Таблица 1. Предлагаемые оригинальные праймеры для генотипирования штаммов Ch. trachomatis

Генотипы

Олигонуклеотидные праймеры

Размер продукта

Группа генотипов B (генотипы: B, Ba, D, Da, E, L1, L2, L2a)

BGr1 f 5'-GCTTAATCAATCTGGCTGTTGA-3'

BGr1 r 5'-TCCAGACTTGTGGATAGTAAAC-3'

191 п. н.

Группа генотипов С (генотипы: A, C, H, I, Ja, J, K и L3)

CGr f 5'-AACTAAGTGGGCTTATTAGGAA-3'

CGr r 5'-TCAAGTAGAGAGCTAGACCA-3'

107 п. н.

промежуточная группа (генотипы: F, G, Ga)

FI 5'-CTGGGATGGAACTGTATACA-3'

RI 5'-TACAACTCAGGGTAGGTCAA-3'

274 п. н.

Генотип C

Comp f 5'-AAGGAAGTGTGGGATCTGACG-3'

Comp r 5'-AAATATACAATGATTAGCACC-3'

221 п. н.

Генотип Е

Eomp f 5'-AGACGGATACCGCCTTATCTTG-3'

Eomp r 5'-CTGGCTTGCCACTCAGGCTAAT-3'

265 п. н.

Генотип J

Jomp f 5'-ATATTTTGCCTAAGACTGCT-3'

Jomp r 5'-TTTAGGGTTAGATAGAGAAT-3'

152 п. н.

Генотип Ja

Jaomp f 5'-TAGTGTCGGCGACGTAGCAG-3'

Jaomp r 5'-TCCTAGATATTTAATGCCAT-3'

135 п. н.

Генотип H

Fh 5'-ATCTTCTGAGTATAATACAGC-3'

Rh 5'-ACGTTACGTTTAAATTGAGCA-3'

177 п. н.

Генотип F

Ff 5'-ACGAAACGTGCTGCAAATA-3'

Rf 5'- TAGCCAATCATTGTAAACA-3'

321 п. н.

Генотип D

Domp f 5'-ATAATGAGAATCTAAAGACG-3'

Domp r 5'-TAGAATGAGCATATTGGCAA-3'

174 п. н.

Генотип K

Komp f 5'-TGTTCTTAACACAGCTTTGGA-3'

Komp r 5'-AGGTATAGATTGAGCGTATTGG-3'

150 п. н.

Генотип G

Gomp f 5'-AGAGTAGTCGCAGCGAAC-3'

Gomp r 5'-ACTGTAACGGCGTATGTG-3'

146 п. н.

Генотип A

Aomp f 5'-AATACAGTATTCTGGCTTAGAT-3'

Aomp r 5'-TGACTGAATGCAGGGTTGGGA-3'

57 п. н.

Генотип B

Bomp f 5'-AGTTCGAGAGTATCTTTGATGTT-3'

Bomp r 5'-TCTGCGCTAGTTATCATTATCG-3'

75 п. н.

Ch. trachomatis осуществляли с помощью ПЦР, применяя специфические сконструированные оригинальные олигонуклеотидные праймеры, ориентированные к вариабельным участкам VS1–VS4 гена ompA Ch. trachomatis (табл. 1). Первоначально проводили амплификацию с использованием специфических праймеров к группам генотипов, далее с использованием специфических праймеров к определенному генотипу группы.

НЕ нашли? Не то? Что вы ищете?

Анализ антибиотикорезистентности штаммов Ch. trachomatis и Chl. pneumoniae проводили с помощью ПЦР с использованием подобранных оригинальных праймеров с целью выявления генов устойчивости к тетрациклинам (tet-M и tet-O) и макролидам (erm): Tet-f: 5'-AGYTTCCACCGAAYTCCTTTC-3' и Tet-r: 5'-ATACACCGAGCAGGGATTTC-3' (размер продукта амплификации 470 пар нуклеотидов); Erm-f: 5'-AAGCCAYTGCGTCTGACATC-3' и Erm-r: 5'-TGGCGTGTTTCATTGCTTGA-3' (размер продукта амплификации 300 пар нуклеотидов).

Программное обеспечение в молекулярно-генетическом исследовании. Конструирование олигонуклеотидных праймеров проводили с применением биоинформационного анализа комплексом компьютерных программ: Vector NTI Advance 9.0 (PC) (http://www. /site/us/en/home. html), DNASTAR, BLAST (http:// blast. ncbi. nlm. nih. gov/Blast. cgi/), и данные электронной базы NCBI Gen Bank (http://www. ncbi. nlm. nih. gov/Genbank/).

Цитологический метод (диагностика хламидиоза)

Забранный материал из Цк, Вл, Ур, задней стенки глотки в виде мазков-соскобов наносили на обезжиренные предметные стекла, высушивали на воздухе и фиксировали не менее 15-ти минут в 96º этиловом спирте для последующей окраски и микроскопии. Окраску мазков проводили по Романовскому-Гимзе и раствором Люголя, согласно общепринятой методике (, 2004). Учет результатов осуществляли на световом микроскопе «Микмед 5» при увеличениях ×100, ×400, ×1000. Проводили также окрашивание меченными моноклональными антителами (тест-система CeLLabs, Австралия) для выявления антигенов Ch. trachomatis и Chl. pneumoniae в реакции ПИФ (для Ch. trachomatis) и НИФ (для Chl. pneumoniae). Учет результатов осуществляли на люминесцентном микроскопе «Micros» (Австрия) при увеличении ×600. Хламидии в препаратах выявлялись в виде характерных цитоплазматических включений, окрашенных в соответствующий методу цвет. Мазки-соскобы также исследовали ПЦР-методом.

Серологический метод (диагностика хламидийной инфекции)

Выявление Ат к Ch. trachomatis осуществляли в сыворотке крови человека и обезьян с помощью ИФА ( и др., 2008; , 2002). Выявление Ат иммуноглобулинов (Ig) классов IgA и IgG к Ch. trachomatis проводилось на тест-системах Ch. trachomatis-IgA-pELISA medac и Ch. trachomatis-IgG-pELISA medac (Германия). Положительным результатом считали содержание IgA-Ат ≥1:50, IgG-Ат ≥1:50. Выявление Ат к белку теплового шока (БТШ) проводилось с использованием иммуноферментного тест-набора для определения IgG-Ат к хламидийным белкам теплового шока 60 cHSP60-IgG-ELISA medac (Германия). Положительный результат оценивался при содержании IgG-Ат ≥ 1:50. Постановку реакций проводили в соответствии с инструкциями по применению, прилагаемых производителем.

Культуральный метод (диагностика хламидиоза)

Соскобным материалом, полученным из УГТ, инокулировали суточную культуру клеток McCoy, выращенную на покровных стеклах, помещенных в лунки 24-луночных планшет (, 2002; , 2004). Центрифугирование после инокуляции проводили при 1000 об/мин в течение 1 часа. Контроль развития хламидийной инфекции осуществляли путем микроскопирования клеток в инвертированном микроскопе «ЛОМО» (Россия). Покровные стекла окрашивали по Романовскому-Гимзе, раствором Люголя или меченными моноклональными антителами для выявления антигенов хламидий в реакции ПИФ и непрямой иммунофлуресценции НИФ (тест-система CeLLabs, Австралия). Титрование хламидий осуществляли стандартным методом по цитопатическому действию (, 2008). Детекцию возбудителя в инфицированных клетках культуры проводили также с помощью ПЦР.

Иммунологические методы исследования

Забор ЦС проводили с помощью стерильного урологического зонда. Зонд немедленно погружали в пробирку типа «Эппендорф», содержащую 0,5 мл физиологического раствора. К каждому образцу после взвешивания добавляли равное весовое количество физиологического раствора, после чего смесь тщательно перемешивали в течение 10 минут на шейкере. Образцы хранили при температуре минус 50°С не более трёх месяцев. Определение общего белка проводили согласно инструкции к «Набору по определению общего белка в моче ФС» ("Диакон Диагностика", г. Москва).

Смыв со стенок влагалища проводили следующим образом: 5,0 мл 6,0% раствора полиглюкина вливали во влагалище, оставляли на 10 минут, затем проводили аспирацию всей жидкости из влагалища. Полученный секрет тщательно перемешивали и затем помещали в пробирки типа «Эппендорф». Образцы хранили при температуре минус 50 °С.

Определение иммуноглобулинов в ЦС и смыве из Вл женщин

Иммунологическое исследование включало определение концентрации в ЦС IgG, IgМ, IgА, sIgА и свободного sc методом радиальной иммунодиффузии РИД ( И др., 1987).

Определение цитокинов в ЦС женщин

Содержание в слизи Цк IL-1β, IL-4, IL-6, IL-8, IL-9, IL-10, IL-12, IFN-γ, TNF-α, ГМ-КСФ цитокинов оценивали методом проточной флюориметрии на двух лучевом лазерном автоматизированном анализаторе ("Bio-plex Protein Assay System", Bio-Rad, USA) с использованием коммерческих тест-систем 10-Plex (определяемый динамический диапазон 2-32000 пкг/мл) в соответствии с инструкцией фирмы-производителя.

Статистическая обработка полученных данных

Математическую обработку полученных данных проводили в рамках параметрической и непараметрической базовой статистики с использованием критерия Стьюдента, метода c2, коэффициента ранговой корреляции Спирмена (при rs ≥0,7 связь считали сильной; при 0,5≤rs<0,7 связь являлась средней; при rs <0,5 связь считали слабой; при rs=0 – линейная связь отсутствует), применяя стандартный пакет статистических программ Microsoft Excel 2007.

Морфологический, культуральный, серологический, микробиологический, иммуноцитологический, молекулярно-генетические методы исследования проводились на лабораторной базе ФГУН МНИИЭМ им. Роспотребнадзора. Молекулярно-генетическое типирование штаммов хламидий проводилось на базе Государственного научного центра прикладной микробиологии и биотехнологии (г. Оболенск, Московской области).

РЕЗУЛЬТАТЫ РАБОТЫ И ИХ ОБСУЖДЕНИЕ

Исследованием на наличие уреаплазм выявлен высокий титр возбудителя – > 104 КОЕ/мл – у 100% больных. Установлены у 6 больных уреаплазменная моноинфекция и у 44 больных – сочетанный характер инфицирования. При микст-инфекциях наблюдалось образование 2-7-компонентных ассоциаций патогенных агентов.

Таблица 2. Нарушение микробиоценоза влагалища в группе больных уреаплазмозом до лечения (50 пациенток)

Показатели

Степень нарушения микробиотопа влагалища

Промежуточный тип, n=5*

Дисбиоз, n=22**

Бактериальный вагинит, n=64***

Номера столбцов

1

2

3

4

Степень чистоты мазка:

II, n=5

III, n=22

III, n=5

IV, n=18

Морфология мазка:

обсеменённость эпителиоцитов

38,2+8,2

78,2+14,3

90,4+20,3

154,7+27,2

лейкоциты

16,2+2,4

34,6+4,2

39,8+7,2

52,6+7,4

ключевые клетки

0

3,2+0,3

5,2+1,3

5,8+0,6

Микрофлора, lgКОЕ/г:

лактобациллы

4,3+0,2/5,8+0,4

3,45+0,65/4,95+0,3

1,7+0,8 / 3,5+0,7

бифидобактерии

3,2+1,2/4,2+0,8

0/0

0/0

условно-патогенная:

факультативные анаэробы:

3,8+0,2/2,3+0,4

5,2+1,2/3,8+0,2

7,8+2,4 / 6,4+1,8

облигатные анаэробы:

3,2+0,6/4,5+0,4

4,2+0,6/5,8+1,6

6,2+1,4 / 8,2+1,2

Иммуноглобулины, мкг/мл:

IgM

6,8±0,5

19,6+1,4

32,3+9,6

IgG

38,1+2,7

65,5+12,3

234,38+32,7

IgА

6,7+0,3

12,3+2,7

24,6+4,2

sIgА

12,6+0,8

26,8+2,7

38,4+6,8

Sc

16,2+1,4

36,3+4,2

76,3+12,7

Примечания: в числителе показатели просветной микрофлоры, а в знаменателе – пристеночной; n – количество пациенток в группе, достоверность различий показателей в столбцах 1 и 2, 2 и 3 p<0,05, 1 и 3 - p<0,01.

Наиболее часто при уреаплазменной микст-инфекции выявлялись пептострептококки, стрептококки, энтерококки, стафилококки и грибы рода Candida – от 42% до 56% (табл. 2). Частота выявления b-гемолитических стрептококков составляла 4%, пептококков, пропионибактерий, коринебакте-рий, кишечной палочки, бактериодов и фузобактерий находилась в пределах 8-20%, гарднереллы выявлялись у 22% обследованных. Содержание лактобацилл у больных достоверно ниже по сравнению с промежуточным типом (II тип микробиоценоза) при дисбиозе (III тип) при р<0,05, вагините (IV тип) при р<0,01, а по сравнению с типом III при вагините при р<0,05. Содержание условно-патогенной флоры достоверно выше по сравнению с типом II при типе III (р<0,05) и типе IV (р<0,01), а по сравнению с типом III при типе IV (р<0,05). Содержание факультативных анаэробов достоверно выше в просветной области (p<0,05), а облигатных анаэробов достоверно выше в пристеночной области (p<0,05).

Таким образом, при дисбиотических нарушениях биотопа влагалища у больных с уреаплазмозом наблюдалось доминирование факультативно-анаэробной флоры в просветной области или облигатно-анаэробной флоры в пристеночной области влагалища при общем снижении уровня протективной флоры – лактобацилл по сравнению с нормоценозом.

При одинаковой степени воспалительного процесса, у больных выявлялись более выраженные изменения микроэкологии влагалищного биотопа по сравнению с контрольной группой. При бактериальном вагините у больных выявлялись 3-х и более компонентные ассоциации УПМ. Ассоциации, вызывающие выраженные дисбиотические нарущения влагалищного биотопа, были представлены энтеробактериями и энтерококками, стрептококками, стафилококками и грибами рода Candida, облигатно-анаэробными бактериями. Наблюдалось преобладание факультативных анаэробов в просветной области и облиганых анаэробов в пристеночной области влагалища.

Корреляционный анализ микробиологических и иммунологических показателей с учетом типа влагалищного микробиоценоза (табл. 3) у здоровых

Таблица 3. Корреляция микробиологических и иммунологических характеристик биотопа влагалища здоровых женщин и больных с уреаплазменной инфекцией при различных типах микробиоценоза

Показатели

Нормоценоз

Промежуточный тип

Дисбиоз

Вагинит

Содержание УПМ, lg КОЕ/г:

2,15±0,25/2,35±0,3

3,5±0,3/3,25±0,4

4,7±0,9/5,1±0,4

6,4±1,8/8,2±1,4

Содержание иммуноглобулинов, мкг/мл:

IgA

0

6,7±0,3

12,3±2,7

24,6±4,2

sIgA

6,3±0,4

12,6±0,8

26,8±2,7

38,4±6,8

IgM

0

6,8±0,5

19,6±1,4

32,3±9,6

IgG

7,6±0,8

38,1±2,7

65,5±12,3

234,38±32,7

Sc

8,2±0,6

16,2±1,4

36,3±4,2

76,3±12,7

Корреляция (r) содержания УПМ и изотипа иммуноглобулина:

r IgA

-

0,17/0,14

0,58/0,62

0,72/0,74

r sIgA

0,14/0,12

0,24/0,22

0,69/0,63

0,86/0,92

r IgM

-

0,23/0,21

0,74/0,76

0,78/0,82

r IgG

0,17/0,19

0,19/0,20

0,63/0,64

0,86/0,94

r sc

0,23/0,21

0,21/0,23

0,65/0,67

0,75/0,76

Примечания: – в числителе показатели просветной микрофлоры, а в знаменателе – пристеночной; -r - при p<0,05; УПМ – условно-патогенные микроорганизмы

Из за большого объема этот материал размещен на нескольких страницах:
1 2 3 4 5 6 7