Таблица 5
Молекулярно-эпидемиологическая характеристика полирезистентных к антибиотикам штаммов S. pneumoniae (представлено 13 штаммов)
Серотип | Результаты MLST | Резистентность | Штаммы | ||||||||||
aroE | gdh | gki | recP | spi | xpt | dd1 | MLST тип | пен | эрит | клин | МИК (мг/мл) | ||
Штаммы, выделенные в 1 группе ( внебольничная пневмония) | |||||||||||||
23F | 1 | 5 | 4 | 12 | 5 | 3 | 8 | 423 | Ч | у | у | 0,5 | 22 |
6B | 20 | 28 | 1 | 1 | 15 | 14 | 14 | 315 | Ч | У | 0,2 | 20 | |
23F | 4 | 4 | 2 | 4 | 4 | 1 | 1 | 81 | Ч | уу | у | 0,2 | 5 |
23F | 7 | 5 | 1 | 1 | 13 | 31 | 14 | 440 | Ч | У | 0,2 | 23 | |
14 | 1 | 5 | 4 | 5 | 5 | 1 | 8 | 9 | Ч | уу | у | 0,3 | 1 |
н/т | 1 | 5 | 4 | 5 | 5 | 1 | 8 | 9 | у | У | у | 0,5 | 2 |
14 | 7 | 5 | 1 | 8 | 14 | 11 | 14 | 124 | у | уу | у | 0,2 | 8 |
Штаммы, выделенные в 1 группе ( ХОБЛ) | |||||||||||||
14 | 2 | 7 | 4 | 10 | 10 | 1 | 27 | 65 | у | у | у | 1 | 4 |
23F | 1 | 8 | 9 | 1 | 6 | 4 | 6 | 311 | уу | уу | 2 | 19 | |
18С | 7 | 2 | 1 | 1 | 10 | 1 | 21 | 113 | у | у | у | 1 | 7 |
23F | 7 | 13 | 8 | 1 | 10 | 6 | 37 | 272 | уу | у | 0,6 | 18 | |
Штаммы, выделенные в 3 групе (от носителей) | |||||||||||||
6В | 8 | 37 | 9 | 29 | 2 | 12 | 53 | 344 | уу | у | У | 0,02 | 4 |
6А | 2 | 13 | 9 | 1 | 6 | 19 | 14 | 490 | у | 0,04 | 5 |
* Жирным шрифтом указаны штаммы клона R6, ** серым цветом- клоны R6, Spain 23F
Основной характеристикой штаммов S. pneumoniae генотипа Spain23F является то, что независимо от географической области выделения, эти микроорганизмы являются полирезистентными прежде всего по отношению бета-лактамов и макролидов. Данный сиквенстип распространен в основном в южной части Европы и регионах Ближнего Востока. Среди штаммов, вызвавших у лиц молодого возраста обструктивный бронхит, методом мультилокусного сиквенстипирования было идентифицировано 2 различных сиквенстипа, при этом каждый из них был представлен 5 и 3 изолятами.
Рис.5. Результаты мультилокусного сиквенстипироания полирезистентных штаммов пневмококка, выделенных в 1, 2 и 3 группах (всего 13 штаммов).
( STP-обозначение штаммов, выделенных при пневмониях, STH - выделенных при бронхитах, STC - выделенных при носительстве).
Несмотря на небольшую выборку, штаммы, выделенные от носителей, оказались фенотипически неоднородными: 2 штамма были умеренно-устйочивы к пенициллину и 2 штаммы чувствительны. При этом, все 4 штамма были нечувствительными к эритромицину. В исследуемой группе При этом, оба штамма принадлежали к сиквенстипу, идентичному штамму R6, который является авирулентным штаммом, и может рассматриваться как условно-патогенная микрофлора.
Таким образом, в настоящее время мультилокусное сиквенстипирования является одним из наиболее точных и высокодискриминирующих методов для микробиологического мониторинга штаммов пневмококка, что позволяет провести типирование и дать прогноз относительно появления штаммов с новыми свойствами, которые в перспективе могут стать госпитальными изолятами и потребовать совершенно новых мероприятий в отношении эпидемиологического надзора.
ВЫВОДЫ
Ведущим возбудителем в этиологии внебольничных пневмоний у лиц молодого возраста является Streptococcus pneumoniae, который выделяется в качестве клинически значимого возбудителя как в монокультуре (41,3%), так и в ассоциациях (55%). В Дальневосточном регионе наблюдается высокий уровень заболеваемости внебольничными пневмониями среди лиц молодого возраста. Заболеваемость внебольничными пневмониями пневмококковой этиологии составляет 26% у лиц молодого возраста. Мониторинг антибиотикорезистентности штаммов пневмококка выявил высокий уровень чувствительности к бета-лактамам, цефалоспоринам, хлорамфениколу, клиндамицину и фторхинолонам нового поколения; отсутствие ванкомицинрезистентных штаммов; высокий уровень устойчивости к тетрациклину. Такая же тенденция выявлена и в популяции пневмококков, выделенных от здоровых носителей, свидетельствуя об единых процессах формирования устойчивости к антибактериальным химиопрепаратам. Выявлено увеличение количества поли - и перекрестнорезистентных штаммов, маркером которых были erm гены, а также высокие темпы формирования устойчивости к макролидам, опосредованное mef генами (М-фенотипом). Молекулярно-генетический мониторинг с применением мультилокусного сиквенстипирования позволил идентифицровать штаммы пневмококка клона Spain23F, наиболее частые в популяции штаммов, вызвавших внебольничную пневмонию у лиц молодого возраста, характеризующиеся полирезистентностью и повышенной активностью факторов патогенности, что свидетельствует о формировании эпидемического геноварианта.РЕКОМЕНДАЦИИ ДЛЯ ВНЕДРЕНИЯ В МЕДИЦИНСКУЮ НАУКУ
И ЗДРАВООХРАНЕНИЕ
мероприятий. Поскольку большинство множественно-устойчивых штаммов S. pneumoniae, циркулирующих на территории России, относятся к «вакцинным», антипневмококковую вакцинацию следует рассматривать как действенный и перспективный путь сдерживания распространения антибактериальной резистентности среди этих бактерий.
Список работ, опубликованных по теме диссертации
1) Скрыль, структура внебольничных пневмоний у лиц молодого возраста в закрытых коллективах/ , , // Вестник Российской академии медицинских наук.- 2012.- № 7.- С. 35-38.
2) Скрыль, -генетический мониторинг основных возбудителей внебольничных пневмоний/ , , // Вестник новых медицинских технологий.-2012-№4.-С.8-10.
3)Скрыль, аспекты заболеваемости внебольничными пневмониями у лиц молодого возраста/, ., // Журнал инфектологии,-2010. –Т. 2, №4-. C.95.
4)Скрыль, молекулярно-генетического мониторинга антибиотикорезистентности штаммов S. pmeunoniae, C. pneumoniae, M. pneumoniae, выделенных при внебольничных пневмониях у лиц молодого возраста/, , // Журнал инфектологии,- 2012.- Т.4, №3 (приложение)-С.77.
5)Skril, SV. Epidemiology of pneumococcal community-acquired pneumonias in different age groups on data of the Far East of Russia/ A. Martynova, E. Nosach, O. Chulakova, A. Pruschinskyi, S. Skril/ The Programm and Abstract Book of ISPPD-7 (Tel-Aviv, Israel, March 16-18, 2010)- P.44.
6)Скрыль, анализ заболеваемости внебольничными пневмониями у лиц молодого возраста/ А. Мартынова, Е. Носач, С. Скрыль// Тезисы Третьего съезда военных врачей медико-профилактического профиля Вооруженных Сил Российской Федерации «Достижения науки и практики в обеспечении санитарно-эпидемиологического благополучия Вооруженных Сил Российской Федерации»
(декабрь 2010, Санкт-Петербург)-С.67.
7)Скрыль, аспекты изучения этиологического спектра возбудителей внебольничных пневмоний у лиц молодого возраста./ , // Тезисы конференции «Инфекционная патология в Приморском крае», май 2010, Владивосток.- С.78-79.
8)Скрыль, особенности диагностики внебольничных пневмоний, вызванных атипичными возбудителями у лиц молодого возраста в закрытых коллективах/ , // Актуальные проблемы экспериментальной, профилактической и клинической медицины: тезисы докладов Х Тихоокеанской науч-практич конф студентов и молодых ученых с международным участием (21 апреля 2010.).- Владивосток: Медицина ДВ, 2010.-С.228.
9)Skryl, SV. Epidemiology aspects of community-acquired pneumonia morbidity in young adults/ SV Skryl, ES Nosuch, AV Martynova// Proceedings of the Asian Pacific Respirology Congress, 2010 (November, Manila, Phillipines).-P.45.
10)Skryl, SV. Etiology of community-acquired pneumoniae in young adults/SV Skryl, A. Martynova, E. Nosuch//The proceedings of the ISAAR 2011 Congress (October, 2011, Seoul, South Korea).-P.97.
11)Скрыль, С. В, Разработка метода идентификации и генотипирования микроорганизмов-возбудителей инфекций респираторного тракта/, , //Материалы всерос науч школы для молодежи «Перспективы развития инноваций в биологии»/ Дальневост. Федер. Ун-т.-Владивосток, 2010.С.70-72. Рус. Деп. В ВИНИТИ.
12)Скрыль, штаммов Streptococcus pneumoniae к антибактериальным химиопрепаратам, выделенных у лиц молодого возраста/ , , // Вестник РГМУ - 2012, Специальный выпуск №1- С. 323.
13)Скрыль, молекулярно-генетического мониторинга штаммов S. pneumoniae, выделенных у пожилых/ , , // Эпидемиология и вакцинопрофилактика.-2013-Т.70, №3.-С. 42-47.
14)Скрыль, спектр возбудителей внебольничных пневмоний у лиц молодого возраста/ , // Актуальные проблемы экспериментальной, профилактической и клинической медицины: тезисы докладов 12-й Тихоокеанской научно-практической конференции студентов и молодых ученых с международным участием ( 14-15 апреля 2011 гг)- Владивосток: Медицина ДВ, 2011. С.246
СКРЫЛЬ Сергей Владимирович
Микробиологические и молекулярно-генетические аспекты
диагностики внебольничных пневмоний пневмококковой
этиологии у лиц молодого возраста
Автореферат диссертации на соискание ученой степени
кандидата медицинских наук
Подписано в печать 03.10.2013. Формат 60х84/16.
Бумага писчая. Уч.- изд. л. 1,0. Тираж 100 экз. Заказ № 000
Отпечатано в типографии ООО "Литера V",
690091, 1В
e-mail: *****@***ru
|
Из за большого объема этот материал размещен на нескольких страницах:
1 2 3 4 |
