Апробацию чувствительности системы видовой верификации хламидий и системы по обнаружению плазмиды проводили также на клиническом материале мазков-соскобов, полученных из уретры, цервикального канала, носоглотки у 15 человек. У 6 из 15 пациентов обнаружена DNA плазмидных штаммов Ch. trachomatis в соскобном материале из урогенитального тракта и у 1 пациента из носоглотки (табл. 10). Бесплазмидных штаммов не было обнаружено. У одного пациента из носоглотки системой видовой верификации обнаружена DNA Chl. pneumoniae. У 7 пациентов хламидии обнаружены не были.

Таким образом, предлагаемые ПЦР-тест-системы для детекции и дифферен-циации Сhl. pneumoniae и Ch. trachomatis позволяют одновременно не только верифицировать возбудителей у человека (в большем проценте случаев по

Таблица 10. Апробация предлагаемых ПЦР-тест-систем на клиническом материале

п/н

Место выделения

Система видовой верификации

Предложенная система для верификации плазмид

Ch. trachomatis

Chl. pneumoniae

1

цервикальный канал

+

-

+

2

цервикальный канал

-

-

-

3

цервикальный канал

+

-

+

4

цервикальный канал

+

-

+

5

цервикальный канал

-

-

-

6

цервикальный канал

-

-

-

7

цервикальный канал

+

-

+

8

уретра

+

-

+

9

уретра

+

-

+

10

уретра

-

-

-

11

уретра

-

-

-

12

уретра

-

-

-

13

уретра

-

-

-

14

носоглотка

-

+

-

15

носоглотка

+

-

+

Примечания: + - положительный результат; - – отрицательный результат.

НЕ нашли? Не то? Что вы ищете?

сравнению с коммерческими ПЦР-тест-системами), но и осуществлять дифферен-циацию хламидий, оценивать их вирулентность (плазмидные и бесплазмидные штаммы, характер включений) благодаря специально подобранным праймерам для мультиплексного видового обнаружения возбудителей. Предлагаемые ПЦР-тест-системы могут применяться для прямой диагностики хламидий Сhl. pneumoniae и Ch. trachomatis в образцах клинического материала и в культуре клеток (повышение диагностической значимости культурального метода).

Проведенное генетическое типирование штаммов Ch. trachomatis позволил сгруппировать их в 5 групп:

1- штаммы, наиболее близкие к штаммам генотипа К (46,2%);

2- штаммы, наиболее близкие к штаммам генотипа G (23,1%);

3- штаммы, наиболее близкие к штаммам генотипа Е (19,2%);

4- штаммы, наиболее близкие к штаммам генотипа F (7,7%);

5- штаммы, наиболее близкие к штаммам генотипа J (3,8%).

Генотипирование с использованием сконструированных олигонуклеотид-ных праймеров в реакции ПЦР осуществлялось в два этапа без привлечения ферментативных реакций в присутствии рестриктаз как в ПДРФ-анализе. Первоначально проводили ПЦР с использованием специфических праймеров к группам генотипов. Далее, при положительной ПЦР с праймерами одной из групп, проводили ПЦР с генотипоспецифичными праймерами, тем самым определяя генотип штамма Ch. trachomatis. Установлено, что у трех пациентов выявилось инфицирование урогенитального тракта сразу двумя генотипами. Причем, в ассоциации всегда присутствовал генотип К и все случаи заболевания носили острый характер. При установлении встречаемости различных генотипов, в зависимости от пола пациента, выявлена следующая картина: у мужчин – генотип G (14%), генотип E (21%), генотип J (7%), генотип F (14%), генотип K (44%); у женщин – генотип G (37,5%), генотип E (19%), генотип K (43,5%). Установлено, что генотип G у женщин встречается чаще, чем у мужчин, генотипы K и E - распределены в равных долях, а генотипы F и J встречались в нашем эксперименте исключительно у мужчин.

Анализ штаммов, выделенных от людей (табл. 11), на чувствительность к антибиотикам показал наличие tet-гена у 1 (3,8%) из 26 штаммов, erm-гена у 4 (15,4%). Одновременное наличие детерминант устойчивости к тетрациклинам и макролидам было выявлено у 3 штаммов (11,5%). Штаммы, выделенные от людей, являлись носителями криптической плазмиды, не зависимо от определяемого генотипа; выделен один бесплазмидный штамм. Анализ данных проведенных исследований в сопоставлении с полученными ранее результатами позволяет выявить зависимость между генотипом и клиническими проявлениями хламидийной инфекции, вызванной штаммом с конкретным генотипом. Анализ данных исследования штаммов Ch. trachomatis, выделенных от людей, не показал связи наличия генов устойчивости к тетрациклинам и макролидам в штаммах с клиническими проявлениями заболевания. При анализе данных частоты встречаемости определенных генотипов у пациентов с различной степенью проявления клинических симптомов инфекционного процесса показано, что у пациентов с ярко выраженной симптоматикой генотип F встречается в 6,0% случаев, генотип E - в 11%, генотип G - в 22%, генотип К - в 61%. У пациентов со стертой клинической картиной результаты были следующими: генотип F встречается в 12,5% случаев, генотип E - в 37,5%, генотип G - в 25%, генотип К - в 12,5%, генотип J - в 12,5%. При оценке значимости штаммов определённых генотипов для клинических проявлений инфекционного процесса с помощью χ2- критерия Пирсона показано, что генотипы G, J, E и F следует считать незначимыми(χ2 < χ2 05, р > 0,05); они с одинаковой частотой определяют выраженность клинической симптоматики (острая или стёртая форма). А генотип К - значим (χ2 > χ2 05, р < 0,05), чаще всего определяет острое течение инфекции. Наблюдается взаимозависимость клинических проявлений с генотипами штаммов, утративших свойство экспрессии гена incA (является одним из факторов вирулентности). Так, отсутствие экспрессии регистрировалось у генотипа E, полученного от людей с хроническим воспалительными заболеваниями носоглотки. В работах, посвященных исследованию взаимозависимости урогенитальных серовариантов (генотипов) Ch. trachomatis с выраженностью клинических проявлений инфекции, представлены противоречивые результаты, что можно объяснить частично географическими вариациями, а также различиями в объёме исследований и популяционном составе. Не исключено, что данные различия могут быть связаны с определенными штаммами, которые нельзя различить на уровне серовариантов. Геномные сравнения серотипов помогают осветить неясные факты. Установление циркуляции определенных генотипов у человека, а также изучение антибиотикорезистентности штаммов Ch. trachomatis позволяет установить связь между клиникой проявления хламидийной инфекции и генотипом, определить оптимальный алгоритм лечения заболеваний урогенитального тракта.

Таблица 11. Генотипы и гены устойчивости к антибиотикам у штаммов Ch. trachomatis.

п/п

Генотип Ch. trachomatis

Носительство плазмиды

Определение генов устойчивости к антибиотикам

Выраженность клинических проявлений

Tet*

Erm*

1

G

+

-

-

Острый уретрит, цервицит. Обильные выделения, жжение при мочеиспускании

2

E

+

-

+

Хронический уретрит. Дизурия.

3

G

+

-

+

Острый уретрит, цервицит. Обильные выделения, жжение при мочеиспускании

4

G

+

-

-

Острый цервицит. Обильные выделения.

5

G

+

-

-

Хронический уретрит. Дизурия.

6

F

+

-

-

Острый уретрит, цервицит. Обильные выделения, жжение при мочеиспускании

7

К

+

+

+

Острый уретрит, цервицит. Обильные выделения, жжение при мочеиспускании

8

G

+

+

-

Хронический цервицит.

9

К

+

-

+

Хронический цервицит.

10

G

+

-

-

Острый уретрит, жжение при мочеиспускании, выделения.

11

К

+

-

-

Острый уретрит, жжение при мочеиспускании, выделения.

12

F

+

-

-

Хронический уретрит. Дизурия.

13

J

+

-

-

Хронический уретрит. Дизурия.

14

E

+

+

+

Хронический цервицит.

15

К

+

+

+

Острый цервицит. Обильные выделения.

16

К

+

-

-

Острый уретрит, жжение при мочеиспускании, выделения.

17

К

+

-

-

Острый цервицит. Обильные выделения.

18

К

+

-

+

Острый цервицит. Обильные выделения.

19

К

+

-

-

Острый уретрит, жжение при мочеиспускании, выделения.

20

К

+

-

-

Острый цервицит. Обильные выделения.

21

К

+

-

-

Острый уретрит, жжение при мочеиспускании, выделения.

22

К

+

-

-

Острый уретрит, жжение при мочеиспускании, выделения.

23

К

+

-

-

Острый уретрит, жжение при мочеиспускании, выделения.

24

E

+

-

-

Хронический цервицит.

25

E

+

-

-

Острый уретрит, цервицит. Обильные выделения, жжение при мочеиспускании

26

E

+

-

-

Острый уретрит, цервицит. Обильные выделения, жжение при мочеиспускании

Примечания:+- положительный результат;- – отрицательный результат; Tet*- ген устойчивости к тетрациклинам; Erm*- ген устойчивости к макролидам.

Из за большого объема этот материал размещен на нескольких страницах:
1 2 3 4 5 6 7