Валидация метода классической ПЦР для выявления возбудителя ожога плодовых культур Erwinia amylovora (Burrill) Winslow et al. в растительном экстракте (в соответствии со STЦGER ET AL., 2006) (стр. 4 )

Таблица 5

Результаты определения селективности метода классического ПЦР

для выявления возбудителя ожога плодовых культур Erwinia amylovora (Burrill) Winslow et al. в растительном экстракте

(в соответствии со Stцger et al., 2006)

Экстракт вегетативных частей	Серия	Концентрация возбудителя, КОЕ/мл
104	103	102
Результатсц	Результатвк	Результат	Результатсц	Результатвк	Результат	Результатсц	Результатвк	Результат
Груши	1	+	+	+	–	+	–	–	+	–
2	+	+	+	–	+	–	–	+	–
3	+	+	+	–	+	–	–	+	–
Яблони	1	+	+	+	+	+	+	+	+	+
2	+	+	+	+	+	+	+	+	+
3	+	+	+	+	+	+	­+	+	+
Боярышника	1	+	+	+	+	+	+	+	+	+
2	+	+	+	+	+	+	+	+	+
3	+	+	+	+	+	+	+	+	+
Кизильника	1	+	+	+	+	+	+	+	+	+
2	+	+	+	+	+	+	+	+	+
3	+	+	+	+	+	+	+	+	+
Рябины	1	+	+	+	+	+	+	+	+	+
2	+	+	+	+	+	+	+	+	+
3	+	+	+	+	+	+	+	+	+
Айвы	1	+	+	+	+	+	+	–	+	–
2	+	+	+	+	+	+	–	+	–
3	+	+	+	+	+	+	–	+	–
Аронии черноплодной	1	+	+	+	+	+	+	–	+	–
2	+	+	+	+	+	+	–	+	–
3	+	+	+	+	+	+	+	+	+
Малины	1	+	+	+	+	+	+	­+	+	+
2	+	+	+	+	+	+	+	+	+
3	+	+	+	+	+	+	+	+	+
Роз	1	+	+	+	+	+	+	+	+	+
2	+	+	+	+	+	+	+	+	+
3	+	+	+	+	+	+	+	+	+
Спиреи	1	+	+	+	+	+	+	+	+	+
2	+	+	+	+	+	+	+	+	+
3	+	+	+	+	+	+	–	+	–
Черемухи	1	+	+	+	+	+	+	–	+	–
2	+	+	+	+	+	+	–	+	–
3	+	+	+	+	+	+	–	+	–
Ирги	1	+	+	+	–	+	–	–	+	–
2	+	+	+	–	+	–	–	+	–
3	+	+	+	–	+	–	–	+	–
Лапчатки	1	+	+	+	+	+	+	+	+	+
2	+	+	+	+	+	+	+	+	+
3	+	+	+	+	+	+	+	+	+
Пузыреплодника	1	+	+	+	+	+	+	–	+	–
2	+	+	+	+	+	+	–	+	–
3	+	+	+	+	+	+	–	+	–
Земляники	1	+	+	+	+	+	+	+	+	+
2	+	+	+	+	+	+	+	+	+
3	+	+	+	+	+	+	+	+	+
Сливы	1	+	+	+	+	+	+	+	+	+
2	+	+	+	+	+	+	+	+	+
3	+	+	+	+	+	+	+	+	+
Вишни	1	+	+	+	+	+	+	+	+	+
2	+	+	+	+	+	+	–	+	–
3	+	+	+	+	+	+	+	+	+
Черешни	1	+	+	+	+	+	+	+	+	+
2	+	+	+	+	+	+	–	+	–
3	+	+	+	+	+	+	–	+	–
К - выделения	Ctспец	–
CtВК	+
Результат	–
К- чистая зона	Ctспец	–
CtВК	+
Результат	–

Как видно из проведенных опытов, состав суспензии в некоторых случаях влияет на прохождение реакции амплификации. Влияние растительного материала на результаты анализа образцов отмечено при тестировании экстрактов вегетативных частей груши, ирги. При концентрации возбудиКОЕ/мл ложноотрицательные результаты тестирования данных экстрактов получены в 100% случаев. Полученный результат, возможно, связан с веществами-ингибиторами, содержащимися в растительном соке. При тестировании остальных образцов при данной концентрации ни одного ложноотрицательного случая не зарегистрировано.