL713798	EU176446
позиции	chr7:	chr7:

AL713798	AB209783
1-1655	1-100, 101-523, 524-622, 627-762, 763-976, ,

Здесь представлен альтернативный сплайсинг с кассетными экзонами (опираясь на картинку).

Side by Side Alignment tcatttcgcgggtgaggagacttagagagacgaagccacttgtccaaggt <<<<<<<<< ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| <<<<<<<<< tcatttcacgggtgaggagacttagagagacgaagccacttgtccaaggt cacgccgctggtgggtgggagcgcccagcatggagcccagcaccgtccag <<<<<<<<< ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| <<<<<<<<< cacgccgctggtgagtgggagcgcccagcatggaacccagcaccgtccag ccgcggagcccgcgttccaccctctgtgccgccgccgcctcctgtgggag <<<<<<<<< |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| <<<<<<<<< ccgcggagcccgcgttccaccctctgtgccgccgccgcctcctgtgggag agggaggtggtcgggagagtgcacgccggtgccgcctgggctccaggctg <<<<<<<<< |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| <<<<<<<<< agggaggtggtcgggagagtgcacgccggtgccgcctgggctccagactg ggcgcgaccactaacccggttaatgacctcgggcttaacttaaccccttc <<<<<<<<< |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| <<<<<<<<< ggcgcgaccactaacccggttaatgacctcgggcttaacttaaccccttc gctgctctgggcctgcgtttctccaccggtgaaatgaggtaatgccagcc <<<<<<<<< |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| <<<<<<<<< gctgctctgggcctgcgtttctccaccggtgaaatgaggtaatgccagcc ctgcctactcttcatgggcgtgtaaggagcatcagagatggtgcatgtgg <<<<<<<<< |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| <<<<<<<<< ctgcctactcttcatgggcgtgtaaggagcatcagagatggtgcatgtgg aattgctttgcaagtagtgctgcgctgagcgcactgaggattatgattgc <<<<<<<<< |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| <<<<<<<<< aattgctttgcaagtagtgctgcgctgagcgcactgaggattatgattgc tgtttcaaaggcgtggaaggaggcagaggggcggggtggggaagaggccc <<<<<<<<< |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| <<<<<<<<< tgtttcaaaggcgtggaaggaggcagaggggcggggtggggaagaggccc agagcagtcacaaaggcttgctctgaccacaggccccctaaatgaggagt <<<<<<<<< |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| <<<<<<<<< agagcagtcacaaaggcttgctctgaccacaggccccctaaatgaggagt gaggtaagcagtaggtagcaggtctttctcccctttggagaaaacctcac <<<<<<<<< |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| <<<<<<<<< gaggtaagcagtaggtagcaggtctttctcccctttggagaaaacctcac ccccttttttgggctgcccctcagggtctccatcacccaactccatgctt <<<<<<<<< |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| <<<<<<<<< ccccttttttgggctgcccctcagggtctccatcacccaactccatgctt cgagtcctgctctctgctcagacctcccctgctcggctgtctggcctgct <<<<<<<<< |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| <<<<<<<<< cgagtcctgctctctgctcagacctcccctgctcggctgtctggcctgct gctgatccctccagtacagccctgctgtttggggcccagcaaatgggggg <<<<<<<<< |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| <<<<<<<<< gctgatccctccagtacagccctgctgtttggggcccagcaaatgggggg accggcctgttggaggaggccccagtgcaggtcctgtgcaaggactgcag <<<<<<<<< |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| <<<<<<<<< accggcctgttggaggaggccccagtgcaggtcctgtgcaaggactgcag cggcttctggaacaggcgaagagccctggggagctgctgcgctggctggg <<<<<<<<< |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| <<<<<<<<< cggcttctggaacaggcgaagagccctggggagctgctgcgctggctggg ccagaaccccagcaaggtgcgcgcccaccactactcggtggcgcttcgtc <<<<<<<<< |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| <<<<<<<<< ccagaaccccagcaaggtgcgcgcccaccactactcggtggcgcttcgtc gtctgggccagctcttggggtctcggccacggccccctcctgtggagcag <<<<<<<<< |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| <<<<<<<<< gtctgggccagctcttggggtctcggccacggccccctcctgtggagcag gtcacactgcaggacttgagtcagctcatcatccgaaactgcccctcctt <<<<<<<<< |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| <<<<<<<<< gtcacactgcaggacttgagtcagctcatcatccgaaactgcccctcctt tgacattcacaccatccacgtgtgtctgcaccttgcagtcttacttggtg <<<<<<<<< |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| <<<<<<<<< tgacattcacaccatccacgtgtgtctgcaccttgcagtcttacttggtg aggaggggcttgaggtgggcgcctggggggctaggtgttaatgaagaata <<<<<<<<< |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| <<<<<<<<< aggaggggcttgaggtgggcgcctggggggctaggtgttaatgaagaata gggagaacagtagaggaccacggacagagacccagcctctcaggcgtttg <<<<<<<<< |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| <<<<<<<<< gggagaacagtagaggaccacggacagagacccagcctctcaggcgtttg cccaggaacgcttgctcctgctcccgtcctatgtctgcggcagacatcat <<<<<<<<< |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| <<<<<<<<< cccaggaacgcttgctcctgctcccgtcctatgtctgcggcagacatcat gagtcgaacgcactccttccggcctcgctagggtgccaccccagattcct <<<<<<<<< |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| <<<<<<<<< gagtcgaacgcactccttccggcctcgctagggtgccaccccagattcct gctaatagagtgccctaggaagccaccataatttgtcacaattggtatga <<<<<<<<< |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| <<<<<<<<< gctaatagagtgccctaggaagccaccataatttgtcacaattggtatga gatgaaagcctatttgccatctttgtatgtactccctacaaaccgtttcg <<<<<<<<< |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| <<<<<<<<< gatgaaagcctatttgccatctttgtatgtactccctacaaaccgtttcg atacctcatagccacatgatactttacatgtctctagtgtttgcacttaa <<<<<<<<< |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| <<<<<<<<< atacctcatagccacatgatactttacatgtctctagtgtttgcacttaa actctagcacaccttcccgctcaggaaacgggagaggagaaaggtggaga <<<<<<<<< |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| <<<<<<<<< actctagcacaccttcccgctcaggaaacgggagaggagaaaggtggaga attcaccaagtaaccccatgataagaacagcagcacagctctgttaccag <<<<<<<<< |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| <<<<<<<<< attcaccaagtaaccccatgataagaacagcagcacagctctgttaccag gctgccttttacctctccccctcaggctttccatctgatggtcccctggt <<<<<<<<< |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| <<<<<<<<< gctgccttttacctctccccctcaggctttccatctgatggtcccctggt gtgtgccctggaacaggagcgaaggctccgcctccctccgaagccacctc <<<<<<<<< |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| <<<<<<<<< gtgtgccctggaacaggagcgaaggctccgcctccctccgaagccacctc cccctttgcagccccttctccgaggtgggcaagggttggaagctgctcta <<<<<<<<< |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| <<<<<<<<< cccctttgcagccccttctccgaggtgggcaagggttggaagctgctcta agctgcccccgttttctgcggtatccacggcagcatctgatcagcagcct <<<<<<<<< |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| <<<<<<<<< agctgcccccgttttctgcggtatccacggcagcatctgatcagcagcct ggcag <<<<<<<<< ||||| <<<<<<<<< ggcag aggcaaggccagaggaactgactccccacgtgatggtgctcctggcccag <<<<<<<<< |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| <<<<<<<<< aggcaaggccagaggaactgactccccacgtgatggtgctcctggcccag cacctggcccggcaccggttgcgggagccccagcttctggaagccattgc <<<<<<<<< |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| <<<<<<<<< cacctggcccggcaccggttgcgggagccccagcttctggaagccattgc ccacttcctggtggttcaggaaacgcaactcagcagcaag <<<<<<<<< |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| <<<<<<<<< ccacttcctggtggttcaggaaacgcaactcagcagcaag gtggtacagaagttggtcctgccctttgggcgactgaactacctgcccct <<<<<<<<< |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| <<<<<<<<< gtggtacagaagttggtcctgccctttgggcgactgaactacctgcccct ggaacagcagtttatgccctgccttgagaggatcctggctcgggaagcag <<<<<<<<< |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| <<<<<<<<< ggaacagcagtttatgccctgccttgagaggatcctggctcgggaagcag gggtggcacccctggctacagtcaacatcttgatgtcactgtgccaactg <<<<<<<<< |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| <<<<<<<<< gggtggcacccctggctacagtcaacatcttgatgtcactgtgccaactg cggtgcctgcccttcagagccctgcactttgttttttcccctggcttcat <<<<<<<<< |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| <<<<<<<<< cggtgcctgcccttcagagccctgcactttgttttttcccctggcttcat caactacatcagtg <<<<<<<<< |||||||||||||| <<<<<<<<< caactacatcagtg gcacccctcatgctctgattgtgcgtcgctacctctccctgctggacacg <<<<<<<<< |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| <<<<<<<<< gcacccctcatgctctgattgtgcgtcgctacctctccctgctggacacg gccgtggagctggagctcccaggataccggggtccccgccttccccgaag <<<<<<<<< |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| <<<<<<<<< gccgtggagctggagctcccaggataccggggtccccgccttccccgaag gcagcaagtgcccatctttccccagcctctcatcaccgaccgtgcccgct <<<<<<<<< |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| <<<<<<<<< gcagcaagtgcccatctttccccagcctctcatcaccgaccgtgcccgct gcaagtacaggtggatggggcagcctggggcaaggggaggggccagcctg <<<<<<<<< |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| <<<<<<<<< gcaagtacaggtggatggggcagcctggggcaaggggaggggccagcctg ggaccagcagagtggaaaagccagagggaccatgaagcgccaaagctaag <<<<<<<<< |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| <<<<<<<<< ggaccagcagagtggaaaagccagagggaccatgaagcgccaaagctaag gagctctcggccaccataaaactgggccctgaagcagcagagggctttgc <<<<<<<<< |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| <<<<<<<<< gagctctcggccaccataaaactgggccctgaagcagcagagggctttgc ccagggtggtggcactagactgggacagattaggatgaggtgccgggccc <<<<<<<<< |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| <<<<<<<<< ccagggtggtggcactagactgggacagattaggatgaggtgccgggccc ttcctgctactggtgtcctttctcctcagtcacaaggacatagtagctga <<<<<<<<< |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| <<<<<<<<< ttcctgctactggtgtcctttctcctcagtcacaaggacatagtagctga ggggttgcgccagctgctgggggaggagaaataccgccaggacctgactg <<<<<<<<< |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| <<<<<<<<< ggggttgcgccagctgctgggggaggagaaataccgccaggacctgactg tgcctccaggctactgcacag <<<<<<<<< ||||||||||||||||||||| <<<<<<<<< tgcctccaggctactgcacag acttcctgctgtgcgccagcagctctggtgctgtgcttcccgtgaggacc <<<<<<<<< |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| <<<<<<<<< acttcctgctgtgcgccagcagctctggtgctgtgcttcccgtgaggacc caggaccccttcctgccatacccaccaaggtcctgcccacagggccaggc <<<<<<<<< |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| <<<<<<<<< caggaccccttcctgccatacccaccaaggtcctgcccacagggccaggc tgcctctagcgccactactcgagaccctgcccagaggtaaaggaggcagg <<<<<<<<< |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| <<<<<<<<< tgcctctagcgccactactcgagaccctgcccagaggtaaaggaggcagg gtgggggagccctggccaccttgcccgccatgccctgagccacgtccctc <<<<<<<<< |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| <<<<<<<<< gtgggggagccctggccaccttgcccgccatgccctgagccacgtccctc cccctgcagggtggtgctggtgttgcgggaacgctggcatttctgccggg <<<<<<<<< |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| <<<<<<<<< cccctgcagggtggtgctggtgttgcgggaacgctggcatttctgccggg acggccgggtgctgctgggctcgagggccctgagggagcggcacctaggc <<<<<<<<< |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| <<<<<<<<< acggccgggtgctgctgggctcgagggccctgagggagcggcacctaggc ctgatgggctaccagctcctgccg <<<<<<<<< |||||||||||||||||||||||| <<<<<<<<< ctgatgggctaccagctcctgccg ctacccttcgaggaactggagtcccagagaggcctgccccagctcaagag <<<<<<<<< |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| <<<<<<<<< ctacccttcgaggaactggagtcccagagaggcctgccccagctcaagag ctacctgaggcagaagctccaggccctgggcctgcgctgggggcctgaag <<<<<<<<< |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| <<<<<<<<< ctacctgaggcagaagctccaggccctgggcctgcgctgggggcctgaag ggggctgaggggttgatgtggggttcaggatggcccccccatggggggtg <<<<<<<<< |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| <<<<<<<<< ggggctgaggggttgatgtggggttcaggatggcccccccatggggggtg gatgatttgcactttggttccctgtgttttgatttctcattaaagttcct <<<<<<<<< |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| <<<<<<<<< gatgatttgcactttggttccctgtgttttgatttctcattaaagttcct ttccttc <<<<<<<<< ||||||| <<<<<<<<< ttccttc

Side by Side Alignment ggactcggtggctagccgatgaggaggccgcggggggaacccggcccccg <<<<<<<<< |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| <<<<<<<<< ggactcggtggctagccgatgaggaggccgcggggggaacccggcccccg ggccccgagaccgactgagggagcgacctgcgcagggcccggggagtcat <<<<<<<<< |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| <<<<<<<<< ggccccgagaccgactgagggagcgacctgcgcagggcccggggagtcat ggtctccatcacccaactccatgcttcgagtcctgctctctgctcagacc <<<<<<<<< |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| <<<<<<<<< ggtctccatcacccaactccatgcttcgagtcctgctctctgctcagacc tcccctgctcggctgtctggcctgctgctgatccctccagtacagccctg <<<<<<<<< |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| <<<<<<<<< tcccctgctcggctgtctggcctgctgctgatccctccagtacagccctg ctgtttggggcccagcaaatggggggaccggcctgttggaggaggcccca <<<<<<<<< |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| <<<<<<<<< ctgtttggggcccagcaaatggggggaccggcctgttggaggaggcccca gtgcaggtcctgtgcaaggactgcagcggcttctggaacaggcgaagagc <<<<<<<<< |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| <<<<<<<<< gtgcaggtcctgtgcaaggactgcagcggcttctggaacaggcgaagagc cctggggagctgctgcgctggctgggccagaaccccagcaaggtgcgcgc <<<<<<<<< |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| <<<<<<<<< cctggggagctgctgcgctggctgggccagaaccccagcaaggtgcgcgc ccaccactactcggtggcgcttcgtcgtctgggccagctcttggggtctc <<<<<<<<< |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| <<<<<<<<< ccaccactactcggtggcgcttcgtcgtctgggccagctcttggggtctc ggccacggccccctcctgtggagcaggtcacactgcaggacttgagtcag <<<<<<<<< |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| <<<<<<<<< ggccacggccccctcctgtggagcaggtcacactgcaggacttgagtcag ctcatcatccgaaactgcccctcctttgacattcacaccatccacgtgtg <<<<<<<<< |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| <<<<<<<<< ctcatcatccgaaactgcccctcctttgacattcacaccatccacgtgtg tctgcaccttgcagtcttacttg <<<<<<<<< ||||||||||||||||||||||| <<<<<<<<< tctgcaccttgcagtcttacttg gctttccatctgatggtcccctggtgtgtgccctggaacaggagcgaagg <<<<<<<<< |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| <<<<<<<<< gctttccatctgatggtcccctggtgtgtgccctggaacaggagcgaagg ctccgcctccctccgaagccacctccccctttgcagccccttctccgag <<<<<<<<< ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| <<<<<<<<< ctccgcctccctccgaagccacctccccctttgcagccccttctccgag aggcaaggccagaggaactgactccccacgtgatggtgctcctggcccag <<<<<<<<< |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| <<<<<<<<< aggcaaggccagaggaactgactccccacgtgatggtgctcctggcccag cacctggcccggcaccggttgcgggagccccagcttctggaagccattgc <<<<<<<<< |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| <<<<<<<<< cacctggcccggcaccggttgcgggagccccagcttctggaagccattgc ccacttcctggtggttcaggaaacgcaactcagcagcaag <<<<<<<<< |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| <<<<<<<<< ccacttcctggtggttcaggaaacgcaactcagcagcaag gtggtacagaagttggtcctgccctttgggcgactgaactacctgcccct <<<<<<<<< |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| <<<<<<<<< gtggtacagaagttggtcctgccctttgggcgactgaactacctgcccct ggaacagcagtttatgccctgccttgagaggatcctggctcgggaagcag <<<<<<<<< |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| <<<<<<<<< ggaacagcagtttatgccctgccttgagaggatcctggctcgggaagcag gggtggcacccctggctacagtcaacatcttgatgtcactgtgccaactg <<<<<<<<< |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| <<<<<<<<< gggtggcacccctggctacagtcaacatcttgatgtcactgtgccaactg cggtgcctgcccttcagagccctgcactttgttttttcccctggcttcat <<<<<<<<< |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| <<<<<<<<< cggtgcctgcccttcagagccctgcactttgttttttcccctggcttcat caactacatcagtg <<<<<<<<< |||||||||||||| <<<<<<<<< caactacatcagtg gcacccctcatgctctgattgtgcgtcgctacctctccctgctggacacg <<<<<<<<< |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| <<<<<<<<< gcacccctcatgctctgattgtgcgtcgctacctctccctgctggacacg gccgtggagctggagctcccaggataccggggtccccgccttccccgaag <<<<<<<<< |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| <<<<<<<<< gccgtggagctggagctcccaggataccggggtccccgccttccccgaag gcagcaagtgcccatctttccccagcctctcatcaccgaccgtgcccgct <<<<<<<<< |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| <<<<<<<<< gcagcaagtgcccatctttccccagcctctcatcaccgaccgtgcccgct gcaagtacag <<<<<<<<< |||||||||| <<<<<<<<< gcaagtacag tcacaaggacatagtagctgaggggttgcgccagctgctgggggaggaga <<<<<<<<< |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| <<<<<<<<< tcacaaggacatagtagctgaggggttgcgccagctgctgggggaggaga aataccgccaggacctgactgtgcctccaggctactgcacag <<<<<<<<< |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| <<<<<<<<< aataccgccaggacctgactgtgcctccaggctactgcacag acttcctgctgtgcgccagcagctctggtgctgtgcttcccgtgaggacc <<<<<<<<< |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| <<<<<<<<< acttcctgctgtgcgccagcagctctggtgctgtgcttcccgtgaggacc caggaccccttcctgccatacccaccaaggtcctgcccacagggccaggc <<<<<<<<< |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| <<<<<<<<< caggaccccttcctgccatacccaccaaggtcctgcccacagggccaggc tgcctctagcgccactactcgagaccctgcccagag <<<<<<<<< |||||||||||||||||||||||||||||||||||| <<<<<<<<< tgcctctagcgccactactcgagaccctgcccagag ggtggtgctggtgttgcgggaacgctggcatttctgccgggacggccggg <<<<<<<<< |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| <<<<<<<<< ggtggtgctggtgttgcgggaacgctggcatttctgccgggacggccggg tgctgctgggctcgagggccctgagggagcggcacctaggcctgatgggc <<<<<<<<< |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| <<<<<<<<< tgctgctgggctcgagggccctgagggagcggcacctaggcctgatgggc taccagctcctgccg <<<<<<<<< ||||||||||||||| <<<<<<<<< taccagctcctgccg ctacccttcgaggaactggagtcccagagaggcctgccccagctcaagag <<<<<<<<< |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| <<<<<<<<< ctacccttcgaggaactggagtcccagagaggcctgccccagctcaagag ctacctgaggcagaagctccaggccctgggcctgcgctgggggcctgaag <<<<<<<<< |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| <<<<<<<<< ctacctgaggcagaagctccaggccctgggcctgcgctgggggcctgaag ggggctgaggggttgatgtggggttcaggatggcccccccatggggggtg <<<<<<<<< |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| <<<<<<<<< ggggctgaggggttgatgtggggttcaggatggcccccccatggggggtg gatgatttgcactttggttccctgtgttttgatttctcattaaagttcct <<<<<<<<< |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| <<<<<<<<< gatgatttgcactttggttccctgtgttttgatttctcattaaagttcct ttccttc <<<<<<<<< ||||||| <<<<<<<<< ttccttc